RefSeq NC_014228.1
Accession number NC_014228.1
DoriC accession number ORI94030310
OriC length 375 nt
OriC AT content 0.645333
The location of oriC region 38293..38667 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTTAWYCMCWGC

StartP-valueSite
3414.09e-08TTTCAGATAAGTTATCCACAGCTGATCGTTAT
3181.64e-07ATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATA
2672.49e-07TAAATGCAGAGTTATTCACAGCCGATTGACTA

Motif GWGAATKHTHC

StartP-valueSite
2181.41e-06ATCATTTGCTGTGAATGATCCGTGATCCAAC
192.29e-06CTTCAATTGTGAGAATGCTTCATATGCATTG
443.69e-06GCATTGGGGAGAGAATTCTACTCAAGTTTGG
1715.17e-06CTGTGGATAAGTGAATTTTCCATATAAAGAT

Motif GATCAT

StartP-valueSite
2073.36e-04TACTGTAAAGGATCATTTGCTGTGAA
1893.36e-04TCCATATAAAGATCATGATACTGTAA
1553.36e-04TTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAA
863.36e-04AGTAGGAAGAGATCATCGTTAATTAA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI94030310 100.0 375 0 0 1 375 1 375 0.0 693
ORI93030282 90.16 376 34 3 1 375 1 374 0.0 486
ORI93020097 82.955 352 49 9 5 350 7 353 0.0 307
ORI92520061 80.645 310 46 13 48 350 328 26 0.0 228
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ORI96000375 80.323 310 47 13 48 350 53 355 0.0 222
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ORI93020117 80.323 310 47 13 48 350 53 355 0.0 222
ORI90020045 80.323 310 47 13 48 350 328 26 0.0 222
ORI20020031 80.323 310 47 13 48 350 53 355 0.0 222
ORI20020030 80.323 310 47 13 48 350 53 355 0.0 222
ORI10020019 80.323 310 47 13 48 350 53 355 0.0 222
ORI92220056 80.0 310 48 13 48 350 53 355 0.0 217
ORI92020050 79.935 309 50 11 48 350 53 355 0.0 217
ORI80020043 80.0 310 48 13 48 350 53 355 0.0 217
ORI92320057 79.612 309 51 11 48 350 328 26 0.0 211
ORI96020516 80.488 287 42 13 71 350 7 286 0.0 207
ORI10020008 79.421 311 49 14 48 350 53 356 0.0 206
ORI96020517 81.298 262 39 9 94 350 282 26 0.0 204
ORI10020018 81.369 263 37 11 94 350 18 274 0.0 204
ORI10030027 81.369 263 37 11 94 350 18 274 0.0 204
ORI92220054 79.233 313 45 18 48 350 328 26 0.0 200
ORI10030033 78.827 307 56 9 48 350 68 369 0.0 198
ORI96000435 77.85 307 59 9 48 350 67 368 0.0 182
ORI93020095 81.034 232 39 5 48 277 324 96 0.0 180
ORI96000387 83.439 157 19 7 105 257 270 117 4.38e-34 139
ORI93020109 83.439 157 19 7 105 257 270 117 4.38e-34 139
ORI93020094 75.159 314 56 18 48 350 325 23 9.48e-31 128
ORI93020091 82.166 157 21 7 105 257 270 117 9.48e-31 128
ORI94030317 74.522 314 61 16 48 351 54 358 5.71e-28 119
ORI93020110 77.273 220 38 9 48 260 326 112 5.71e-28 119
ORI96000423 76.382 199 35 9 86 277 283 90 2.67e-21 97
ORI93020092 75.349 215 42 10 48 256 325 116 3.46e-20 94