RefSeq NC_015173
DoriC accession number pORI00000324
OriC length 1032 nt
OriC AT content 0.7025
The location of oriC region 22637..23668 nt
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OriC map
OriC sequences
AATTTTAAATAGTTCTTGTGATAAAGTTTGTTAAAAAAGGAGGTATTAATTTGATATTTATATATATAATATTTTCGGCTATTTTACTTTATTATGCTTTAAAATATGGGATTAGAAATGGTTTTGTTGAACTTGAAGCGAATAAAGACGGTTTAGTTTATTATAAAAAAAGTGCGAGTTTACTTGAAGAGATAGGAAATATTTATAGTAGAGTTTCTACGTCTAAATCTAAAGAAGCGAAAGCTATCTATAATGAGGCTTTTGACATATTGCTTTCTGAAAAAAAGCCGAAGATTATATTTAAAGAATTAACTGAGAAGAAAGAAGAAATTTTTAAATTAAGTATAGACGACTAACTAGTTTTAAATGACGCATTTATGCTGAGAAAATTTATTGATCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGAAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGCGGCTCAACGTCAATAAAGCAATCTTGAGTATAACAATATTGTTAGTTTTGCCCCTTCTTTTCTTTGTTAACCTTAGTGTAAATAAGGTTTATGGAGGTTAGAAGTTATGCTTTTAGATATTTTAGGTTATGTATTTGGGATAGGTTTTATTGTATTTGGAATTTCAGCGTTAGTGATTTGCGGGTCTGAAGTTTATAAAGTTATAAGCAAAAGCAAGAAAAAAGGTGATTATAAAAAGAGTCTTTATTTTGCTGGATTCGCCATTATTTGCGCAATAGCTTTGATTATTATGGCTAGTGTTTTTTAGGTTTTAGAAACTAGTTTCTTTTTTCTTATTGTTAATAAAGTAATAATATCCTTATCTTTTTTAATTAGCTGATAATCCATGATATAACTAATGCAATCACTGAGATAACGAGAGTCACGTACATTAATGGGGCTACTTTTTCCACCATTTTTGTATATTCTTTATCTGGTTCTGTTGCAAAGTAAAAAAATATAGCTAACCACTAATATGTCATGTCAGTGTTCGT
AATTTTAAATAGTTCTTGTGATAAAGTTTGTTAAAAAAGGAGGTATTAATTTGATATTTATATATATAATATTTTCGGCTATTTTACTTTATTATGCTTTAAAATATGGGATTAGAAATGGTTTTGTTGAACTTGAAGCGAATAAAGACGGTTTAGTTTATTATAAAAAAAGTGCGAGTTTACTTGAAGAGATAGGAAATATTTATAGTAGAGTTTCTACGTCTAAATCTAAAGAAGCGAAAGCTATCTATAATGAGGCTTTTGACATATTGCTTTCTGAAAAAAAGCCGAAGATTATATTTAAAGAATTAACTGAGAAGAAAGAAGAAATTTTTAAATTAAGTATAGACGACTAACTAGTTTTAAATGACGCATTTATGCTGAGAAAATTTATTGATCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGAAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGCGGCTCAACGTCAATAAAGCAATCTTGAGTATAACAATATTGTTAGTTTTGCCCCTTCTTTTCTTTGTTAACCTTAGTGTAAATAAGGTTTATGGAGGTTAGAAGTTATGCTTTTAGATATTTTAGGTTATGTATTTGGGATAGGTTTTATTGTATTTGGAATTTCAGCGTTAGTGATTTGCGGGTCTGAAGTTTATAAAGTTATAAGCAAAAGCAAGAAAAAAGGTGATTATAAAAAGAGTCTTTATTTTGCTGGATTCGCCATTATTTGCGCAATAGCTTTGATTATTATGGCTAGTGTTTTTTAGGTTTTAGAAACTAGTTTCTTTTTTCTTATTGTTAATAAAGTAATAATATCCTTATCTTTTTTAATTAGCTGATAATCCATGATATAACTAATGCAATCACTGAGATAACGAGAGTCACGTACATTAATGGGGCTACTTTTTCCACCATTTTTGTATATTCTTTATCTGGTTCTGTTGCAAAGTAAAAAAATATAGCTAACCACTAATATGTCATGTCAGTGTTCGT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif SVSMRTWVCKTWVDTTATTADGSCTASTDTTWNWWAVGTTTTWGDA

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7706.09e-17CCATTATTTGCGCAATAGCTTTGATTATTATGGCTAGTGTTTTTTAGGTTTTAGAAACTAGTTTCT
9167.11e-16CTGAGATAACGAGAGTCACGTACATTAATGGGGCTACTTTTTCCACCATTTTTGTATATTCTTTAT
5492.46e-15TGTTAGTTTTGCCCCTTCTTTTCTTTGTTAACCTTAGTGTAAATAAGGTTTATGGAGGTTAGAAGT

Motif GCGGSTC

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6799.00e-06TTAGTGATTTGCGGGTCTGAAGTTTAT

Motif AAGCRAAAGC

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7048.47e-07ATAAAGTTATAAGCAAAAGCAAGAAAAAAG
The result of BLAST Download

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