RefSeq NC_007770
DoriC accession number pORI00000145
OriC length 880 nt
OriC AT content 0.6693
The location of oriC region 1096..1975 nt
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OriC map
OriC sequences
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCGGCATGGTTGCCCAGTTTTACTATGAAAATTTTAATTTGCATGTAGATGGGCAGTGTCTTAAAAAATTCGACACTGGTTTTGCTCAAATTTTTGTTTTTGGAAATAGCATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTATATAAGTTTTCAGGCATAAAACTATATGAATTACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAAGGTATTTAAAATTTTAAAAATAAAAAAGCTACTAGCAAAAAACTAGTAGCTTAAACCTTAGTTAAATTTTGATGTAGTATTAATTTTTATATCTACGCTACAACGTCGATTCAAATTCGTGCAGTATTAATTTTTATATCTGTGCTGCAACACCGATTACTTAAAACTAAGATTAAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTTTTTACACGCGTTCTTTTAGAACGCATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTATAACGATGAAAAATAGACCTGTAAAGTGATAACTATTGTGATAAAGTTTGCTAAAAAGGAGCGATTTTATGACTGCTATTTGGATATCGATTATAGGTATGTGGTTTTGTATTGGAATGGCGTTTTTTGCTATCAAGAGGAGTAAAAATAAAAAATAGAACACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGTGCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGGCAAGTTTTGGGATCGTTAAGGGTTCGGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTGGAATAAAGAAA
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCGGCATGGTTGCCCAGTTTTACTATGAAAATTTTAATTTGCATGTAGATGGGCAGTGTCTTAAAAAATTCGACACTGGTTTTGCTCAAATTTTTGTTTTTGGAAATAGCATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTATATAAGTTTTCAGGCATAAAACTATATGAATTACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAAGGTATTTAAAATTTTAAAAATAAAAAAGCTACTAGCAAAAAACTAGTAGCTTAAACCTTAGTTAAATTTTGATGTAGTATTAATTTTTATATCTACGCTACAACGTCGATTCAAATTCGTGCAGTATTAATTTTTATATCTGTGCTGCAACACCGATTACTTAAAACTAAGATTAAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTTTTTACACGCGTTCTTTTAGAACGCATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTATAACGATGAAAAATAGACCTGTAAAGTGATAACTATTGTGATAAAGTTTGCTAAAAAGGAGCGATTTTATGACTGCTATTTGGATATCGATTATAGGTATGTGGTTTTGTATTGGAATGGCGTTTTTTGCTATCAAGAGGAGTAAAAATAAAAAATAGAACACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGTGCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGGCAAGTTTTGGGATCGTTAAGGGTTCGGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTGGAATAAAGAAA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif VRTGTWGTATTADWWTDTATATBTDYGCYVYWACGNSRATT

StartP-valueSite
3981.01e-16GATTCAAATTCGTGCAGTATTAATTTTTATATCTGTGCTGCAACACCGATTACTTAAAACT
3512.05e-16GTTAAATTTTGATGTAGTATTAATTTTTATATCTACGCTACAACGTCGATTCAAATTCGTG
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64.14e-13CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCA
6431.35e-12ATAGGTATGTGGTTTTGTATTGGAATGGCGTTTTTTGCTATCAAGAGGAGTAAAAATAAAA

Motif AASMCGMATDTWKGCCNAG

StartP-valueSite
562.73e-10TATAGCGTTCAACCGGCATGGTTGCCCAGTTTTACTATG
6991.82e-09TAAAAAATAGAACACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATT
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7891.51e-08GTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGGCAAGTTTTGGGATC

Motif MCCCCT

StartP-valueSite
2592.12e-05CTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAA
2397.05e-05TATATGAATTACCCCTAAATCTTTAA
The result of BLAST Download

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