RefSeq NC_008354
DoriC accession number pORI00000276
OriC length 1066 nt
OriC AT content 0.6867
The location of oriC region 937..2002 nt
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OriC map
OriC sequences
CAAAATATAAGTGCTAACAGCTGACCTCCCGATAACACCATGTAGTTATTGGGAGGTCAGCTGTTGAATTATGCACGAGTATTTTAAAAGTTATTGTGATGACGACGATAAACGATTATCAAAAGTATAATGTTAAAATGCTTTATTATACTAACGTTATATAAACAATATACTTTCGTTATACAAATTTTAACCCTGTTAGGAACTATAAAAAATCATGAAAATTTTAATTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTAAAAAATAGCCACTGGTTTTGCTTAAATTTTGTTTGTGAAATGAGAATATATTTATTTGGCTTATATTTGCGTTTTAAGAGCCAATATAAGTTTTTAGGTATAAAACTATATAAATTACCCTTAAATCTTTAAAATACCCCTTTAAAATGCAAAATAAGTATATTTGATTATCACATGTGTTTTTGAATTTAGCACGATACCATTTTGGTATGTAAGTGTGCCTTTGGATAAATAAAAAAAGTCCTGGTCTATAATAGACCAGGACTTTTTTATTTATCGTTAGACCGCAACACCATTAGTTGCTTGTTCGCCACGTTGACCATCAACTATGTCGAAATCTACGCTTTGTCCATCTTCTAAAGATTTATAGCCTTCTCCAACAATGTTAGAAAAGTGAACGAATACGTCGTTACCATTTTCTCTTTCGATGAAACCAAAACCTTTTTCTGAATTAAACCATTTTACTGTACCGTTATTCATATAGAATACCTCCGAGTGCTTTTGCACATAATATTTGTAACAATTTCATTTATAAAAAAGAGGATATTCTAGAAAAATACACTACAATTAAATTCACGAGCTTTTATTACGTTAGATTAAGTATACGCTTATTTATTGGATAAGTACATCTTTAGTTTTAAAAGCACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGTAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
CAAAATATAAGTGCTAACAGCTGACCTCCCGATAACACCATGTAGTTATTGGGAGGTCAGCTGTTGAATTATGCACGAGTATTTTAAAAGTTATTGTGATGACGACGATAAACGATTATCAAAAGTATAATGTTAAAATGCTTTATTATACTAACGTTATATAAACAATATACTTTCGTTATACAAATTTTAACCCTGTTAGGAACTATAAAAAATCATGAAAATTTTAATTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTAAAAAATAGCCACTGGTTTTGCTTAAATTTTGTTTGTGAAATGAGAATATATTTATTTGGCTTATATTTGCGTTTTAAGAGCCAATATAAGTTTTTAGGTATAAAACTATATAAATTACCCTTAAATCTTTAAAATACCCCTTTAAAATGCAAAATAAGTATATTTGATTATCACATGTGTTTTTGAATTTAGCACGATACCATTTTGGTATGTAAGTGTGCCTTTGGATAAATAAAAAAAGTCCTGGTCTATAATAGACCAGGACTTTTTTATTTATCGTTAGACCGCAACACCATTAGTTGCTTGTTCGCCACGTTGACCATCAACTATGTCGAAATCTACGCTTTGTCCATCTTCTAAAGATTTATAGCCTTCTCCAACAATGTTAGAAAAGTGAACGAATACGTCGTTACCATTTTCTCTTTCGATGAAACCAAAACCTTTTTCTGAATTAAACCATTTTACTGTACCGTTATTCATATAGAATACCTCCGAGTGCTTTTGCACATAATATTTGTAACAATTTCATTTATAAAAAAGAGGATATTCTAGAAAAATACACTACAATTAAATTCACGAGCTTTTATTACGTTAGATTAAGTATACGCTTATTTATTGGATAAGTACATCTTTAGTTTTAAAAGCACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGTAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA

AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GCHGABHWTYCGANAAVWTWTTGTGATTRTTRAGADDWMCGMTKWTCAA

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201.11e-18AGTGCTAACAGCTGACCTCCCGATAACACCATGTAGTTATTGGGAGGTCAGCTGTTGAATTATGCACGA
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741.65e-15TTGAATTATGCACGAGTATTTTAAAAGTTATTGTGATGACGACGATAAACGATTATCAAAAGTATAATG

Motif SCSASTGSTTTTGC

StartP-valueSite
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2639.73e-09CTAAAAAATAGCCACTGGTTTTGCTTAAATTTTG

Motif GWCSGC

StartP-valueSite
9671.31e-04GTAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAG
5381.31e-04TTTATCGTTAGACCGCAACACCATTA

The result of BLAST Download

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