RefSeq | NC_015175 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000069 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 4082 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.5216 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 1028..5109 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TGCAGCGGCATGAAATGGCGGTGGCCGCCGAACGGGCATACGAGCAGCGACAGCACGAAAAAGAGCTTGCGGAAACCCGTTCCCGTCAGCGGAGCTATAACGGTCCGACGCTGGGCTGACTGAGCGCATCCAGTGACAACCCGCACGAAGAAGGGCTCATAAATTTCCCGCTAAATACGGTCGTGATGAAAACATCACGGCGTATACAACGGAGGGATTATGAGACTGTTTAACGTGATTGAGACGGTGCTGAACTGCCTGTACATGGCGCTGGAGATCTGGGACTGGCTGGAGAAGCATTTTCCTGTTTTTAAGGCGTTCATCCTGATTCTGGCCTGAAATCAGACCGTATGCATCTGGCTGCATGACCATGCAGCCGGGTAAAATTTATCTGTCACGAACGGGGCGGTGTATCGGGTGGTTTGTTGCCGGTTTTACCTGACTGCCGCCCCGTTTGTGGCGAACCTGTCCGGAGCGGTGCGGGCAAGGGATGTTATGGTAAATATCTTCGAGCTTCAGGTACAAAAAAAGCCCCGGAGGGCTCTCAATCATTTGATTCCGAAACGGTCACCTTTAGTGTCCGTTCTGACAATCAATTGCCATTTGATTGCTTGTAGCTGACTGTGCTGATGATGGTTTTGCGGCGGGAACGGGTCGCTGCCGTTACTGGTGATCTCTTTTCCGCAGACGGTACATCGATAAATTCCAGAATGGGGAACGCTGTCTCCTGGATTATATCGTGACTTCCACCATGTTTGATCGCTACTGACGCTTTGTAAAAACTTCTCTGTTTCGCTGGTATATGCAGCCATTTAGCTTTCCTTTTCTGAATTTATAGGGCAGAGATAGAAAAGCCGCCCGCAGGGGCGGCTTTTCGTTGCCAGTCTAAATATCAAGCATATTGGGTTAACATCCAGGTTACAGCCTTTCCTGCGTACGGAGGCATTACATTACCTTTTGCGTATCGGGGCTGTAGTGGAAGGGGTTCCTACGACTTTCCAGACACCACTTTCAGGACACTTTTGTCCGGTAGAAGCAGTAGTACCAATTGGTGCTTTAGACATGCTAATTCCTCTTTTTGTGTTTTGTCTGTATTGCTGCTTGTGTAGCGATACAGATGTTTAGTTTAGAAATTAGCTTTCAACAGGGAGGTGTTGTCATTTTCTCGAAATGTGATGCTGAACACCTTTTGTACAGTGATGTGTACGCTTTTGCTGTCGGAGTTTTTGGTTCGGTGATCGGGTGTCATGGTAAATAACACTTAATCATTACAACGTAGCCATTAAAGGTTGTGGCGAAGCCTTCTGTAAAAGGCCTAGCTCTTCTTTTTCCGCGTTCCTTCCGCTTGTTTCTTCTCTGGTAGAATGTGCGGATTCTGCCATCCGGATATTGAGGTTTTTTTCGTGAACATTGATGAAGTTGCTAAGTGGCGTCCTTTTACGGATCAGGATGGCAATATATGGGATTTGTCATTTCTTGATGCACATGAGGTTTCTTATACTCATTGTTCTCCTGGTAAACCTGACATTGTGTACAAGTTCACTGTTTCTTACTCATTTCATTGTTTTTGCAAGGATTATCCAGAGCAGACTGAGGAAGAAAAATTATCGTTGATGTATGATGCAGGCAAAGACTCGAGGCCATTTTGTAAGATCCGATATGCTCTTGCTCGAGATAAGCTGAGAGCTATCATTGAAGGATTGGGGAACGCGAAGGTTATCCATGCTGGCTATGGTAGTTATGCTGTTGTAGAGATTACGGTGAATGAAGGTGAAAGTGAGTTCTACTTTGTGCCTTTTAAGGTATATCGTGAGCGTAAAAAGCTAGCGCCTTCATGTAACAAGTGCTTATCCTGTCAATGAGAGACCGTCAGGTAAGCCTGTTAGCTTTTTCAAGATAGCTCACAATCTCCTGCGCGGGAAACCATTACCTAAACCCCATATGTAACAAAGCCCGCTTAGTTGCGGCTTCGCCAGAAATTTCTTCTGGTATTCAGAACACCTTTACCGGGCTTGGCCTCGACCAACATTGCTGTTGGTAGTGGGATGTCTGGTATTACCAGTCTGCTGCATCCTTGAAGCAATTGTAGGTAGAGTGATGTAGATTTGCAACCAACATTTTGGTTGAACCTATATACTAACTTTTCTCGATGCCTCCCCAATCCCTTGCTGTATCTGGCTTTCTTGAAATAGCCGACTAAAGAGCACCTAAAACCTAACTGTACATTCTGCCCCCTATATTGCTGGGCAGATACCCCAGCATATGTAAACCGGCGGCTGCAAATGTCCTGCCGGTGGGTTGTCTATATGCTGGCTGTCATGTGGTCTGTTTTAGGTATACTATCCAGAGTAAACACATAAATTTCATGGCAGGTATGCAGTGAGTAAGCAGGGGCAGAATCTACTCAATCTTACACAGGCTGCTGAGGCTGTAGGTATCACAAGAAAAACACTTTACTCCCATATTGATAAGGGGTTGGTAAGTGTTACCCGTCAGCAAGGTAAACGATATATCGATGTGTCCGAGCTAATCAGACATTACGGATCTGTATCCTTACCAGAGGGAAAAGTAAACGCCGTTACACGGTCACAAAATAAACATGATGACGATACAATCTTGGCTATGCAGCGGGAGCTGGTCCGAGCTTGAGGAAGCTCATCGAGAAGCAACAATTGTTGCTTGAGGATAAACAGGAGGCGGACCGGCTTCGGGAACAGGTGGTCGGGTTGCAAAATGAGCGTGACGCAACAGCTCAGAAACTGGAAAAAGTGAAAGCAGAGCTGGAAGCTACGCGGAATAATGGCTTTTGGAAACGCTTATTTGGTTGATGATATGACTATACAAAATTTTCGCATAGGCTTTGAACGCATCGTTTTTCTGGGATTGTTATTTTTTGTAGTTAACGCGGTGCTATTCTTTGGCATCACCCTTTTCGATCCTGAATGGAAAGCATGGCAGCGAGATTGGGCGCTTAAGTGCTTAATTATTTTCGCTGAAATAATGATCTCTAGTCAGGTTCTACTTTGGGTAGCTTATGGCTTTGCAGGGAAACCGTTTAAGCCTAACTTTAATCCGTTAACATATGTGCATCGGCTTTAATTAATTTGACGGCGTTGCTACACCGGTGCATTATCCCTGAAACGAAAAAACCACCCGGCAAGGTGGTTTTTCGAAGGTTCAGCAAACCGGCAAGTTTCTGAACCGTGGTAACAGTCTTGTGCGAGACGTGTCACCAAATACTGTCCTTCCAGTGTAGCCGCAGTCAGGCAACCACATCAAGAATCTTTTAACTGAGATTCTGTCGATACTACCTCGCACATTTCTGTTTACCGTATTGGCTGTTGCCATTAGCGGCACTTTGCCGTGTCTGTTGGGGTTGGAATCGTGAGAATAGTTACCCAGCAGGTGCAACGGTCGGACTGAACGGGGGGTTCGTGCATACAGTCCAGCTTGGAGCGAACTGCCTACCCGGAACTGAGTGTCAGGCGTGGAATGAGATAAACGCGGCCATAACAGCGGAATGACACCGGTAAACCGAAAGGCAGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCCATCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCACTGATTTGAGCGTCAGATTTCGTGATGCTTGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGGCAACTCCGCATCCTTTTTCCGGCCTTTCTTGACCTCAGCTTCATCTCGTTACCTCGTCATTCGTGAGCAGGTAACGCCCGCCGCAGCCGAACGGCCGGAGCGTAGCGACCGAGTGAGCGAGGAGGCGTCATATCTCCTGAACCGGCATTCAGCACTGACGCGTCTCAGCCGCATATTTTCTCCTGCTACATGAAGCACTTTCCTGATAACCGCACTCATGCCAACATAGTAAGCCAGTATACACTCCGCTAGCGCTACGTGACTGGTTCAGGGCTGCGCCCCGAAACCCGCTAAAAACCACTGACGCGCCTGCGGCTTGTCCAACACCGTGCCGACCGGGAAACATTTCCCGCCCGTCCCGGTGTTCTCAGGAGGCTACTCTGGCAGACAAACGCAACAAG
TGCAGCGGCATGAAATGGCGGTGGCCGCCGAACGGGCATACGAGCAGCGACAGCACGAAAAAGAGCTTGCGGAAACCCGTTCCCGTCAGCGGAGCTATAACGGTCCGACGCTGGGCTGACTGAGCGCATCCAGTGACAACCCGCACGAAGAAGGGCTCATAAATTTCCCGCTAAATACGGTCGTGATGAAAACATCACGGCGTATACAACGGAGGGATTATGAGACTGTTTAACGTGATTGAGACGGTGCTGAACTGCCTGTACATGGCGCTGGAGATCTGGGACTGGCTGGAGAAGCATTTTCCTGTTTTTAAGGCGTTCATCCTGATTCTGGCCTGAAATCAGACCGTATGCATCTGGCTGCATGACCATGCAGCCGGGTAAAATTTATCTGTCACGAACGGGGCGGTGTATCGGGTGGTTTGTTGCCGGTTTTACCTGACTGCCGCCCCGTTTGTGGCGAACCTGTCCGGAGCGGTGCGGGCAAGGGATGTTATGGTAAATATCTTCGAGCTTCAGGTACAAAAAAAGCCCCGGAGGGCTCTCAATCATTTGATTCCGAAACGGTCACCTTTAGTGTCCGTTCTGACAATCAATTGCCATTTGATTGCTTGTAGCTGACTGTGCTGATGATGGTTTTGCGGCGGGAACGGGTCGCTGCCGTTACTGGTGATCTCTTTTCCGCAGACGGTACATCGATAAATTCCAGAATGGGGAACGCTGTCTCCTGGATTATATCGTGACTTCCACCATGTTTGATCGCTACTGACGCTTTGTAAAAACTTCTCTGTTTCGCTGGTATATGCAGCCATTTAGCTTTCCTTTTCTGAATTTATAGGGCAGAGATAGAAAAGCCGCCCGCAGGGGCGGCTTTTCGTTGCCAGTCTAAATATCAAGCATATTGGGTTAACATCCAGGTTACAGCCTTTCCTGCGTACGGAGGCATTACATTACCTTTTGCGTATCGGGGCTGTAGTGGAAGGGGTTCCTACGACTTTCCAGACACCACTTTCAGGACACTTTTGTCCGGTAGAAGCAGTAGTACCAATTGGTGCTTTAGACATGCTAATTCCTCTTTTTGTGTTTTGTCTGTATTGCTGCTTGTGTAGCGATACAGATGTTTAGTTTAGAAATTAGCTTTCAACAGGGAGGTGTTGTCATTTTCTCGAAATGTGATGCTGAACACCTTTTGTACAGTGATGTGTACGCTTTTGCTGTCGGAGTTTTTGGTTCGGTGATCGGGTGTCATGGTAAATAACACTTAATCATTACAACGTAGCCATTAAAGGTTGTGGCGAAGCCTTCTGTAAAAGGCCTAGCTCTTCTTTTTCCGCGTTCCTTCCGCTTGTTTCTTCTCTGGTAGAATGTGCGGATTCTGCCATCCGGATATTGAGGTTTTTTTCGTGAACATTGATGAAGTTGCTAAGTGGCGTCCTTTTACGGATCAGGATGGCAATATATGGGATTTGTCATTTCTTGATGCACATGAGGTTTCTTATACTCATTGTTCTCCTGGTAAACCTGACATTGTGTACAAGTTCACTGTTTCTTACTCATTTCATTGTTTTTGCAAGGATTATCCAGAGCAGACTGAGGAAGAAAAATTATCGTTGATGTATGATGCAGGCAAAGACTCGAGGCCATTTTGTAAGATCCGATATGCTCTTGCTCGAGATAAGCTGAGAGCTATCATTGAAGGATTGGGGAACGCGAAGGTTATCCATGCTGGCTATGGTAGTTATGCTGTTGTAGAGATTACGGTGAATGAAGGTGAAAGTGAGTTCTACTTTGTGCCTTTTAAGGTATATCGTGAGCGTAAAAAGCTAGCGCCTTCATGTAACAAGTGCTTATCCTGTCAATGAGAGACCGTCAGGTAAGCCTGTTAGCTTTTTCAAGATAGCTCACAATCTCCTGCGCGGGAAACCATTACCTAAACCCCATATGTAACAAAGCCCGCTTAGTTGCGGCTTCGCCAGAAATTTCTTCTGGTATTCAGAACACCTTTACCGGGCTTGGCCTCGACCAACATTGCTGTTGGTAGTGGGATGTCTGGTATTACCAGTCTGCTGCATCCTTGAAGCAATTGTAGGTAGAGTGATGTAGATTTGCAACCAACATTTTGGTTGAACCTATATACTAACTTTTCTCGATGCCTCCCCAATCCCTTGCTGTATCTGGCTTTCTTGAAATAGCCGACTAAAGAGCACCTAAAACCTAACTGTACATTCTGCCCCCTATATTGCTGGGCAGATACCCCAGCATATGTAAACCGGCGGCTGCAAATGTCCTGCCGGTGGGTTGTCTATATGCTGGCTGTCATGTGGTCTGTTTTAGGTATACTATCCAGAGTAAACACATAAATTTCATGGCAGGTATGCAGTGAGTAAGCAGGGGCAGAATCTACTCAATCTTACACAGGCTGCTGAGGCTGTAGGTATCACAAGAAAAACACTTTACTCCCATATTGATAAGGGGTTGGTAAGTGTTACCCGTCAGCAAGGTAAACGATATATCGATGTGTCCGAGCTAATCAGACATTACGGATCTGTATCCTTACCAGAGGGAAAAGTAAACGCCGTTACACGGTCACAAAATAAACATGATGACGATACAATCTTGGCTATGCAGCGGGAGCTGGTCCGAGCTTGAGGAAGCTCATCGAGAAGCAACAATTGTTGCTTGAGGATAAACAGGAGGCGGACCGGCTTCGGGAACAGGTGGTCGGGTTGCAAAATGAGCGTGACGCAACAGCTCAGAAACTGGAAAAAGTGAAAGCAGAGCTGGAAGCTACGCGGAATAATGGCTTTTGGAAACGCTTATTTGGTTGATGATATGACTATACAAAATTTTCGCATAGGCTTTGAACGCATCGTTTTTCTGGGATTGTTATTTTTTGTAGTTAACGCGGTGCTATTCTTTGGCATCACCCTTTTCGATCCTGAATGGAAAGCATGGCAGCGAGATTGGGCGCTTAAGTGCTTAATTATTTTCGCTGAAATAATGATCTCTAGTCAGGTTCTACTTTGGGTAGCTTATGGCTTTGCAGGGAAACCGTTTAAGCCTAACTTTAATCCGTTAACATATGTGCATCGGCTTTAATTAATTTGACGGCGTTGCTACACCGGTGCATTATCCCTGAAACGAAAAAACCACCCGGCAAGGTGGTTTTTCGAAGGTTCAGCAAACCGGCAAGTTTCTGAACCGTGGTAACAGTCTTGTGCGAGACGTGTCACCAAATACTGTCCTTCCAGTGTAGCCGCAGTCAGGCAACCACATCAAGAATCTTTTAACTGAGATTCTGTCGATACTACCTCGCACATTTCTGTTTACCGTATTGGCTGTTGCCATTAGCGGCACTTTGCCGTGTCTGTTGGGGTTGGAATCGTGAGAATAGTTACCCAGCAGGTGCAACGGTCGGACTGAACGGGGGGTTCGTGCATACAGTCCAGCTTGGAGCGAACTGCCTACCCGGAACTGAGTGTCAGGCGTGGAATGAGATAAACGCGGCCATAACAGCGGAATGACACCGGTAAACCGAAAGGCAGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCCATCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCACTGATTTGAGCGTCAGATTTCGTGATGCTTGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGGCAACTCCGCATCCTTTTTCCGGCCTTTCTTGACCTCAGCTTCATCTCGTTACCTCGTCATTCGTGAGCAGGTAACGCCCGCCGCAGCCGAACGGCCGGAGCGTAGCGACCGAGTGAGCGAGGAGGCGTCATATCTCCTGAACCGGCATTCAGCACTGACGCGTCTCAGCCGCATATTTTCTCCTGCTACATGAAGCACTTTCCTGATAACCGCACTCATGCCAACATAGTAAGCCAGTATACACTCCGCTAGCGCTACGTGACTGGTTCAGGGCTGCGCCCCGAAACCCGCTAAAAACCACTGACGCGCCTGCGGCTTGTCCAACACCGTGCCGACCGGGAAACATTTCCCGCCCGTCCCGGTGTTCTCAGGAGGCTACTCTGGCAGACAAACGCAACAAG
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif AGVTANAAMVGHCBGACGCDVSGGBGGCTTNKCGHABMCAGTSHMRA
Motif CATCCTGDTTMCVGCCTTDVHTGHBNHCRKHDGCATCWCDTTRCC
Motif CGGRAAACCDTTMCC
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|