RefSeq NC_014500.1
Accession number NC_014500.1
DoriC accession number ORI94030317
OriC length 379 nt
OriC AT content 0.580475
The location of oriC region 4922455..31 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGDATNABCBGGGATYYAAA

StartP-valueSite
1711.76e-09CGGTTGGTTGTGGATAAGGCGGGATCCAAAAAGAAGATCA
2482.26e-09GATCCCAGTCTGTATTAGCTGGGATCTGAAAGGGTAATTA
3244.97e-08GATAACTACGGGTTTTACCCGGCATTTAAAGCTATTTATC
2266.53e-08TCACTAGCTGTGAATGATCGGTGATCCCAGTCTGTATTAG
898.43e-08CCAAGTGTGTTGGATCGTCGGGTAGTTAAAGAAAGATCTT

Motif MGATCTYT

StartP-valueSite
1422.54e-05TCTCTTTATTAGATCTCTTATTAGGATC
1292.54e-05TTTTATTTAAAGATCTCTTTATTAGATC
2135.49e-05GGGTTATTGCCGATCACTAGCTGTGAAT
1121.14e-04AGTTAAAGAAAGATCTTTTTTATTTAAA
271.28e-04TGGTTGCGAACGATCGTTACTTGCCCTG

Motif CCTSGSGTGG

StartP-valueSite
103.08e-07GGTGCTACACCTCGCGTGGTTGCGAACGA
411.84e-06CGTTACTTGCCCTGGGGTGGGGGATTCTAC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI94030317 100.0 379 0 0 1 379 1 379 0.0 701
ORI93020110 93.404 379 21 4 1 377 379 3 0.0 558
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ORI93020092 85.833 360 47 4 1 358 378 21 0.0 379
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ORI93020095 80.0 345 49 18 22 357 356 23 0.0 237
ORI96000435 79.251 347 53 18 19 357 33 368 0.0 224
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ORI80020043 75.684 329 63 16 37 357 36 355 7.36e-37 148
ORI94030361 75.305 328 66 14 37 357 36 355 3.43e-35 143
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ORI95030441 77.542 236 45 8 97 327 303 71 5.73e-33 135
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ORI92230183 77.366 243 45 9 90 327 89 326 5.73e-33 135
ORI10020015 76.296 270 55 9 97 361 285 20 5.73e-33 135
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ORI93020109 75.389 321 54 22 25 329 363 52 7.41e-32 132
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ORI96000399 76.543 243 47 9 90 327 89 326 1.24e-29 124
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ORI92230179 76.423 246 41 13 90 327 289 53 2.08e-27 117
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ORI96020517 74.609 256 55 10 106 357 275 26 1.62e-23 104
ORI93020097 81.6 125 21 2 54 178 52 174 5.81e-23 102