RefSeq NC_018525.1
Accession number NC_018525.1
DoriC accession number ORI96000435
OriC length 390 nt
OriC AT content 0.602564
The location of oriC region 4820906..4821295 nt
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OriC map
OriC sequences
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gidAGGTACTGCTCCTCGCATTATCGCGAATGATGAGTGGCGAACGATCGTTATTTGCCCTGGGATGGGGATTCTACTCAACTTTGAGCCAACGACCAAGTCCGTTGGATCCTCGTTAATTAAAGAAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTCTTTATTAGATCTCTTATTAGGATCGTCATGTTGTGTGGATAAGTGATTATTCATATTAAAGATCAAGAGAATGGCGTTGATCCTTACCTGTGAATGATCGGTGATCCTGGACAGTATAAGCTGGGATCTTAATGCGGGTTTATGCACAGGACAAAAAACATACTTGGGTTGTTATTGGGATAACTACGGCTTTTACACCTGAATTAAGCATAGTTATCCACATTCAACTGCCGAATATTTCATCmioC
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GATCSTYRYNTDNTVDNGAWHGRTGATT

StartP-valueSite
2251.25e-10GAATGGCGTTGATCCTTACCTGTGAATGATCGGTGATCCTGGACAGTA
421.25e-10AGTGGCGAACGATCGTTATTTGCCCTGGGATGGGGATTCTACTCAACT
1671.53e-10CTCTTATTAGGATCGTCATGTTGTGTGGATAAGTGATTATTCATATTA
72.24e-10GGTACTGCTCCTCGCATTATCGCGAATGATGAGTGGCGAACGAT
1041.30e-09AAGTCCGTTGGATCCTCGTTAATTAAAGAAAGATCTTTTTATTTAAAG

Motif CAACKRCC

StartP-valueSite
868.69e-06AACTTTGAGCCAACGACCAAGTCCGTTG
3711.44e-05TATCCACATTCAACTGCCGAATATTTCA

Motif AGATCTC

StartP-valueSite
1535.72e-05TCTCTTTATTAGATCTCTTATTAGGAT
1405.72e-05TTTTATTTAAAGATCTCTTTATTAGAT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96000435 100.0 390 0 0 1 390 1 390 0.0 721
ORI93020095 96.899 387 11 1 1 386 391 5 0.0 647
ORI10030033 96.164 391 14 1 1 390 1 391 0.0 638
ORI92220054 82.609 345 44 16 36 371 360 23 0.0 291
ORI80020043 80.665 331 48 16 50 371 35 358 0.0 243
ORI93020110 80.059 341 55 12 36 368 358 23 0.0 241
ORI93020094 79.228 337 64 5 36 368 357 23 0.0 230
ORI94030317 79.251 347 53 18 33 368 19 357 0.0 224
ORI94030361 79.456 331 52 16 50 371 35 358 0.0 220
ORI92520061 79.091 330 55 14 50 371 346 23 0.0 215
ORI10020019 78.788 330 56 14 50 371 35 358 0.0 209
ORI96000376 78.485 330 57 14 50 371 346 23 0.0 204
ORI96000375 78.485 330 57 14 50 371 35 358 0.0 204
ORI96000374 78.485 330 57 14 50 371 35 358 0.0 204
ORI93020117 78.485 330 57 14 50 371 35 358 0.0 204
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ORI90020045 78.485 330 57 14 50 371 346 23 0.0 204
ORI20020031 78.485 330 57 14 50 371 35 358 0.0 204
ORI20020030 78.485 330 57 14 50 371 35 358 0.0 204
ORI92320057 78.248 331 56 16 50 371 346 23 0.0 198
ORI92220056 77.879 330 59 14 50 371 35 358 0.0 193
ORI10020008 77.644 331 59 15 50 371 35 359 0.0 187
ORI93020092 77.259 343 61 14 36 368 357 22 0.0 185
ORI94030310 77.85 307 59 9 67 368 48 350 0.0 182
ORI96020517 78.621 290 49 13 89 371 306 23 0.0 180
ORI96020516 77.855 289 53 11 89 371 6 289 5.81539e-43 169
ORI96000370 77.16 324 53 19 57 369 335 22 5.81539e-43 169
ORI94030349 77.16 324 53 19 57 369 335 22 5.81539e-43 169
ORI93020097 79.583 240 45 4 58 295 43 280 5.81539e-43 169
ORI10020018 78.102 274 50 10 103 371 9 277 7.53058e-42 165
ORI10030027 78.102 274 50 10 103 371 9 277 7.53058e-42 165
ORI96000387 75.701 321 51 24 39 340 363 51 5.91e-33 135
ORI93020109 75.701 321 51 24 39 340 363 51 5.91e-33 135
ORI92720079 77.637 237 40 12 65 294 52 282 7.64e-32 132
ORI93020091 75.078 321 53 21 39 340 363 51 1.28e-29 124
ORI90020046 79.141 163 25 8 115 271 273 114 1.67e-23 104
ORI10030090 74.797 246 47 12 58 296 321 84 2.79e-21 97