RefSeq | NC_008354 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000276 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1066 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.6867 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 937..2002 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
CAAAATATAAGTGCTAACAGCTGACCTCCCGATAACACCATGTAGTTATTGGGAGGTCAGCTGTTGAATTATGCACGAGTATTTTAAAAGTTATTGTGATGACGACGATAAACGATTATCAAAAGTATAATGTTAAAATGCTTTATTATACTAACGTTATATAAACAATATACTTTCGTTATACAAATTTTAACCCTGTTAGGAACTATAAAAAATCATGAAAATTTTAATTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTAAAAAATAGCCACTGGTTTTGCTTAAATTTTGTTTGTGAAATGAGAATATATTTATTTGGCTTATATTTGCGTTTTAAGAGCCAATATAAGTTTTTAGGTATAAAACTATATAAATTACCCTTAAATCTTTAAAATACCCCTTTAAAATGCAAAATAAGTATATTTGATTATCACATGTGTTTTTGAATTTAGCACGATACCATTTTGGTATGTAAGTGTGCCTTTGGATAAATAAAAAAAGTCCTGGTCTATAATAGACCAGGACTTTTTTATTTATCGTTAGACCGCAACACCATTAGTTGCTTGTTCGCCACGTTGACCATCAACTATGTCGAAATCTACGCTTTGTCCATCTTCTAAAGATTTATAGCCTTCTCCAACAATGTTAGAAAAGTGAACGAATACGTCGTTACCATTTTCTCTTTCGATGAAACCAAAACCTTTTTCTGAATTAAACCATTTTACTGTACCGTTATTCATATAGAATACCTCCGAGTGCTTTTGCACATAATATTTGTAACAATTTCATTTATAAAAAAGAGGATATTCTAGAAAAATACACTACAATTAAATTCACGAGCTTTTATTACGTTAGATTAAGTATACGCTTATTTATTGGATAAGTACATCTTTAGTTTTAAAAGCACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGTAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
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AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif GCHGABHWTYCGANAAVWTWTTGTGATTRTTRAGADDWMCGMTKWTCAA
Motif SCSASTGSTTTTGC
Motif GWCSGC
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The result of BLAST |
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