RefSeq | NZ_CP024054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00001020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1124 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.5979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 27051..28174 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TCTGTTGTCATGATCCGGATAGTAGTTCAAGCTCGATCAAAATTTCCTCAAGGGAACGACTGTTTTGTGAATACCCTCTAAAACGTGCTGTATCGCATTCTGAGTGATTTTTTCGATCTCGCATGGTTTTCCTCATGGTCTTATCGAACGAAGCGGCAGAAAGCGATTCAGGGCTTCTCAGTGAAAGATCCAAAAAGGATCAATCAACGGATCGTATGATCTGACTTCTTTAGATTTTGAGAAAGGAGACACCGCTCGCCGCAGCCGAACGACCGAGCGTAGCGAGTTAGTGAGCGAGGAAGCGGAATTGCGGCGGGTTAACATCAGGCACTTACGCGCAGTGGTTGAAAAATAAGCACATCGTTTTCAAGTGCTGCTGTTCTGGTTCAAAGTGATCTGTCCTCTGCTAACAAAACGAGTTATCCACAGAAATTGTGAATGCGTAATTTTCGGCTGAGTTATCCACAGATTTTTTGTGATTTTTTGCTTCTAACACTTATTAAACTTTAGATCTTAAATGTAGATCTTTAGATCTACTTTAAGATCTTAGAAACTTAAAATACTTTTGCAAAATTAATGCCAATGTTTTTTATCTTTTATTTTCAGTAAATTATGCGTAATTTTTCACATGATGCTCACGTGAAAGGTGGATGGCTATGCCGTGAAAGGTGGATGGCTATGCCGCGAAAGGTGGATGGCTATGCCGCGAAAGGTGGATGACTATGCCGCGAAAGGTGGATGGCTATGCCGTGAAAGGTGGATGACTATGCCGTCAGGTGTTGCCGTCATATCGATCTCATAATGAGATCAAACTGTTGTCATGGTTACATGCTACGTAACTATTTGAAAAATAACCATACGCCTATTTTTTGTGCGCTTGGCGCTTTTTTATCGAAAGGTGGATGGGTATGCCGTTTGAATTGAGTTTTCTGAATTGTGAAAGGTGGACGGCTGTGCCGTTGTTTTGATCTGTATAATATATTGATAATTAAGGTGATTATATTCTGCTAAGAGCAGATATATATCTTGTTTAAAGGTGGAATCATAAAGGTGGATAAATCCACTTTACATAATCCACCTTTTAGAATACTCTGTGTATGAATGGTTGTTCTAAGGAATAAACA
TCTGTTGTCATGATCCGGATAGTAGTTCAAGCTCGATCAAAATTTCCTCAAGGGAACGACTGTTTTGTGAATACCCTCTAAAACGTGCTGTATCGCATTCTGAGTGATTTTTTCGATCTCGCATGGTTTTCCTCATGGTCTTATCGAACGAAGCGGCAGAAAGCGATTCAGGGCTTCTCAGTGAAAGATCCAAAAAGGATCAATCAACGGATCGTATGATCTGACTTCTTTAGATTTTGAGAAAGGAGACACCGCTCGCCGCAGCCGAACGACCGAGCGTAGCGAGTTAGTGAGCGAGGAAGCGGAATTGCGGCGGGTTAACATCAGGCACTTACGCGCAGTGGTTGAAAAATAAGCACATCGTTTTCAAGTGCTGCTGTTCTGGTTCAAAGTGATCTGTCCTCTGCTAACAAAACGAGTTATCCACAGAAATTGTGAATGCGTAATTTTCGGCTGAGTTATCCACAGATTTTTTGTGATTTTTTGCTTCTAACACTTATTAAACTTTAGATCTTAAATGTAGATCTTTAGATCTACTTTAAGATCTTAGAAACTTAAAATACTTTTGCAAAATTAATGCCAATGTTTTTTATCTTTTATTTTCAGTAAATTATGCGTAATTTTTCACATGATGCTCACGTGAAAGGTGGATGGCTATGCCGTGAAAGGTGGATGGCTATGCCGCGAAAGGTGGATGGCTATGCCGCGAAAGGTGGATGACTATGCCGCGAAAGGTGGATGGCTATGCCGTGAAAGGTGGATGACTATGCCGTCAGGTGTTGCCGTCATATCGATCTCATAATGAGATCAAACTGTTGTCATGGTTACATGCTACGTAACTATTTGAAAAATAACCATACGCCTATTTTTTGTGCGCTTGGCGCTTTTTTATCGAAAGGTGGATGGGTATGCCGTTTGAATTGAGTTTTCTGAATTGTGAAAGGTGGACGGCTGTGCCGTTGTTTTGATCTGTATAATATATTGATAATTAAGGTGATTATATTCTGCTAAGAGCAGATATATATCTTGTTTAAAGGTGGAATCATAAAGGTGGATAAATCCACTTTACATAATCCACCTTTTAGAATACTCTGTGTATGAATGGTTGTTCTAAGGAATAAACA
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif GAAAGGTGGATGGCTATGCCG
Motif GAAAGGTGGAHGVSTDTGCCG
Motif ATCCAC
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The result of BLAST |
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