| RefSeq | NC_019146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | pORI00000099 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 980 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.6663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 1097..2076 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCAGCATGGTTGCCCAGTTTTTATGCCAATTTTTAAATTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTCAAAAATTCGACACTGGTTTTGCTCAAATTTTAATTGGTGTAATTAAAATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTATATACGTTTTTAGGTATAAAACTATATGATTTACCCCTAATTCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAAAATTGAGATAGCTTTTTTCTTTCGTACGGTCTGTTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGGAATTCAAAAAAGTTATGGGCTATAAATCTACATCACTTTTTCAAGAATGTAGTAGCAATATTCAAGACAAATTAATTTTTATAACTGCTCGGAATATCTCAAGCCGTTTCTTTAATTTTGAAATAAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTTTTTACACGCGTTCTTTTAGAACGCATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTATAACGACGAAAATCAGACCTGTAAAGCGATAACTATTGTGCTAAAGTTTGCTAAAAAGGAGTTTTGAAGTTGAAAAAAACAGAACGTAATTTATTTTCTATTTTCTTATCTTTAGGAAGTCTTTTTGCTATCTTTAGTGGTTTCTTTATTTTGGGCATTGGAATGTTAATTGGTGGAGCAACTTTATTAGCTAAAAGTATTTCTGAAGAATAAAAGCGTTGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGTGCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTATGTTATTGATT
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCAGCATGGTTGCCCAGTTTTTATGCCAATTTTTAAATTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTCAAAAATTCGACACTGGTTTTGCTCAAATTTTAATTGGTGTAATTAAAATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTATATACGTTTTTAGGTATAAAACTATATGATTTACCCCTAATTCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAAAATTGAGATAGCTTTTTTCTTTCGTACGGTCTGTTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGGAATTCAAAAAAGTTATGGGCTATAAATCTACATCACTTTTTCAAGAATGTAGTAGCAATATTCAAGACAAATTAATTTTTATAACTGCTCGGAATATCTCAAGCCGTTTCTTTAATTTTGAAATAAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTTTTTACACGCGTTCTTTTAGAACGCATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTATAACGACGAAAATCAGACCTGTAAAGCGATAACTATTGTGCTAAAGTTTGCTAAAAAGGAGTTTTGAAGTTGAAAAAAACAGAACGTAATTTATTTTCTATTTTCTTATCTTTAGGAAGTCTTTTTGCTATCTTTAGTGGTTTCTTTATTTTGGGCATTGGAATGTTAATTGGTGGAGCAACTTTATTAGCTAAAAGTATTTCTGAAGAATAAAAGCGTTGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGTGCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTATGTTATTGATT
AT-rich region
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| The information of repeat sequences |
Motif TRCCCC
Motif GCSDTDDCDWKARCKWTKAAVYARAMWDDTHGACVARTKTY
Motif KGSATTKDAMDVGGTWNYGWCGMWVAAADTCAAWAMWGKWATKGG
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| The result of BLAST |
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