RefSeq NC_008356
DoriC accession number pORI00000024
OriC length 837 nt
OriC AT content 0.6607
The location of oriC region 1096..1932 nt
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OriC map
OriC sequences
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCGGCATGGTTGACCACTTTACATGCCAACTTTTAAGTTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTTAAAAAATCAACACTGGATTTGCTCAAATTTTTGCTTTTGGAAATAGCATATATTTATTTGGCTCATATTCGCGTTTTAAGAGCTTATATAAGTTTTTAGGCATAAAACTATATGAATTACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAAGGTATTTAAAATTTAAAAATAAAAAGCTACTAGTAGCTTAAATCTTAGTTAAATTTTGATGTAGTATTAATTTTTATATCTACGCTACAACGTCGATTCAAATTCGTGCAGTATTAATTTTTGTATCTGCGCCACAACGCCGATTACTAATAATGCAGTATTAATTTTTATATCTGTGCTACAACACCGATTACTTAAAACTAAGATAAAAAATCGACGAAGGTCGATAATGGTTTTGCACACGTCGATTTATCCGACGTATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTGTAACGATGAATTTTGGACTTGTAAAGCAATAACAATTGGGTTTACCAGGTCTACTAAGTAGACAAAAAAGAACACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGAAGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCGGCATGGTTGACCACTTTACATGCCAACTTTTAAGTTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTTAAAAAATCAACACTGGATTTGCTCAAATTTTTGCTTTTGGAAATAGCATATATTTATTTGGCTCATATTCGCGTTTTAAGAGCTTATATAAGTTTTTAGGCATAAAACTATATGAATTACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAAGGTATTTAAAATTTAAAAATAAAAAGCTACTAGTAGCTTAAATCTTAGTTAAATTTTGATGTAGTATTAATTTTTATATCTACGCTACAACGTCGATTCAAATTCGTGCAGTATTAATTTTTGTATCTGCGCCACAACGCCGATTACTAATAATGCAGTATTAATTTTTATATCTGTGCTACAACACCGATTACTTAAAACTAAGATAAAAAATCGACGAAGGTCGATAATGGTTTTGCACACGTCGATTTATCCGACGTATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTGTAACGATGAATTTTGGACTTGTAAAGCAATAACAATTGGGTTTACCAGGTCTACTAAGTAGACAAAAAAGAACACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGAAGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif RTGYAGTRTTWATTTWTRTATCTGHGCYACAACGBCRATTA

StartP-valueSite
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3381.79e-18TTAAATTTTGATGTAGTATTAATTTTTATATCTACGCTACAACGTCGATTCAAATTCGTGC
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7507.53e-14CATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGA

Motif GCAATTGGAAT

StartP-valueSite
8203.92e-07TTGGAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
8063.92e-07TTGGAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTG
7923.92e-07CGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTG

Motif TGMCCMCT

StartP-valueSite
2562.14e-06ATCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAA
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817.48e-05CCACTTTACATGCCAACTTTTAAGTTTG
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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