RefSeq | NZ_CP024664 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00001057 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1038 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.6079 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 29442..30479 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
ACATTACCTGTGTTTTTTAAGTTCTGATGGTGAAATCATAACCACAAAAGCGGAAATGTGTAAAGTGGTTTATCCACCTTATAGATTTCCACCAAAACTCGGATCACATGAAAGAATTTTTATCATTTATATTCAATATGATAGAAATGCGCAGGCATCCACCTTTTAACGTCATACGTTAAATTAGAGCACTATAAAGAACTAAAGAAATGAAGATGCAAAGATACGAATATCTGAATAAAAACAGAAAAATGCGTACCCATCCACCTTTCAGTGCGTACCCATCCACCTTTCAGTGCGCAGCCATCCACCTTTCATGAAAATTACAGTGCGTATCCATCCACCTTTCAGTGCGTACCCATCCACCTTTCATTTTGAGGCGACAAAAAACAACACCTATCTTAATGAAATTATTGATAAATAACTTGGCACAATGTTTGCAAAATAAGTTAAAATAAGTTAAAGATCTTAAAGTAGATCTACCGATCTACATTTAAGATCTTAAAAACAAGAAGTTTAATAAGCAAAAAAACACAAAAAATCTGTGGATAACTCTGCTCAAAACAAAAAATTCACAGTGCCTGTGGATAACTTTGCGTAAACCCGGAGGACAGATCACGCTGAACCAGGACAACCACACATAAAAACAATATGCTCGCTTTTTAACCACTGTGCGTAAGTGCCTGATGTAATCCCTGTGCTATTCCGCTTCCTCGCTCACTAACTCGCTACGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTGTCTCCTTTCTCAAAACCAGAAGAGTTCAGATCATACGATCCGTTGATTGATCCTTTTTGGATCTTTCACTGAGAAGCCCTGAATCGCTTTCTGCCGCTTCGTTCGATACAACCATGGTTAAAAACCATGCGAAATCGAAAAAATCACTCAGAATGCGATACAGCGCGTTTTAGAGGGTATTTACAAAACAGTCGTTGCCTTGAGGAAATTTTGATCAAAATTGAACTTCTATCCGGATCATGGCAACAGATCACAGCAACAAGGCCGCTAAAAAGCG
ACATTACCTGTGTTTTTTAAGTTCTGATGGTGAAATCATAACCACAAAAGCGGAAATGTGTAAAGTGGTTTATCCACCTTATAGATTTCCACCAAAACTCGGATCACATGAAAGAATTTTTATCATTTATATTCAATATGATAGAAATGCGCAGGCATCCACCTTTTAACGTCATACGTTAAATTAGAGCACTATAAAGAACTAAAGAAATGAAGATGCAAAGATACGAATATCTGAATAAAAACAGAAAAATGCGTACCCATCCACCTTTCAGTGCGTACCCATCCACCTTTCAGTGCGCAGCCATCCACCTTTCATGAAAATTACAGTGCGTATCCATCCACCTTTCAGTGCGTACCCATCCACCTTTCATTTTGAGGCGACAAAAAACAACACCTATCTTAATGAAATTATTGATAAATAACTTGGCACAATGTTTGCAAAATAAGTTAAAATAAGTTAAAGATCTTAAAGTAGATCTACCGATCTACATTTAAGATCTTAAAAACAAGAAGTTTAATAAGCAAAAAAACACAAAAAATCTGTGGATAACTCTGCTCAAAACAAAAAATTCACAGTGCCTGTGGATAACTTTGCGTAAACCCGGAGGACAGATCACGCTGAACCAGGACAACCACACATAAAAACAATATGCTCGCTTTTTAACCACTGTGCGTAAGTGCCTGATGTAATCCCTGTGCTATTCCGCTTCCTCGCTCACTAACTCGCTACGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTGTCTCCTTTCTCAAAACCAGAAGAGTTCAGATCATACGATCCGTTGATTGATCCTTTTTGGATCTTTCACTGAGAAGCCCTGAATCGCTTTCTGCCGCTTCGTTCGATACAACCATGGTTAAAAACCATGCGAAATCGAAAAAATCACTCAGAATGCGATACAGCGCGTTTTAGAGGGTATTTACAAAACAGTCGTTGCCTTGAGGAAATTTTGATCAAAATTGAACTTCTATCCGGATCATGGCAACAGATCACAGCAACAAGGCCGCTAAAAAGCG
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif GTGCGTACCCATCCACCTTTC
Motif TGTKRAHAACTNTGCGHAA
Motif TTCNGCTBCBDCGHTCVVTWNMTCSHT
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The result of BLAST |
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