RefSeq NC_004547.2
Accession number NC_004547.2
DoriC accession number ORI10030033
OriC length 391 nt
OriC AT content 0.611253
The location of oriC region 5063660..31 nt
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OriC map
OriC sequences
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gidAGGTACTGCTCCTCGCATTATTGCGAATGATTAGTGGCGAACGATCGTTATTTGCCCTGGGGTGGGGGATTCTACTCAACTTTGAGCCAACGACCAAGTCCGTTGGATCCTCGTTAATTAAAGAAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTCTTTATTAGATCTCTTATTAGGATCGTCATTTTGTGTGGATAAGTGATTATTCATATTAAAGATCAAGAGAATGGAGCTGATCCTTACCTGTGAATGATCGGTGATCCTAGCCAGTATAAGCTGGGATCATAATGCGGAGTTATGCACAGGACAAAAAACATACTTGGGTTGTTATTGGGATAACTACTGGTTTTACACCTGAATTAAGCATAGTTATCCACATTCAACTGCCGAATATTTAATCmioC
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif AAAGATC

StartP-valueSite
2058.00e-05TATTCATATTAAAGATCAAGAGAATGG
1398.00e-05CTTTTTATTTAAAGATCTCTTTATTAG
1238.00e-05TTAATTAAAGAAAGATCTTTTTATTTA
391.29e-04ATTAGTGGCGAACGATCGTTATTTGCC
2402.22e-04CTTACCTGTGAATGATCGGTGATCCTA

Motif GATCCTCRY

StartP-valueSite
73.87e-06GGTACTGCTCCTCGCATTATTGCGA
1056.33e-06AAGTCCGTTGGATCCTCGTTAATTAAAGA
2501.12e-05AATGATCGGTGATCCTAGCCAGTATAAGC
2262.89e-05GAATGGAGCTGATCCTTACCTGTGAATGA
1686.40e-05CTCTTATTAGGATCGTCATTTTGTGTGGA

Motif GCRKAGTTATSCACA

StartP-valueSite
2811.02e-09GGATCATAATGCGGAGTTATGCACAGGACAAAAAA
3554.82e-09CCTGAATTAAGCATAGTTATCCACATTCAACTGCC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI10030033 100.0 391 0 0 1 391 1 391 0.0 723
ORI96000435 96.164 391 14 1 1 391 1 390 0.0 638
ORI93020095 96.144 389 15 0 1 389 391 3 0.0 636
ORI92220054 83.768 345 41 15 36 372 360 23 0.0 313
ORI80020043 81.928 332 43 15 50 372 35 358 0.0 265
ORI93020110 80.882 340 55 9 36 369 358 23 0.0 259
ORI92520061 80.851 329 52 11 50 372 346 23 0.0 248
ORI94030317 80.0 345 55 14 33 369 19 357 0.0 243
ORI10020019 80.547 329 53 11 50 372 35 358 0.0 243
ORI96000376 80.243 329 54 11 50 372 346 23 0.0 237
ORI96000375 80.243 329 54 11 50 372 35 358 0.0 237
ORI96000374 80.243 329 54 11 50 372 35 358 0.0 237
ORI94030361 80.363 331 50 15 50 372 35 358 0.0 237
ORI93020117 80.243 329 54 11 50 372 35 358 0.0 237
ORI93020092 79.765 341 57 12 36 369 357 22 0.0 237
ORI92020050 80.303 330 52 13 50 372 35 358 0.0 237
ORI90020045 80.243 329 54 11 50 372 346 23 0.0 237
ORI20020031 80.243 329 54 11 50 372 35 358 0.0 237
ORI20020030 80.243 329 54 11 50 372 35 358 0.0 237
ORI92320057 80.0 330 53 13 50 372 346 23 0.0 231
ORI93020094 79.351 339 61 7 36 369 357 23 0.0 230
ORI92220056 79.635 329 56 11 50 372 35 358 0.0 226
ORI10020008 79.394 330 56 12 50 372 35 359 0.0 222
ORI94030310 78.827 307 56 9 68 369 48 350 0.0 198
ORI96020516 79.167 288 51 9 90 372 6 289 0.0 191
ORI10020018 79.487 273 48 8 104 372 9 277 0.0 187
ORI10030027 79.487 273 48 8 104 372 9 277 0.0 187
ORI96020517 78.966 290 48 13 90 372 306 23 0.0 185
ORI93020097 80.435 230 43 2 68 296 52 280 1.26117e-44 174
ORI96000387 75.625 320 53 22 39 341 363 52 5.92e-33 135
ORI93020109 75.625 320 53 22 39 341 363 52 5.92e-33 135
ORI93020091 75.312 320 54 18 39 341 363 52 2.76e-31 130
ORI10030090 75.463 216 40 10 66 275 314 106 3.62e-20 94