RefSeq NC_008353
DoriC accession number pORI00000230
OriC length 894 nt
OriC AT content 0.6723
The location of oriC region 1096..1989 nt
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OriC map
OriC sequences
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTTTTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAATCGGCATGGTTGAGCAGTTTTTATGCCAATTTTTAAATTTGCATGTAACTGGGCAGTGTCTTAAAAAATCGACACTGGATTTGCTCAAATTTTTGTTTTTGGAAATAGCATATATTTATTTTGCTCATATTTGCATTTTAAGAGCTTATATAAGTTTTTAGGTATAAAACTATATGAATTACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAAGGTATTTAAAATTTAAAAAATAAAAAAGCTACTAGCAAAAAACTAGTTAATTTTGATGTAGTATTAATTTTTATATCTACGCTACAACGTCGATTCAAATTCGTGCAGTATTAATTTTTGTATCTGCGCCACAACGCCGATTACTAATAATGCAGTATTAATTTTTATATCTGTGCTGCAACACCGATTACTTAAAACTAAGATAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTTTTTGCACGCGTTCTTTTTAGAACGCATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTATAACGACGAAAATCAGACCTGTAAAGCGATAACTATTGTGATAAAGTTTGCTAAAAAGGAGTGATTCTATGGCTGCTATGTGGTTATCGATTATAGGTATGTGGTTTTGTATTGGAATGACATTTTTTGCTATCAAGGTTATTAAAAATAAAAATTAGACTACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTTTTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAATCGGCATGGTTGAGCAGTTTTTATGCCAATTTTTAAATTTGCATGTAACTGGGCAGTGTCTTAAAAAATCGACACTGGATTTGCTCAAATTTTTGTTTTTGGAAATAGCATATATTTATTTTGCTCATATTTGCATTTTAAGAGCTTATATAAGTTTTTAGGTATAAAACTATATGAATTACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAAGGTATTTAAAATTTAAAAAATAAAAAAGCTACTAGCAAAAAACTAGTTAATTTTGATGTAGTATTAATTTTTATATCTACGCTACAACGTCGATTCAAATTCGTGCAGTATTAATTTTTGTATCTGCGCCACAACGCCGATTACTAATAATGCAGTATTAATTTTTATATCTGTGCTGCAACACCGATTACTTAAAACTAAGATAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTTTTTGCACGCGTTCTTTTTAGAACGCATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTATAACGACGAAAATCAGACCTGTAAAGCGATAACTATTGTGATAAAGTTTGCTAAAAAGGAGTGATTCTATGGCTGCTATGTGGTTATCGATTATAGGTATGTGGTTTTGTATTGGAATGACATTTTTTGCTATCAAGGTTATTAAAAATAAAAATTAGACTACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif RTGYAGTRTTWATTTWTRTWTCTGHGCYDCAACGBCRATTA

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8356.45e-14CATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGA

Motif GCSCCC

StartP-valueSite
2571.31e-05TCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCA
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Motif MGACGAADRTC

StartP-valueSite
4914.15e-08GATAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTT
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7889.95e-07CTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGT
The result of BLAST Download

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