RefSeq | NC_010378 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000031 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1233 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.5969 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 33658..34890 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
AAGCCCTCCGCTTGTCTCATTGGCATAATAGCATCTTTAAAAGCACTCTTAAAAGTGCTTATGTTGAGAAAAACATCAGAACAGGTGAGATATGGCTCTTTCCGACATCGCCTTAAAACGCTCTGTAACGCGTTCTGAGCGTTTTTTCCCGTTTCGTTGTAGTCAGCTACGGTTTAACGGTTTTTAACGCCGCTCAACGCTTTTTAGCGGCCTTGTTGCTGTGATCTGTTGCCATGATCCGGATAGGAGTTCAATCTTGATCAAAATTTCCTCAAGGCAACGACTGTTTTGTAAATACCCTCTAAAACGCGCTGTATCGCATTCTGAGCGATTTTTTCGATTTCGCATGGTTTCACCATGGTTGTATCGAACGAAGCGGCAGAAAGCGATTCAGGGCTTCTCAGTGAAAGATCCAAAAAGGATCAATCAACGGATCGTATGAGCTGAACTCTTCTGGTTTTGAGAAAGGAGACACCGCTCGCCGCAGCCGAACGACCGAGCGTAGCGAGTTAGTGAGCGAGGAAGCGGAATAGCACAGGGATTACATTAGGCACTTACGCACAGTGGTTAAAAAGTGAGCATATTGTTTTTATGTGTGGTTGTCTTGGTTCAGAGTGATCTGTCCTCCGGGTTTACGCAAAGTTATCCACAGGCGCTGTGAGTTTTTTGTTTTGAGCAGAGTTATCCACAGATTTTTTGTGTTTTTTTGCTTATTAAACTTCTTGTTTTTAAGATCTTAAATGTAGATCGGTAGATCTACTTTAAGATCTTTAACTTACTTTAACTTATTCTGCAAACATTGTGCCAGCTTTTTTATCAATAATTTCATTAAGATAGGTGTTGTTTTTTGTCGCCTCAAAATGAAAGGTGGATGGGTACGCACTGAAAGGTGGATAGGTACGCACTGTAATTTTCATGAAAGGTGGATGGCTGCGCACTGAAAGGTGGATGGGTACGCACTGAAAGGTGGATGGGTACGCATTTTTCTGTTTTTATTCAGATATTCGTATCTTTGTATCTTCATTTCTTTAGTTCTTTATAGTGCTCTAATTTAACGTATGACGTTAAAAGGTGGATACCTGCGCATTTCTATCATATTGAATATAAATGATAAAAATTCTTTCATGTGATCCGTGTTTTGGTGGAAATACATAAGGTGGATAAACCACTTTACATATTTCCGCCTTTGTGGTTATGATTTCACCATCAGAACTTAAAAACCACAGGTAATGT
AAGCCCTCCGCTTGTCTCATTGGCATAATAGCATCTTTAAAAGCACTCTTAAAAGTGCTTATGTTGAGAAAAACATCAGAACAGGTGAGATATGGCTCTTTCCGACATCGCCTTAAAACGCTCTGTAACGCGTTCTGAGCGTTTTTTCCCGTTTCGTTGTAGTCAGCTACGGTTTAACGGTTTTTAACGCCGCTCAACGCTTTTTAGCGGCCTTGTTGCTGTGATCTGTTGCCATGATCCGGATAGGAGTTCAATCTTGATCAAAATTTCCTCAAGGCAACGACTGTTTTGTAAATACCCTCTAAAACGCGCTGTATCGCATTCTGAGCGATTTTTTCGATTTCGCATGGTTTCACCATGGTTGTATCGAACGAAGCGGCAGAAAGCGATTCAGGGCTTCTCAGTGAAAGATCCAAAAAGGATCAATCAACGGATCGTATGAGCTGAACTCTTCTGGTTTTGAGAAAGGAGACACCGCTCGCCGCAGCCGAACGACCGAGCGTAGCGAGTTAGTGAGCGAGGAAGCGGAATAGCACAGGGATTACATTAGGCACTTACGCACAGTGGTTAAAAAGTGAGCATATTGTTTTTATGTGTGGTTGTCTTGGTTCAGAGTGATCTGTCCTCCGGGTTTACGCAAAGTTATCCACAGGCGCTGTGAGTTTTTTGTTTTGAGCAGAGTTATCCACAGATTTTTTGTGTTTTTTTGCTTATTAAACTTCTTGTTTTTAAGATCTTAAATGTAGATCGGTAGATCTACTTTAAGATCTTTAACTTACTTTAACTTATTCTGCAAACATTGTGCCAGCTTTTTTATCAATAATTTCATTAAGATAGGTGTTGTTTTTTGTCGCCTCAAAATGAAAGGTGGATGGGTACGCACTGAAAGGTGGATAGGTACGCACTGTAATTTTCATGAAAGGTGGATGGCTGCGCACTGAAAGGTGGATGGGTACGCACTGAAAGGTGGATGGGTACGCATTTTTCTGTTTTTATTCAGATATTCGTATCTTTGTATCTTCATTTCTTTAGTTCTTTATAGTGCTCTAATTTAACGTATGACGTTAAAAGGTGGATACCTGCGCATTTCTATCATATTGAATATAAATGATAAAAATTCTTTCATGTGATCCGTGTTTTGGTGGAAATACATAAGGTGGATAAACCACTTTACATATTTCCGCCTTTGTGGTTATGATTTCACCATCAGAACTTAAAAACCACAGGTAATGT
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif TGAAAGGTGGATGGGTACGCA
Motif AACGCTCTBTAHCGCVKHHYGASCGWTTTTWBCGRBTTHG
Motif SCACAG
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The result of BLAST |
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