RefSeq NC_010616
DoriC accession number pORI00000036
OriC length 794 nt
OriC AT content 0.7065
The location of oriC region 2164..41 nt
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OriC map
OriC sequences
AACTATGTAAATATTTAGTGTTTCTTCAAAATACCCCTTTAAAATTAAAAATAAAGGCACTCAAAATTTTTGTAAGGGTTATGATAAAGTTTGTTAAAAGAAAAACTGAAAGTGGATAAATTTATGAGAAAACAGGAGTTGTTAAAAAATGAAATTTAGAGAAGCATTAGAGAATTTTTTAACGAATAAGTATGTATATGTTGTGTTGCTGGTACTAGCTATTTATCAAATTTTCATGTTGTTTGAATAAAAATTCGGGGAGTAGAACACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGAAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATATTAACAGTAAGATTCATTCCAATTGCTTTATTTAAAAAGAAAATGTAGTATATATATTAGTTAATTAAACTAATATATATACTACATGGAGGTTTTATTGTGATTAAAAGTGAAAAAAAGAAAAGCCCTTTATTATTTAGGATAGGTATAGTACTTTTGATTATTTATGTATTGCTTTGGATAGGAATTATTGTTACTCCTTTTTTACCTGTATCAACGTTTGTAAAAGCAACTGTTATACCTGGGACAATTGTATTTGCTGAAATACTTTTAATTATTGCTGCGGCTTTTGTTGGGAAAGAGCTTGTAAGTAAGTATAAAGATCGTTTGAAACCGAAAAATTGGAAGAAAAAGAAAGGGAGTA
AACTATGTAAATATTTAGTGTTTCTTCAAAATACCCCTTTAAAATTAAAAATAAAGGCACTCAAAATTTTTGTAAGGGTTATGATAAAGTTTGTTAAAAGAAAAACTGAAAGTGGATAAATTTATGAGAAAACAGGAGTTGTTAAAAAATGAAATTTAGAGAAGCATTAGAGAATTTTTTAACGAATAAGTATGTATATGTTGTGTTGCTGGTACTAGCTATTTATCAAATTTTCATGTTGTTTGAATAAAAATTCGGGGAGTAGAACACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGAAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATATTAACAGTAAGATTCATTCCAATTGCTTTATTTAAAAAGAAAATGTAGTATATATATTAGTTAATTAAACTAATATATATACTACATGGAGGTTTTATTGTGATTAAAAGTGAAAAAAAGAAAAGCCCTTTATTATTTAGGATAGGTATAGTACTTTTGATTATTTATGTATTGCTTTGGATAGGAATTATTGTTACTCCTTTTTTACCTGTATCAACGTTTGTAAAAGCAACTGTTATACCTGGGACAATTGTATTTGCTGAAATACTTTTAATTATTGCTGCGGCTTTTGTTGGGAAAGAGCTTGTAAGTAAGTATAAAGATCGTTTGAAACCGAAAAATTGGAAGAAAAAGAAAGGGAGTA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif VCCCTT

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5553.78e-05AAAAAGAAAAGCCCTTTATTATTTAG
3088.49e-05GTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTT
6271.28e-04ATTATTGTTACTCCTTTTTTACCTGT

Motif SCTGSKRC

StartP-valueSite
7105.56e-06TTTAATTATTGCTGCGGCTTTTGTTGGG
6715.56e-06AACTGTTATACCTGGGACAATTGTATTT
2081.11e-05ATGTTGTGTTGCTGGTACTAGCTATTTA

Motif GCCGAS

StartP-valueSite
3571.49e-05GAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAA
2794.21e-05ACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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pORI00000070 100.0 29 0 0 263 291 477 449 2.75e-08 55