RefSeq NC_008351
DoriC accession number pORI00000206
OriC length 822 nt
OriC AT content 0.6606
The location of oriC region 1096..1917 nt
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OriC map
OriC sequences
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCGGCATGGTTGACCACTTTACATGCCAACTTTTAAGTTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTTAAAAAATCAACACTGGATTTGCTCAAATTTTTGCTTTTGGAAATAGCATATATTTATTTGGCTCATATTCGCGTTTTAAGAGCTTATATAAGTTTTTAGGCATAAAACTATATGAATTACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAAGGTATTTAAAATTTTAAAAATAAAAAAGCTACTAGCAAAAAACTAGTAGCTTAAATCTTAGTTAAATTTTGATGTAGTATTAATTTTTATATCTACGCTACAACGTCGATTCAAATTCGTGCAGTATTAATTTTTGTATCTGCGCCACAACGCCGATTACTAATAATGCAGTATTAATTTTTATATCTGTGCTACAACACCGATTACTTAAAACTAAGATAAAAAATCGACGAAGGTCGATAATGGTTTTGCACACGTCGATTTATCCGACGTATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTGTAACGATGAATTTTGGACTTGTAAAGCAATAACAATTGGGTTTACCAGGTCTACTAAGTAGACAAAAAAGAACACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGAAGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCGGCATGGTTGACCACTTTACATGCCAACTTTTAAGTTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTTAAAAAATCAACACTGGATTTGCTCAAATTTTTGCTTTTGGAAATAGCATATATTTATTTGGCTCATATTCGCGTTTTAAGAGCTTATATAAGTTTTTAGGCATAAAACTATATGAATTACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAAGGTATTTAAAATTTTAAAAATAAAAAAGCTACTAGCAAAAAACTAGTAGCTTAAATCTTAGTTAAATTTTGATGTAGTATTAATTTTTATATCTACGCTACAACGTCGATTCAAATTCGTGCAGTATTAATTTTTGTATCTGCGCCACAACGCCGATTACTAATAATGCAGTATTAATTTTTATATCTGTGCTACAACACCGATTACTTAAAACTAAGATAAAAAATCGACGAAGGTCGATAATGGTTTTGCACACGTCGATTTATCCGACGTATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTGTAACGATGAATTTTGGACTTGTAAAGCAATAACAATTGGGTTTACCAGGTCTACTAAGTAGACAAAAAAGAACACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGAAGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif RTGYAGTRTTWATTTWTRTATCTGHGCYACAACGBCRATTA

StartP-valueSite
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4456.47e-19ATTACTAATAATGCAGTATTAATTTTTATATCTGTGCTACAACACCGATTACTTAAAACTA
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71.18e-14CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAA
7637.27e-14CATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGA

Motif TGMCCMCT

StartP-valueSite
2562.32e-06ATCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAA
5581.41e-05GACGTATAAGTGCGCCCTTACGGGATTT
683.27e-05CCGGCATGGTTGACCACTTTACATGCCA
2365.98e-05ACTATATGAATTACCCCTAAATCTTTAA
817.89e-05CCACTTTACATGCCAACTTTTAAGTTTG

Motif GACGAAKGTCG

StartP-valueSite
5085.40e-08ATAAAAAATCGACGAAGGTCGATAATGGTTT
7171.54e-07TAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTG
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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