RefSeq NC_013892.1
Accession number NC_013892.1
DoriC accession number ORI93030282
OriC length 374 nt
OriC AT content 0.65508
The location of oriC region 36292..36665 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
gidAGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioC
gidAGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioC
gidAGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioC
gidAGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioC
gidAGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioC
gidAGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioC
gidAGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioC
gidaGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioc
gidAGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioC
gidAGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioC
gidAGTGCGAACCTTCAGTTGTGAGAATGCTTGATCTGCATTAGGGAGAGGATTCTACTCAAGTTTGGACATTAGACCAAATAAGTTTGATCGTTGCTAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAGATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCTGTGGATAAGTGATTTTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAATTGAAACTCGGTTATTAAATGGATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGTTATATTTTTAATCGGAmioC
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTTATCCAC

StartP-valueSite
3402.41e-06TTTCAGATAAGTTATCCACAATTGATCGT
3178.88e-06ATAACTACGGGTTAACCCCTGCTTTTCAG
2662.05e-05TAAATCAGTAGTTATACACAGAAGCTAAA
2283.20e-05TGAATGATCCGTGATCCAAGTCAGTATAA

Motif ARGATC

StartP-valueSite
2041.96e-04GATGCTGTAAAGGATCATTTACTGTG
1461.96e-04ATCTGTTATTAGGATCGCGATCATCT
1865.00e-04TTTCCATAGAAAGATCATGATGCTGT
1205.00e-04TTTTTATTTAAAGATCTTTTTATTAG
1045.00e-04TAATTAAAAGAAGATCTTTTTATTTA

Motif GSGAWC

StartP-valueSite
1529.16e-05TATTAGGATCGCGATCATCTGTGGAT
31.75e-04GTGCGAACCTTCAGTTGT
2503.02e-04AGTATAAGCTGGGATCTAAATCAGTA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI93030282 100.0 374 0 0 1 374 1 374 0.0 691
ORI94030310 90.16 376 34 3 1 374 1 375 0.0 486
ORI93020097 81.714 350 58 6 5 350 7 354 0.0 287
ORI94030361 79.421 311 51 11 46 349 51 355 0.0 207
ORI92220054 79.257 323 46 18 46 357 330 18 0.0 206
ORI80020043 82.7 237 30 9 46 276 51 282 0.0 200
ORI96020517 80.153 262 40 10 94 349 281 26 0.0 185
ORI96000376 78.135 311 55 11 46 349 330 26 0.0 185
ORI96000375 78.135 311 55 11 46 349 51 355 0.0 185
ORI96000374 78.135 311 55 11 46 349 51 355 0.0 185
ORI93020117 78.135 311 55 11 46 349 51 355 0.0 185
ORI92520061 78.135 311 55 11 46 349 330 26 0.0 185
ORI92020050 78.344 314 49 15 46 349 51 355 0.0 185
ORI90020045 78.135 311 55 11 46 349 330 26 0.0 185
ORI20020031 78.135 311 55 11 46 349 51 355 0.0 185
ORI20020030 78.135 311 55 11 46 349 51 355 0.0 185
ORI10020019 78.135 311 55 11 46 349 51 355 0.0 185
ORI96020516 79.771 262 41 10 94 349 31 286 0.0 180
ORI92320057 78.025 314 50 15 46 349 330 26 0.0 180
ORI92220056 77.814 311 56 11 46 349 51 355 0.0 180
ORI10020018 79.771 262 41 10 94 349 19 274 0.0 180
ORI10030027 79.771 262 41 10 94 349 19 274 0.0 180
ORI10020008 77.244 312 57 12 46 349 51 356 1.55544e-43 171
ORI96000423 76.119 201 32 12 85 276 283 90 1.24e-19 92