RefSeq | NC_016979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 949 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.4573 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 4850..551 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
CTTGTTGCGTTTGTCTGCCAGAGTAGCCTCCTGATAACACCGGGACGGGCGGGAAATGTTTCCCGGTCGGCACGGTGTTGGACAAGCCGCAGGCGCGTCAGTCGCTTTTAGCGGGTTTCGGGGCGCAGCCCTGAACCAGTCACGTAGCGCTAGCGGAGTGTATACTGGCTTATTATGTTGGCATGAGTGCGGTAATCAGGAAAGTGCTTCATGTGACAGAGGAAAATGCAGCTGCGGGCGTAAGGCAGAAAATGGAAGTTCAGAGGATATGACGCCTCCTCGCTCACTCAGTCGCTGCCGCTCCTGCCGTTCGGCTGCGGCGGGCGTTACCTGCACACGGAGAAGAGCGAAGGCATATGGCATGACAAACGGGGCAGAAAAAGGATGCGCCGCTGCCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCTGACAAGCATCACGAAATCTGACGCTCAAATCAGTGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGTGGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCTGCCTTTCGGTTTACCGGTGTCATTCCGCTGTTATGGCCGCGTTTGTCTCATTCCACGCCTGACACTCAGTTCCGGGTAGGCAGTTCGCTCCAAGCTGGACTGTATGCACGAACCCCCCGTTCAGTCCGACCGCTGCGCCTTCTCCGGTAACTATCATCTTGAGTCCAACCCGGAAAGACACGGTTCATCGCCACTGGCAGCAGCCATTGGTAACGGATTAGAGGAAGTGAGTCTTGAAGTTCTGCGCCAGTTAAGGCTAAACTGAAAGGACAATTTTTGGTGACTGCGCTCCCTCTAAGCCAGTTACCCGGTACATAAGTTGGTAGCTCATGTACCTTCCAAAAACCACCGTTGGTAGCGGTGGTTTTTATTTTTCATAGATTACAGCCTGTAATAAGCCATGGTCAATGGATTACT
CTTGTTGCGTTTGTCTGCCAGAGTAGCCTCCTGATAACACCGGGACGGGCGGGAAATGTTTCCCGGTCGGCACGGTGTTGGACAAGCCGCAGGCGCGTCAGTCGCTTTTAGCGGGTTTCGGGGCGCAGCCCTGAACCAGTCACGTAGCGCTAGCGGAGTGTATACTGGCTTATTATGTTGGCATGAGTGCGGTAATCAGGAAAGTGCTTCATGTGACAGAGGAAAATGCAGCTGCGGGCGTAAGGCAGAAAATGGAAGTTCAGAGGATATGACGCCTCCTCGCTCACTCAGTCGCTGCCGCTCCTGCCGTTCGGCTGCGGCGGGCGTTACCTGCACACGGAGAAGAGCGAAGGCATATGGCATGACAAACGGGGCAGAAAAAGGATGCGCCGCTGCCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCTGACAAGCATCACGAAATCTGACGCTCAAATCAGTGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGTGGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCTGCCTTTCGGTTTACCGGTGTCATTCCGCTGTTATGGCCGCGTTTGTCTCATTCCACGCCTGACACTCAGTTCCGGGTAGGCAGTTCGCTCCAAGCTGGACTGTATGCACGAACCCCCCGTTCAGTCCGACCGCTGCGCCTTCTCCGGTAACTATCATCTTGAGTCCAACCCGGAAAGACACGGTTCATCGCCACTGGCAGCAGCCATTGGTAACGGATTAGAGGAAGTGAGTCTTGAAGTTCTGCGCCAGTTAAGGCTAAACTGAAAGGACAATTTTTGGTGACTGCGCTCCCTCTAAGCCAGTTACCCGGTACATAAGTTGGTAGCTCATGTACCTTCCAAAAACCACCGTTGGTAGCGGTGGTTTTTATTTTTCATAGATTACAGCCTGTAATAAGCCATGGTCAATGGATTACT
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif GGCRGAAAATG
Motif ATKKDTAATGGATTA
Motif AAHCYGRMADGACAA
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|