RefSeq NC_017946.1
DoriC accession number aORI10010121
OriC length 858 nt
OriC AT content 0.6795
The location of oriC region 227904..228761 nt
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OriC map
OriC sequences
TTCTTTCTTCACCTTTTGAGTAATAATTGAGCGTCTCGCTATTATTATAAGTATTTGAGCATTTCTATCTTTATCGAAAAACCCCCAGAGTTTCATTTCCACTGGAACTCCACGAGAGAGGTATCCCACAAAATTTTTGACGATACAAAATATGTAAAGAATATGACAGCGTCATGTTTACAATTGTAAAGTAAACAATGTTCATATAATGTACATTTTTGTACACCAACTTTGTATGTTTTTTCAGTAAAAAATTTTAGACATTTATAAGCTGTTCATAGATAAATATTTAAATAGGAAGTCGATCTAATAGGGGAGAGTGTTTGTTTCACAAGAGAAAATAAAAATTTTCTATGGTGTTTGCCGCCGAGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGGTTTCACTTCTGTTTAATTTTACATGATATGTAAACCAAATCTTTTAACAAAATTGGACATATTTGCTCAAAAATGGATTTATTTTGTTGGACAAATATGTCCAATTGGACTCCACTGGAAATCGGGAACTCCTTTACATTTGGAAATCAACTAAAGTGAACAGATTAGTTCATTCGAGTAGTTTTTCTTATGAAATGATTTCAAATGAGATTATACTCAATTATATATTTGACATGTGAATGTTTAAGCAAAGCATAAAAACTCTCAGTGAGATATCAACGTTGCTTTCCACTGGTTCGTGTGGTTCGTGTGGAAAGACTTAAATATATATGTCATATGGGGGATTTGAGTATAACTTAATGTCATATTTAATGGTGTCTATTTAACAATATGTGTTCCATTTCCACTGGAAACACAGGTCATGTAATTAAAAAGCATAATTTCCACTGGAGGGACATCA
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ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif RASKTYVATTTCCACTGG

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Motif TGDACAWATTTGTWCA

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2101.28e-07GTTCATATAATGTACATTTTTGTACACCAACTTTGT

Motif CTCCAC

StartP-valueSite
5085.36e-05TCCAATTGGACTCCACTGGAAATCGG
1085.36e-05TCCACTGGAACTCCACGAGAGAGGTA
The result of BLAST Download

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aORI10010307 72.738 829 163 49 62 855 4 804 0.0 220
aORI10010307 96.875 32 1 0 370 401 51 20 8.68e-09 55
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