RefSeq NC_006155.1
Accession number NC_006155.1
DoriC accession number ORI10020019
OriC length 380 nt
OriC AT content 0.592105
The location of oriC region 4744561..269 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif ARGATC

StartP-valueSite
2102.07e-04ATAATTAAGGAGGATCGTTTGTTGTG
1522.07e-04ATCTCTTATTAGGATCATGATCCTCT
892.07e-04CAAGTGGCATAGGATCGCCTTTAATT
1924.30e-04ATTCACATGGAAGATCATATAATTAA
1264.30e-04TTTTTATTTAAAGATCTCTTTATTAG

Motif GTTATGCACAT

StartP-valueSite
2721.09e-06TAAATGGCATGTTATGCACAGGCACTCGGCA
3461.73e-06TTTAAGCATAGTTATACACATTCGTTCGCGC
1791.32e-05TGGATAAGTGATTATTCACATGGAAGATCAT
171.38e-05GCACCTCGCCGTTATGCGAATTTCTGTGTTT
21.47e-05GGTACTGCACCTCGCCGTTATG

Motif TGYGWDTRMSCKGKGRTS

StartP-valueSite
2223.69e-09GATCGTTTGTTGTGAGTGACCGGTGATCCTATTGCGTA
2443.96e-09GTGATCCTATTGCGTATAAGCTGGGATCTAAATGGCAT
316.62e-09TGCGAATTTCTGTGTTTGCCCTGGGGTGGGGGATTCTA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI10020019 100.0 380 0 0 1 380 1 380 0.0 702
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ORI10030027 99.666 299 1 0 82 380 1 299 0.0 547
ORI80020043 91.799 378 29 2 1 377 1 377 0.0 525
ORI94030361 91.005 378 32 2 1 377 1 377 0.0 508
ORI92220054 86.772 378 39 8 4 375 378 6 0.0 411
ORI96020517 88.462 312 34 2 70 380 311 1 0.0 375
ORI10030033 80.547 329 53 11 35 358 50 372 0.0 243
ORI93020097 84.483 232 31 5 53 282 52 280 0.0 224
ORI94030310 80.323 310 47 13 53 355 48 350 0.0 222
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ORI96000435 78.723 329 58 12 35 358 50 371 0.0 209
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ORI94030349 77.747 364 61 20 4 356 376 22 0.0 206
ORI93020116 77.778 342 55 19 1 331 1 332 0.0 191
ORI93020115 77.778 342 55 19 1 331 1 332 0.0 191
ORI96000391 77.551 343 55 20 1 331 1 333 0.0 187
ORI93030282 78.065 310 57 10 51 355 46 349 0.0 185
ORI93020094 76.453 327 63 11 36 355 342 23 7.33019e-42 165
ORI94030317 75.841 327 66 13 36 355 37 357 1.59e-38 154
ORI93020110 75.61 328 65 14 36 355 343 23 7.38e-37 148
ORI93020092 75.172 290 56 14 1 281 378 96 4.47e-29 122
ORI96000387 74.184 337 63 19 35 355 352 24 5.79e-28 119
ORI93020109 74.184 337 63 19 35 355 352 24 5.79e-28 119
ORI96000423 74.806 258 53 11 10 261 362 111 4.51e-24 106
ORI93020091 74.905 263 46 16 35 283 352 96 5.83e-23 102