RefSeq | NC_015472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1061 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.6107 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 1819..2879 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TATAGATAAGTCGTATCACTTGGCTAAATGATAACCCTATAAAGGTTGTATGACAACAACACATTACAACCTTTAGTTAAAAAACTTATCACCTTTAGATATAAAGATCTTTATGTATTCACATCAAAATGAATTCATAACATCATGTTTTACATGATATTTTTTTAGCCTGTGGATGTACTTAAAAATCCTCTCACCTTTCGTTAAAAATCCTCTCATCTTTAGTGAAAAATCTTCTCACCCTTACTTAAAAATCTTCTCACCTTATGTTAAAGATCCTCTCACCTTACGTTAAAAATCCTCTCATGTTTAGCGTTTTTTTATTATATTTATCATAATGTTACGACGCTCTAAGTTTTTAAGTTTTTAAGATCAAGAAGAAAAGATAAGTTTTTTAAATGCACAGCGCCTGTGGATAACTTTGCGTAAACCCGGAGGACAGATCACTCTGAACCAAGACAACCACACATAAAAACAATATGCTCATTTTTTAACCACTGTGCGTAAGTGCCTAATGTAATCCCTGTGCTATTCCGCTTCCTCGCTCACTAACTCGCTACGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTGTCTCCTTTCTCAAAACCAGAAGAGTTCAGCTCATACGATCCGTTGATTGATCCTTTTTGGATCTTTCACTGAGAAGCCCTGAATCGCTTTCTGCCGCTTCGTTCGATACAACCATGGTGAAAACATGCGAAATCGAAAAAATCGCTCAGAATGCGATACAGCGCGTTTTAGAGGGTATTTACAAAACAGTCGTTGCCTTGAGGAAATTTTGATCAAGATTGAACTCCTATCCGGATCATGGCAACAGATCACAGCAACAAGGCCGCTAAAAAGCGTTGAGCGGCGTTAAAAACCGTTAAACCGTAGCTGACTACAACGAAACGGGAAAAAACGCTCAGAACGCGTTACAGAGCGTTTTAAGGCGATGTCGGAAAGAGCCATATCTCACCTGTTCTGATGTTTTTCTCAACATAAGCACTTTTAAGAGTGCTTTTAAAGATGCTATTATGCCAATGAGACAAGCGGAGGGCTT
TATAGATAAGTCGTATCACTTGGCTAAATGATAACCCTATAAAGGTTGTATGACAACAACACATTACAACCTTTAGTTAAAAAACTTATCACCTTTAGATATAAAGATCTTTATGTATTCACATCAAAATGAATTCATAACATCATGTTTTACATGATATTTTTTTAGCCTGTGGATGTACTTAAAAATCCTCTCACCTTTCGTTAAAAATCCTCTCATCTTTAGTGAAAAATCTTCTCACCCTTACTTAAAAATCTTCTCACCTTATGTTAAAGATCCTCTCACCTTACGTTAAAAATCCTCTCATGTTTAGCGTTTTTTTATTATATTTATCATAATGTTACGACGCTCTAAGTTTTTAAGTTTTTAAGATCAAGAAGAAAAGATAAGTTTTTTAAATGCACAGCGCCTGTGGATAACTTTGCGTAAACCCGGAGGACAGATCACTCTGAACCAAGACAACCACACATAAAAACAATATGCTCATTTTTTAACCACTGTGCGTAAGTGCCTAATGTAATCCCTGTGCTATTCCGCTTCCTCGCTCACTAACTCGCTACGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTGTCTCCTTTCTCAAAACCAGAAGAGTTCAGCTCATACGATCCGTTGATTGATCCTTTTTGGATCTTTCACTGAGAAGCCCTGAATCGCTTTCTGCCGCTTCGTTCGATACAACCATGGTGAAAACATGCGAAATCGAAAAAATCGCTCAGAATGCGATACAGCGCGTTTTAGAGGGTATTTACAAAACAGTCGTTGCCTTGAGGAAATTTTGATCAAGATTGAACTCCTATCCGGATCATGGCAACAGATCACAGCAACAAGGCCGCTAAAAAGCGTTGAGCGGCGTTAAAAACCGTTAAACCGTAGCTGACTACAACGAAACGGGAAAAAACGCTCAGAACGCGTTACAGAGCGTTTTAAGGCGATGTCGGAAAGAGCCATATCTCACCTGTTCTGATGTTTTTCTCAACATAAGCACTTTTAAGAGTGCTTTTAAAGATGCTATTATGCCAATGAGACAAGCGGAGGGCTT
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif AAVATCYTCTCACCTTTMGTTAAAAATCYTCTCAYCTTTAG
Motif RCGAAVYCGVWAARADCSVTCDNDMNGCKDTACAGAGCGTT
Motif GCCTGTGG
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The result of BLAST |
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