RefSeq NC_007712.1
Accession number NC_007712.1
DoriC accession number ORI10030090
OriC length 366 nt
OriC AT content 0.579235
The location of oriC region 4127547..4127912 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif CWGHGGATC

StartP-valueSite
1992.34e-06GTCTTATCCACAGAGGATCGCGATCCTAG
1504.87e-06TTCACAGGCTCAGTGGATCTATAATATCT
2681.42e-05CTTTAATTACCTGCGGATCTTCCGGGCTT
1012.35e-05ATAAACAGGACAGAAGATCCCAGCTTATA
853.87e-05CCACGAGGACCTGTGGATAAACAGGACAG

Motif GCTTWHACHKGMGKDG

StartP-valueSite
1137.45e-09GAAGATCCCAGCTTATACCGGCGGGGATCATCGATC
3431.39e-08ACGATCCTTCGCTTTCACATGAGGTGTTTTTACC
2942.74e-08CTTGTATCCCGCTTAAACTTGAGTAGAATCCTCTTC

Motif GATCHTTC

StartP-valueSite
2512.29e-05TAAATAAAAAGATCTTTCTTTAATTACC
3354.06e-05GCCCCTTGACGATCCTTCGCTTTCACAT
1356.18e-05GGGGATCATCGATCATTCACAGGCTCAG
2358.93e-05CATAATAAGGGATCTTTAAATAAAAAGA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI10030090 100.0 366 0 0 1 366 1 366 0.0 676
ORI93020095 75.417 240 42 14 84 314 95 326 2.02e-22 100
ORI96000435 74.797 246 47 12 84 321 296 58 2.61e-21 97
ORI10030033 75.463 216 40 10 106 314 275 66 3.37e-20 94
ORI93020094 76.331 169 31 7 105 268 116 280 7.3e-17 82