RefSeq NZ_CP022281
DoriC accession number pORI00000990
OriC length 1207 nt
OriC AT content 0.6065
The location of oriC region 50068..51274 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
TTGTGGAGTCTCCAGTCTGAGGGAGTCTTATGCATCCCGTATTGGGCACTATGATGCCGGAAATCTGCGAAGCTCCACACCTTCCTGTATTTTCCCGCCATCTACCTTTGTGCTCCGGATTTAATGGTGGGAGGCGTTCATCTCATTCTCCGCTTGTCTCATTGGCATAATAGCATCTTTAAAAGCACTCTTAAAAGTGCTAATTTTGAGAAAAACATCAGAACAGGTGAGATATGGCTCTTTCCGACATCGCCTTAAAACGCTCTGTAACGCGTTCTGAGCGTTTTTTCCCGTTTCGTTGTAGTCAGCTACGGTTTAACGGCGTTTTAACGCCGCTCAACGCTTTTTAGCGGCCTTGTTGCTGTGATCTGTTGCCATGATCCGTATAGGTGTTCAATCTTGATCAAAATTTACTCAAGGCCACGAGTGTTTTGTGAATACCCTCTAAAACGCGCTGTATCGCGTTCTGAGCGATTTTTTCCATTTCACATGGTTTTCCTCATGGTTGTATCTAACGAAGCGGCAGAAAGCGATTCAGGGCTTCTCAGTGAAAGATCCAAAAAGGATCAATAAACGGATCGTATGATCTGAACTCTTCTGGTTTTGAGAAAGGAGACACCGCTCACCGCAGTCGAACGACCGAGCGTAGCGAGTTAGTGAGCGAGGAAGCGGAACAGCACAGGGATAACATCAGGCAATTACGCGCAGTGGTTAAAAAGCGAGCATATTGTTTTTATGTGTGGTTGTCCTGGTTCAGAGTGATCTGTCCTCCGGGTTTACGCAAAGTTATCCACAGGCACTGTGCATTTAAAAAACTTATCTTTTCTTCTTGATCTTAAAAACTTAAAAACTTAGAGAGCCGTAACATCATGAAAAACATAATAAAAAAACGCTAAAGTTGAGAGGATTTTTAACATAAGTTGAGAAGATTTTTAAGTAAGGTTGAGAAGATTTTTAACTAAAGTTGAGAGGATTTTTAAGTAAGGTTGAGAAGATTTTTAACTAAAGATGAGAGGATTTTTAAGTGTATCCACAGATTTAAAAAAGATCATGAAAAACATAATGTTATGAATTCATTTTGATGTGAATACATAAAGATCTTTATATCTAAAGGTGATAAGCTTTTTAAGAAAAGGTTGTAGTTTGTAATTGATATACAACCTTTTAGGGGTTATCATTTAGTCAATTGATATGGCTTATTCTATAT
TTGTGGAGTCTCCAGTCTGAGGGAGTCTTATGCATCCCGTATTGGGCACTATGATGCCGGAAATCTGCGAAGCTCCACACCTTCCTGTATTTTCCCGCCATCTACCTTTGTGCTCCGGATTTAATGGTGGGAGGCGTTCATCTCATTCTCCGCTTGTCTCATTGGCATAATAGCATCTTTAAAAGCACTCTTAAAAGTGCTAATTTTGAGAAAAACATCAGAACAGGTGAGATATGGCTCTTTCCGACATCGCCTTAAAACGCTCTGTAACGCGTTCTGAGCGTTTTTTCCCGTTTCGTTGTAGTCAGCTACGGTTTAACGGCGTTTTAACGCCGCTCAACGCTTTTTAGCGGCCTTGTTGCTGTGATCTGTTGCCATGATCCGTATAGGTGTTCAATCTTGATCAAAATTTACTCAAGGCCACGAGTGTTTTGTGAATACCCTCTAAAACGCGCTGTATCGCGTTCTGAGCGATTTTTTCCATTTCACATGGTTTTCCTCATGGTTGTATCTAACGAAGCGGCAGAAAGCGATTCAGGGCTTCTCAGTGAAAGATCCAAAAAGGATCAATAAACGGATCGTATGATCTGAACTCTTCTGGTTTTGAGAAAGGAGACACCGCTCACCGCAGTCGAACGACCGAGCGTAGCGAGTTAGTGAGCGAGGAAGCGGAACAGCACAGGGATAACATCAGGCAATTACGCGCAGTGGTTAAAAAGCGAGCATATTGTTTTTATGTGTGGTTGTCCTGGTTCAGAGTGATCTGTCCTCCGGGTTTACGCAAAGTTATCCACAGGCACTGTGCATTTAAAAAACTTATCTTTTCTTCTTGATCTTAAAAACTTAAAAACTTAGAGAGCCGTAACATCATGAAAAACATAATAAAAAAACGCTAAAGTTGAGAGGATTTTTAACATAAGTTGAGAAGATTTTTAAGTAAGGTTGAGAAGATTTTTAACTAAAGTTGAGAGGATTTTTAAGTAAGGTTGAGAAGATTTTTAACTAAAGATGAGAGGATTTTTAAGTGTATCCACAGATTTAAAAAAGATCATGAAAAACATAATGTTATGAATTCATTTTGATGTGAATACATAAAGATCTTTATATCTAAAGGTGATAAGCTTTTTAAGAAAAGGTTGTAGTTTGTAATTGATATACAACCTTTTAGGGGTTATCATTTAGTCAATTGATATGGCTTATTCTATAT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif TTRARAVGMTYTKTAACDHRWKHTGAGMGGWTTTTTMMGT

StartP-valueSite
9431.23e-19TTAAGTAAGGTTGAGAAGATTTTTAACTAAAGTTGAGAGGATTTTTAAGTAAGGTTGAGA
9874.37e-19TTAAGTAAGGTTGAGAAGATTTTTAACTAAAGATGAGAGGATTTTTAAGTGTATCCACAG
8992.99e-17AACGCTAAAGTTGAGAGGATTTTTAACATAAGTTGAGAAGATTTTTAAGTAAGGTTGAGA
2554.16e-17CGACATCGCCTTAAAACGCTCTGTAACGCGTTCTGAGCGTTTTTTCCCGTTTCGTTGTAG
4454.98e-16TGAATACCCTCTAAAACGCGCTGTATCGCGTTCTGAGCGATTTTTTCCATTTCACATGGT

Motif AGADANAMADMRGAWCADGAAAVRBAT

StartP-valueSite
10353.72e-11GTGTATCCACAGATTTAAAAAAGATCATGAAAAACATAATGTTATGA
8546.86e-11TTAAAAACTTAGAGAGCCGTAACATCATGAAAAACATAATAAAAAAA
6601.76e-10CGAGTTAGTGAGCGAGGAAGCGGAACAGCACAGGGATAACATCAGGC
5532.75e-10TCTCAGTGAAAGATCCAAAAAGGATCAATAAACGGATCGTATGATCT
2096.60e-10GCTAATTTTGAGAAAAACATCAGAACAGGTGAGATATGGCTCTTTCC

Motif ACRCCGCTCAMCGCWKTYKARCGRCC

StartP-valueSite
6163.12e-16GAGAAAGGAGACACCGCTCACCGCAGTCGAACGACCGAGCGTAGCG
3302.79e-15CGGCGTTTTAACGCCGCTCAACGCTTTTTAGCGGCCTTGTTGCTGT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000990 100.0 1207 0 0 1 1207 1 1207 0.0 2230
pORI00000990 93.258 89 6 0 938 1026 894 982 1.9e-31 132
pORI00000990 93.258 89 6 0 894 982 938 1026 1.9e-31 132
pORI00000072 92.554 1061 72 7 148 1206 1056 1 0.0 1515
pORI00000421 95.468 662 29 1 148 809 6 666 0.0 1055
pORI00000031 95.586 657 27 2 148 804 6 660 0.0 1051
pORI00000702 95.166 662 29 3 148 809 1227 569 0.0 1042
pORI00001062 91.946 596 42 5 264 857 1000 409 0.0 830
pORI00001057 94.468 470 25 1 341 809 1038 569 0.0 723
pORI00000921 94.268 471 24 2 341 809 1 470 0.0 717
pORI00000446 94.268 471 24 2 341 809 1 470 0.0 717
pORI00000947 93.644 472 27 1 341 809 1062 591 0.0 702
pORI00000834 87.984 516 56 5 258 771 1232 721 0.0 604
pORI00001164 88.861 404 45 0 368 771 1124 721 0.0 497
pORI00001144 88.366 404 47 0 368 771 1 404 0.0 486
pORI00001056 88.366 404 47 0 368 771 1124 721 0.0 486
pORI00001020 88.366 404 47 0 368 771 1 404 0.0 486
pORI00001011 88.366 404 47 0 368 771 1124 721 0.0 486
pORI00000595 94.406 143 4 3 148 289 6 145 0.0 217
pORI00000595 92.857 70 3 1 605 674 642 709 5.35e-22 100
pORI00000914 93.706 143 5 3 148 289 6 145 0.0 211
pORI00000914 92.857 70 3 1 605 674 642 709 5.35e-22 100
pORI00000478 92.857 70 3 1 605 674 286 353 5.35e-22 100
pORI00000112 89.744 78 7 1 602 678 1655 1732 1.92e-21 99
pORI00000306 95.082 61 3 0 618 678 434 374 6.92e-21 97
pORI00000012 89.474 76 8 0 603 678 748 823 6.92e-21 97