RefSeq NC_007769
DoriC accession number pORI00000232
OriC length 1133 nt
OriC AT content 0.6876
The location of oriC region 1096..2228 nt
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OriC map
OriC sequences
CTAAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTTTTTAGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCAGCATGGTTGCCCAGTTTTTATGCCAATTTTTAAATTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTAAAAATCATTCACTGGTTTTGATCAAATTTTAGTTGGTGTAAGTAAAATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCCGATATACGTTTTTAGGTATAAAACTATTTGATTTACCCCTAATTCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAAAATTGAGATAGCTTTTTTCTTTCGTACGGTCTGTTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGGAATTCAAAAAAGTTATGGGCTATAAATCTACATCACTTTTTCAAGAATGTAGTAGCAATATTCAAGACAAATTAATTTTTATAACTGCTCGGAATATCTCAAGCCGTTTCTTTAATTTTGAAATAAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTTTTTACACGCGTTCTTTTAGAACGTATAAGTGCGCCCTTACGGGAATTAACTAGATTATAACGATGAAAAATAGACCTGTAAAGCGATAACTACTGTGATAAATTTTGTTAAAAAAGGAGGTATTAATTTGATATTTATATATATAATATTTTCGGCTATTGTACTTTATTACGCTTTAAAATATGGAATTAGAAATGGTTTTGTTGACCTTGAAGCGAATAAAGAAGGCTTAGTTTACTATAAAAAAAGCGCTAGTTTACTTGAAGAGATAGGAAATATTTATAGTAGAGTTTCTATATCTAAATCTAAAGAAGCGAAAGCTATCTATAATGAGGCTTTTGACATATTACTTTCTGAAAAAAAGCCGAAAATTATATTTAAAGAATTAACTGATAAGAAAGAAGAAATTTTTAAATTAAGTATAGATGATTAACTAGCTTTAAATGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGTAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
CTAAAAAGCTAGCGTTTTTTTATGTTTTTAGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCAGCATGGTTGCCCAGTTTTTATGCCAATTTTTAAATTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTAAAAATCATTCACTGGTTTTGATCAAATTTTAGTTGGTGTAAGTAAAATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCCGATATACGTTTTTAGGTATAAAACTATTTGATTTACCCCTAATTCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAAAATTGAGATAGCTTTTTTCTTTCGTACGGTCTGTTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGGAATTCAAAAAAGTTATGGGCTATAAATCTACATCACTTTTTCAAGAATGTAGTAGCAATATTCAAGACAAATTAATTTTTATAACTGCTCGGAATATCTCAAGCCGTTTCTTTAATTTTGAAATAAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTTTTTACACGCGTTCTTTTAGAACGTATAAGTGCGCCCTTACGGGAATTAACTAGATTATAACGATGAAAAATAGACCTGTAAAGCGATAACTACTGTGATAAATTTTGTTAAAAAAGGAGGTATTAATTTGATATTTATATATATAATATTTTCGGCTATTGTACTTTATTACGCTTTAAAATATGGAATTAGAAATGGTTTTGTTGACCTTGAAGCGAATAAAGAAGGCTTAGTTTACTATAAAAAAAGCGCTAGTTTACTTGAAGAGATAGGAAATATTTATAGTAGAGTTTCTATATCTAAATCTAAAGAAGCGAAAGCTATCTATAATGAGGCTTTTGACATATTACTTTCTGAAAAAAAGCCGAAAATTATATTTAAAGAATTAACTGATAAGAAAGAAGAAATTTTTAAATTAAGTATAGATGATTAACTAGCTTTAAATGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGTAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif MGSCNYWDCGKSAAY

StartP-valueSite
302.97e-09TTATGTTTTTAGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTC
5546.72e-09CGTATAAGTGCGCCCTTACGGGAATTAACTAGATT
10378.21e-08AGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCG
3531.62e-07TTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGGAATTCAAA
10982.92e-07AAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTG

Motif AAGCCG

StartP-valueSite
10567.04e-05GTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAC
8847.04e-05TTCTGAAAAAAAGCCGAAAATTATAT
4707.04e-05GGAATATCTCAAGCCGTTTCTTTAAT
1971.06e-04TGCGTTTTAAGAGCCGATATACGTTT
9771.75e-04TGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTA

Motif TRCCCC

StartP-valueSite
2966.61e-05AAATAAAAGCTACCCCAAAATTGAGA
2546.61e-05TTCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTC
2356.61e-05CTATTTGATTTACCCCTAATTCTTTA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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pORI00000024 98.182 165 2 1 969 1133 646 809 0.0 287
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pORI00000145 96.364 165 6 0 969 1133 702 866 0.0 272
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pORI00000276 97.765 179 2 2 957 1133 888 1066 0.0 307
pORI00000276 87.113 194 23 2 84 277 222 413 0.0 219
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pORI00000274 98.182 165 2 1 969 1133 406 569 0.0 287
pORI00000201 99.394 165 1 0 969 1133 522 686 0.0 300
pORI00000201 87.611 113 14 0 170 282 304 416 1.78e-31 132
pORI00000036 98.758 161 1 1 969 1129 269 428 0.0 285
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pORI00000327 93.082 159 11 0 975 1133 1306 1148 0.0 233