RefSeq | NC_019146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000099 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 980 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.6663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 1097..2076 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCAGCATGGTTGCCCAGTTTTTATGCCAATTTTTAAATTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTCAAAAATTCGACACTGGTTTTGCTCAAATTTTAATTGGTGTAATTAAAATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTATATACGTTTTTAGGTATAAAACTATATGATTTACCCCTAATTCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAAAATTGAGATAGCTTTTTTCTTTCGTACGGTCTGTTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGGAATTCAAAAAAGTTATGGGCTATAAATCTACATCACTTTTTCAAGAATGTAGTAGCAATATTCAAGACAAATTAATTTTTATAACTGCTCGGAATATCTCAAGCCGTTTCTTTAATTTTGAAATAAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTTTTTACACGCGTTCTTTTAGAACGCATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTATAACGACGAAAATCAGACCTGTAAAGCGATAACTATTGTGCTAAAGTTTGCTAAAAAGGAGTTTTGAAGTTGAAAAAAACAGAACGTAATTTATTTTCTATTTTCTTATCTTTAGGAAGTCTTTTTGCTATCTTTAGTGGTTTCTTTATTTTGGGCATTGGAATGTTAATTGGTGGAGCAACTTTATTAGCTAAAAGTATTTCTGAAGAATAAAAGCGTTGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGTGCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTATGTTATTGATT
CTTAAAAGCTAGCGTTTTTTATGTATTTTTGCCCCTGCGGGAACTATAGCGTTCAACCAGCATGGTTGCCCAGTTTTTATGCCAATTTTTAAATTTGCATGTAAATGGGCAGTGTCTCAAAAATTCGACACTGGTTTTGCTCAAATTTTAATTGGTGTAATTAAAATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTATATACGTTTTTAGGTATAAAACTATATGATTTACCCCTAATTCTTTAAAATGCCCCCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAAAATTGAGATAGCTTTTTTCTTTCGTACGGTCTGTTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGGAATTCAAAAAAGTTATGGGCTATAAATCTACATCACTTTTTCAAGAATGTAGTAGCAATATTCAAGACAAATTAATTTTTATAACTGCTCGGAATATCTCAAGCCGTTTCTTTAATTTTGAAATAAAAAAATCGACGAAGGTCGATTATGGTTTTTACACGCGTTCTTTTAGAACGCATAAGTGCGCCCTTACGGGATTTAACTAGATTATAACGACGAAAATCAGACCTGTAAAGCGATAACTATTGTGCTAAAGTTTGCTAAAAAGGAGTTTTGAAGTTGAAAAAAACAGAACGTAATTTATTTTCTATTTTCTTATCTTTAGGAAGTCTTTTTGCTATCTTTAGTGGTTTCTTTATTTTGGGCATTGGAATGTTAATTGGTGGAGCAACTTTATTAGCTAAAAGTATTTCTGAAGAATAAAAGCGTTGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGTGCGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCAATTATGTTATTGATT
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif TRCCCC
Motif GCSDTDDCDWKARCKWTKAAVYARAMWDDTHGACVARTKTY
Motif KGSATTKDAMDVGGTWNYGWCGMWVAAADTCAAWAMWGKWATKGG
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The result of BLAST |
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