RefSeq | NC_025003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000322 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1210 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.4835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 1866..3075 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TTTACTGCGTTTGTCTGCCAATCCAGCCTCCTGATAACGCCGGGACGGGCGGGAAATCTTTTCCCGGTCGGCGCGGTGTTGGACAAGCCGCAGGCGCGTCAGTGGTTTTAGCAGGTTTCGGGGCGCAGCCCTGAACCAGTCACCTAGCGCTAGCGGAGTGTATACTGGCTTAGTATGTTACGGCGAGATGGAGATTCAGGAAAGTGCTTCATGTGAGAGGGGGAAAATGCTGCTGCAGGGAGTAGGTGCGAAATGCCGGTGTCGGTGACATGACGCCTCCTCGCTCACTCGGTCGCTACGCTCCTGCCGTGAGACTGCGGCGGGCGTTACGGGCTTACAGATAACGGGATAGCAAGAAGTCAGGAAAGGCGGAAAAAGGATGCGGCGTTGCCGTTTTTCCATAGGCTTCGCCCTCCTGACGAGCTTCACGGAAATCAGACGATGGCCGGTGCTCAAATCAGAAGGGGCGAAACCTGACAGGACTTAAAGATCCCCACCGTTTCCGATGGGTCGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCCACCGTGAGGTTTACCCGTTGCAGACCGCCGTAAGGTGGCGTTTTCTCATTCCCTCCCATGCAACTGGGTTCCTGTTAGGTGGTTCGCTCCAAGCTGGACTATATGCACGAACTCCCCGTTTAGTCCGACTACCACGTCCGATCAGGTAACTGTTCTCTTGATTCCAACCCTGACGGACACGACAAATCGCCACTGGCGGTAGCCAACGGTAACTGAATTACGGAGCGGGAAAGTACACAATAGAAAAATCAGAGTTCTTGAAGTGTCACCATAACTACGGCTACACTGGAAGGACAGTTTTGGTTACTGCGCTCCGTTAAAGCCAGTTACCACGGTTAAAAGATCTGCCAGGATCATTTAACCTTCGAAAAACCACCTGCCAGGGTGGTTTTTTCGTTTTGGATAGAAGAGATTACGACGACTAACATATGATCTCAAGAAGATCCTCAACTTAAGACTGTGCCTTTTTCCTTTTGCTATCTGCAGCGCCTTTAGCGCGACAGCCTCTACACCACGTCTGAGGGGCTACGTTACCGCGTAAATTTCTAAAGCCAAATAGAGTTTCAACTTCTTGATAGGTCGAAGCCACGACTGGGTTTAATCGACAATCATAGTCAGCACAATGACATGGATGAGGCAACGCTATTGTATTGCTCATAATTTCTCCTATAT
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AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif AANHTVHVANGNCWWRAAGAKYYNCMA
Motif ACGGTGVCKTTTTCCYDTTGS
Motif AAATCAGA
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The result of BLAST |
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