RefSeq NC_015474.1
DoriC accession number aORI10010101
OriC length 786 nt
OriC AT content 0.6819
The location of oriC region 579324..580109 nt
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OriC map
OriC sequences
TGATGACCCTCCAGTGGAAATCATGCTTTTAAAGGACATGCCCTTAATTTCCAATGGAAATATAACACTAGATGATAGCTATTTTTCAATTTGTGTAGCTAAATGTAACAATTAATGCTAAATTCAACACATCACGTAAATTACTTCCATAGGAAGCATTGGAACCAGTGGAAAGCAACGTGAGATTTAACATCATGGTTTTTATCCTTTGCTCCCAAACATGTGAAAAAAGTTTCATCGGAAAGACAAGTTTGAATACACAATTCTGTGTAATTGAGGTTTACGTTCAACAACTCCACTAACCGATTTCCTTTGGAATTTTAACGAACATATATGTGCATTCAAAAATATACATCTTTACTCAAATGTGAATATTAAGTTAACTTAATTCGCTTAATTTTTCATAGAAGTTAAACAGAGTTGAAGTCCCCCAGAGTTTCATTTCCAGTGGAACTCGGCGGAGACACCGACATATAATTAATTTTTTATCTCTGAGAAGACACTCTCCCATATTAGTTGGATCTCCTATTTAAATATTTTTCTATAAAAAATTTGAAATTAGCTTATAAAGAGAATGAACAAAAACAAAAAATAAATGCACAGATGTATACATTTGATGAAAATCTGTATATTTACAAAAATAAATCATTTTGGAACTGAATTTTACATATGTAAAAATTCTCGAGGGAGAGGATGTGAATAGTATGCATACCCTTCTCGACTAAGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGTTTTTCGAAATATATAGAAACGATAAGATGAAAG
TGATGACCCTCCAGTGGAAATCATGCTTTTAAAGGACATGCCCTTAATTTCCAATGGAAATATAACACTAGATGATAGCTATTTTTCAATTTGTGTAGCTAAATGTAACAATTAATGCTAAATTCAACACATCACGTAAATTACTTCCATAGGAAGCATTGGAACCAGTGGAAAGCAACGTGAGATTTAACATCATGGTTTTTATCCTTTGCTCCCAAACATGTGAAAAAAGTTTCATCGGAAAGACAAGTTTGAATACACAATTCTGTGTAATTGAGGTTTACGTTCAACAACTCCACTAACCGATTTCCTTTGGAATTTTAACGAACATATATGTGCATTCAAAAATATACATCTTTACTCAAATGTGAATATTAAGTTAACTTAATTCGCTTAATTTTTCATAGAAGTTAAACAGAGTTGAAGTCCCCCAGAGTTTCATTTCCAGTGGAACTCGGCGGAGACACCGACATATAATTAATTTTTTATCTCTGAGAAGACACTCTCCCATATTAGTTGGATCTCCTATTTAAATATTTTTCTATAAAAAATTTGAAATTAGCTTATAAAGAGAATGAACAAAAACAAAAAATAAATGCACAGATGTATACATTTGATGAAAATCTGTATATTTACAAAAATAAATCATTTTGGAACTGAATTTTACATATGTAAAAATTCTCGAGGGAGAGGATGTGAATAGTATGCATACCCTTCTCGACTAAGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGTTTTTCGAAATATATAGAAACGATAAGATGAAAG
TGATGACCCTCCAGTGGAAATCATGCTTTTAAAGGACATGCCCTTAATTTCCAATGGAAATATAACACTAGATGATAGCTATTTTTCAATTTGTGTAGCTAAATGTAACAATTAATGCTAAATTCAACACATCACGTAAATTACTTCCATAGGAAGCATTGGAACCAGTGGAAAGCAACGTGAGATTTAACATCATGGTTTTTATCCTTTGCTCCCAAACATGTGAAAAAAGTTTCATCGGAAAGACAAGTTTGAATACACAATTCTGTGTAATTGAGGTTTACGTTCAACAACTCCACTAACCGATTTCCTTTGGAATTTTAACGAACATATATGTGCATTCAAAAATATACATCTTTACTCAAATGTGAATATTAAGTTAACTTAATTCGCTTAATTTTTCATAGAAGTTAAACAGAGTTGAAGTCCCCCAGAGTTTCATTTCCAGTGGAACTCGGCGGAGACACCGACATATAATTAATTTTTTATCTCTGAGAAGACACTCTCCCATATTAGTTGGATCTCCTATTTAAATATTTTTCTATAAAAAATTTGAAATTAGCTTATAAAGAGAATGAACAAAAACAAAAAATAAATGCACAGATGTATACATTTGATGAAAATCTGTATATTTACAAAAATAAATCATTTTGGAACTGAATTTTACATATGTAAAAATTCTCGAGGGAGAGGATGTGAATAGTATGCATACCCTTCTCGACTAAGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGTTTTTCGAAATATATAGAAACGATAAGATGAAAG
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CCAGTGGAAATC

StartP-valueSite
112.86e-08TGATGACCCTCCAGTGGAAATCATGCTTTTAA
4454.11e-08AGTTTCATTTCCAGTGGAACTCGGCGGAGACA
1655.55e-08AGCATTGGAACCAGTGGAAAGCAACGTGAGAT
7298.42e-08CGACTAAGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGG
516.86e-07CCCTTAATTTCCAATGGAAATATAACACTAGA

Motif CTCCCA

StartP-valueSite
5057.37e-05AGAAGACACTCTCCCATATTAGTTGG
2127.37e-05TTATCCTTTGCTCCCAAACATGTGAA
4281.11e-04GAGTTGAAGTCCCCCAGAGTTTCATT
5234.04e-04TTAGTTGGATCTCCTATTTAAATATT
1444.04e-04ACGTAAATTACTTCCATAGGAAGCAT

Motif TGTGDAWHTDAAKTTWAC

StartP-valueSite
2673.54e-09TACACAATTCTGTGTAATTGAGGTTTACGTTCAACAAC
6501.25e-08AATAAATCATTTTGGAACTGAATTTTACATATGTAAAA
921.67e-08TTTTTCAATTTGTGTAGCTAAATGTAACAATTAATGCT
3678.09e-08TTTACTCAAATGTGAATATTAAGTTAACTTAATTCGCT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010101 100.0 786 0 0 1 786 1 786 0.0 1452
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aORI10010307 83.942 137 17 5 408 543 365 233 1.66e-30 126
aORI10010307 90.196 51 5 0 724 774 52 2 1.02e-12 68
aORI10010121 93.75 48 3 0 725 772 109 62 2.19e-14 73
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aORI10010295 90.196 51 5 0 724 774 52 2 1.02e-12 68
aORI10010295 96.875 32 1 0 725 756 319 350 7.93e-09 55
aORI10010262 100.0 30 0 0 726 755 197 168 2.21e-09 57
aORI10010369 90.476 42 3 1 725 766 173 133 7.93e-09 55
aORI10010003 91.892 37 3 0 428 464 733 697 2.85e-08 53