RefSeq | NZ_CP023675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00001011 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1124 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.5979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 41742..42865 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TGTTTATTCCTTAGAACAACCATTCATACACAGAGTATTCTAAAAGGTGGATTATGTAAAGTGGATTTATCCACCTTTATGATTCCACCTTTAAACAAGATATATATCTGCTCTTAGCAGAATATAATCACCTTAATTATCAATATATTATACAGATCAAAACAACGGCACAGCCGTCCACCTTTCACAATTCAGAAAACTCAATTCAAACGGCATACCCATCCACCTTTCGATAAAAAAGCGCCAAGCGCACAAAAAATAGGCGTATGGTTATTTTTCAAATAGTTACGTAGCATGTAACCATGACAACAGTTTGATCTCATTATGAGATCGATATGACGGCAACACCTGACGGCATAGTCATCCACCTTTCACGGCATAGCCATCCACCTTTCGCGGCATAGTCATCCACCTTTCGCGGCATAGCCATCCACCTTTCGCGGCATAGCCATCCACCTTTCACGGCATAGCCATCCACCTTTCACGTGAGCATCATGTGAAAAATTACGCATAATTTACTGAAAATAAAAGATAAAAAACATTGGCATTAATTTTGCAAAAGTATTTTAAGTTTCTAAGATCTTAAAGTAGATCTAAAGATCTACATTTAAGATCTAAAGTTTAATAAGTGTTAGAAGCAAAAAATCACAAAAAATCTGTGGATAACTCAGCCGAAAATTACGCATTCACAATTTCTGTGGATAACTCGTTTTGTTAGCAGAGGACAGATCACTTTGAACCAGAACAGCAGCACTTGAAAACGATGTGCTTATTTTTCAACCACTGCGCGTAAGTGCCTGATGTTAACCCGCCGCAATTCCGCTTCCTCGCTCACTAACTCGCTACGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTGTCTCCTTTCTCAAAATCTAAAGAAGTCAGATCATACGATCCGTTGATTGATCCTTTTTGGATCTTTCACTGAGAAGCCCTGAATCGCTTTCTGCCGCTTCGTTCGATAAGACCATGAGGAAAACCATGCGAGATCGAAAAAATCACTCAGAATGCGATACAGCACGTTTTAGAGGGTATTCACAAAACAGTCGTTCCCTTGAGGAAATTTTGATCGAGCTTGAACTACTATCCGGATCATGACAACAGA
TGTTTATTCCTTAGAACAACCATTCATACACAGAGTATTCTAAAAGGTGGATTATGTAAAGTGGATTTATCCACCTTTATGATTCCACCTTTAAACAAGATATATATCTGCTCTTAGCAGAATATAATCACCTTAATTATCAATATATTATACAGATCAAAACAACGGCACAGCCGTCCACCTTTCACAATTCAGAAAACTCAATTCAAACGGCATACCCATCCACCTTTCGATAAAAAAGCGCCAAGCGCACAAAAAATAGGCGTATGGTTATTTTTCAAATAGTTACGTAGCATGTAACCATGACAACAGTTTGATCTCATTATGAGATCGATATGACGGCAACACCTGACGGCATAGTCATCCACCTTTCACGGCATAGCCATCCACCTTTCGCGGCATAGTCATCCACCTTTCGCGGCATAGCCATCCACCTTTCGCGGCATAGCCATCCACCTTTCACGGCATAGCCATCCACCTTTCACGTGAGCATCATGTGAAAAATTACGCATAATTTACTGAAAATAAAAGATAAAAAACATTGGCATTAATTTTGCAAAAGTATTTTAAGTTTCTAAGATCTTAAAGTAGATCTAAAGATCTACATTTAAGATCTAAAGTTTAATAAGTGTTAGAAGCAAAAAATCACAAAAAATCTGTGGATAACTCAGCCGAAAATTACGCATTCACAATTTCTGTGGATAACTCGTTTTGTTAGCAGAGGACAGATCACTTTGAACCAGAACAGCAGCACTTGAAAACGATGTGCTTATTTTTCAACCACTGCGCGTAAGTGCCTGATGTTAACCCGCCGCAATTCCGCTTCCTCGCTCACTAACTCGCTACGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTGTCTCCTTTCTCAAAATCTAAAGAAGTCAGATCATACGATCCGTTGATTGATCCTTTTTGGATCTTTCACTGAGAAGCCCTGAATCGCTTTCTGCCGCTTCGTTCGATAAGACCATGAGGAAAACCATGCGAGATCGAAAAAATCACTCAGAATGCGATACAGCACGTTTTAGAGGGTATTCACAAAACAGTCGTTCCCTTGAGGAAATTTTGATCGAGCTTGAACTACTATCCGGATCATGACAACAGA
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif CGGCATAGCCATCCACCTTTC
Motif ACGGCAYASYCRTCCACCTTTC
Motif TCBGCTKCBKCGHTCGVTAWSWCS
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The result of BLAST |
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