RefSeq NC_007768
DoriC accession number pORI00000201
OriC length 686 nt
OriC AT content 0.6895
The location of oriC region 1015..1700 nt
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OriC map
OriC sequences
AGTGTTGGTCTTAGACTGACACTTTTTTATTGTTAAATATATGGTCGCCTGCCTCTGTGGGAACTATAAAAAATGTATGCAAATTAATTTGCATGTAGATGGGCAGTATTGAAACTAATACTGATAAGTTACAACGATATTAGGTTGATTTTAAAATTGTTGAACGTGTCCGATTTCTACAAGCTAAGAGTAAATACAGAAAAGGCTACATTTAAGGTACAAAAAGCTTACAAGTGATTTACGATTTAAATGTAGTTAAGTTGTATCGTTTTGGTTAATAAAAATGTAGTGTTATAACATGCTTTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTATGTATGTTTTTAGGTATAAAACTATATGATTTACACTTAAAACTTTAAAATACCCCTTTAGAATTAAAATTAAGGGCATTTAAGATTTAACAAAATAAAAAAAGCCACCAATAAAATTTGGTGGCTTTTTTTATTTTTGGAAGTGAACAGTGAAAACAAAACAGAACGTTAATTAAATTATAACACGCTTTTATGCCGAGAAAATTTATTGATCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGTAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
AGTGTTGGTCTTAGACTGACACTTTTTTATTGTTAAATATATGGTCGCCTGCCTCTGTGGGAACTATAAAAAATGTATGCAAATTAATTTGCATGTAGATGGGCAGTATTGAAACTAATACTGATAAGTTACAACGATATTAGGTTGATTTTAAAATTGTTGAACGTGTCCGATTTCTACAAGCTAAGAGTAAATACAGAAAAGGCTACATTTAAGGTACAAAAAGCTTACAAGTGATTTACGATTTAAATGTAGTTAAGTTGTATCGTTTTGGTTAATAAAAATGTAGTGTTATAACATGCTTTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTATGTATGTTTTTAGGTATAAAACTATATGATTTACACTTAAAACTTTAAAATACCCCTTTAGAATTAAAATTAAGGGCATTTAAGATTTAACAAAATAAAAAAAGCCACCAATAAAATTTGGTGGCTTTTTTTATTTTTGGAAGTGAACAGTGAAAACAAAACAGAACGTTAATTAAATTATAACACGCTTTTATGCCGAGAAAATTTATTGATCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGTAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GGTYSCSWGSCTC

StartP-valueSite
438.26e-10TTAAATATATGGTCGCCTGCCTCTGTGGGAACT
6441.19e-08GATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATA

Motif GSTHTTADRCYGAS

StartP-valueSite
6036.42e-09CATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAA
5243.13e-08ATTATAACACGCTTTTATGCCGAGAAAATTTATT
71.19e-07AGTGTTGGTCTTAGACTGACACTTTTTTAT

Motif MCCCTT

StartP-valueSite
3902.98e-05CTTTAAAATACCCCTTTAGAATTAAA
5621.12e-04GTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000201 100.0 686 0 0 1 686 1 686 0.0 1267
pORI00000277 98.266 173 2 1 515 686 387 559 0.0 302
pORI00000232 99.394 165 1 0 522 686 969 1133 0.0 300
pORI00000232 87.611 113 14 0 304 416 170 282 1.07e-31 132
pORI00000276 97.701 174 2 2 515 686 893 1066 0.0 298
pORI00000203 95.676 185 6 2 503 686 669 852 0.0 296
pORI00000203 86.842 114 13 2 304 416 172 284 4.96e-30 126
pORI00000274 81.356 413 32 27 304 686 172 569 0.0 294
pORI00000230 96.571 175 5 1 512 686 721 894 0.0 289
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pORI00000099 90.265 113 11 0 304 416 171 283 1.06e-36 148
pORI00000186 97.561 164 3 1 519 682 533 371 0.0 279
pORI00000145 94.857 175 9 0 512 686 692 866 0.0 274
pORI00000145 86.861 137 15 3 304 439 173 307 2.94e-37 150
pORI00000324 97.368 152 4 0 522 673 370 521 0.0 259
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pORI00000325 92.899 169 12 0 517 685 159 327 0.0 246
pORI00000326 93.333 165 11 0 522 686 148 312 0.0 244
pORI00000323 94.231 156 9 0 527 682 264 109 0.0 239
pORI00000215 95.89 146 5 1 527 672 605 461 0.0 235
pORI00000327 93.082 159 11 0 528 686 1306 1148 0.0 233