RefSeq | NC_019085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000095 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 2344 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.5166 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 2689..2043 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
ATCTATGCCTGTGTTTTTATACAGTAATGACGCCATGGTAAACCTTATGACGTTATGCGTCAAACCCGCCAGTATGACACCTGCAAATGCGTATTAGATCTGGTGTTTCTTCAGCAAGGCACGTAGCTGATGATAAGTCAGACCCAGTAATTCAGCGGCTTTTTTCTGGTTAAATTTAGCCTGCTGTAAGCTGGTTTGTAGAAAGTCTTTCTCTTGCTGCTGCTGGAATTCACGCAGATCCAGCGTTATAACGATGTGTATCCTATGTGCTCGGATTGGATAGATTTCCATTACGGTGAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTCTGTGGCGTCGTAATCTCTTGCTCTGTAAACGAAAAAACCGCCCTGCAAGGCGGTTTTTCGAAGGTTCTCAGAGCAGCAACTCTTTGAACCGTGGTAACTGGCTTACGAGGAGCGCAGTAACCAAATCTGTTCTTTCAGTTTAGCCTTAACAGGCGCATAACTTCAAGACTAACTCCTCTAAATCAGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTTCCGGGTTGGACTCAAGATGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCAGTCGGACTGAACGGGGGGTTCGTGCATACAGTCCATCCAGGAGCGAACTGCCTTCGCGGAACTGAGTGTCAGGCGTGGAATGAGATAAACGCGGCCATAACAGCGGAATGACACCGGTAAACCGAAAGGCAGGAATGCGGGGGAGCACGAGGGAGCCACCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTAAGCCGCATCGGGTTTCGCCACCACTGATTTGAGCGTCAGATTTCATGATGTTTGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGGCTTCGCCGCGGCCTTATCTCTTCCCTGTTAAGCTCCTTCCTGGTATCTCCCAGGAAATTTCCGCCCCGCCTGTAAGCCGGCACCGCTCGCCGCAGCCGAACGACCGAGCGCAGCGAGTCAGTGAGCGAGGAAGCGGAATATATCCTGTACTACATATCCTGCTGACGCGCTGGTGCCGCCTTTTTTCTCCTGCTACATGAAGCACTTCACTGATTTCCACATCCGTGCCAACATAGTCAGCCAGTATACACTCCGCTAGCGCTACGTGACTGGTTCAGGGCTGCGCCCCGAAACCCGCTAACAACCTCTCTGCTACTGGATATCACCCCATGCCATCTGAATATGATGAACAACGGGGTTCGACTGATACGCAGCTTCCCGGCGAATATGACCTTTTTGATTTAATGGCGAAGGTTACTGAAGAGATCCTGCATGCCCCTGTGGATTCTGGGCCGCCTGTCGGCCGGGAAGCGTTATAGCTTTTTCGCTTGCCCGCGTACGTGGTAATACGCCGGTATTACCTTTTATTTCTTTATTTTCATGTAATTACAGTGGGTTTTTAATACCTGGGTATTACTCGTGAAAACGAAACATTACTTTTTTTTCTTTTAATTCATGCAGTTGCGATGAAAATCGCGGCTGCGTTAGGTGTATGACCATTTTGAGGTTGAAAAATAATCAACCATGGCGGGTGATTTACGCAGGTTAAGGGGAGATCGTGACAAAAAAAAGCGTTCCTCACTGTATCGTTCATGCCTGCATGAACGGGTTATTCTTCCTGACTACAGAATTACATCGCTCCTTCAGTTCATACATCACTTTTACAACACTTTTACAACACTCCTTCGGCCTGTACATCACTTTTACAACACTTTTGCATCACTTTTACATCATTTATACATCACTTTTACATCATTCCTTCAGCTCATACGTCACTTTCATCCTCTGTGCCATTTGTACATCACCCCCTTCCTGAACGTGCTGACAGCGGGTTTTCCGGCTGCGCCGGCAACGCTTCACGGCCACGCAATAAATTGCGTCCCCGTTCACCGTTTTCGGATGGGAAGAACGCCGGAAACAGGACTTCCCCTGGCTGAATGGTGTGAATTTCCGCGCTATGCACTTGCGCGCATACTCATGCATGCCGTAAAAACAGAGCCTGCGCGTTTCTGGCGGGTTTTCGGGTGGTTTGTTGCCTGTTTTACCGGTTTCCCGTCAGAAACGCCCTCAGAGCCTCTCAGGCGGTGCACGCAAGGGATGTTATGTTTAATCGGTCTGACCGTCAGGTACAAAAAAAAGCCCTTAGGGGGCTTTTTTTTTGCTATGAGTTAGCCATATTTTCGTGCGAATTTTTCATCGGAATCGCATAGATAAATAATAAACTCAATAAACGCGATGATCGCGGGTATGAATGTCCAGCAAAAAATTAGATACAGGAACCCCTTAAAAGTAAATCGTCAAACGCATCTCCCGGTGTAAACGCTGAA
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AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif TACATCACTTTTACA
Motif GAATGNGATGAACGCSGG
Motif CGBGCTGHMAGSBGGTTTBTHGVMTGY
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The result of BLAST |
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