RefSeq | NZ_CP010835.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010295 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 808 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.3317 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 30574..31381 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
ACGTTTCTATTTTTATCTTAAAACCCCCAGAGTTTCATTTCCACTGGAACTTCTCTGGGAAGGTATCTACCAAAAATTTTCCTGAGAGCTCGGATATTTACAAACTCACACTATATGACACATGTCATCTTTACATTTATCAACAAACATTTGTTTATTTAATGTACATTTTTGTACATTTAAATTATTCATTTTTTCATTAGAAGCATTACTTCACTTATAAAATGTTCAGAGAAAATTATTTAAATAGAAGATCGAGCTAATATGGGAGAGTGTTTGTAATGGATAAAAATTAATTATTCTGGGTGTTTGCCCGCGAGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGGTTTCACTTCTGTTTAACTTTAACTGAGCTTTTAATCGAATATGCTTAACAAAATTGGGCAAAAGTGAGTAACAATGTCTTAGTTTTTATGTACAAATTTGTTCATTGGATTTCCACAGGAAATTTTCTTGTACATTGGCCTTTGTAAACCATATCTCGTGGAGCATCCTGGAGCTCTTGAGGAATTTCTTGTGAAAGTTTTTCATATGAAATATATTTCAAATTTTATTTTGACATGCATGTGTATAAGCAAAACATAAAAACTCCGAGTGAAAGATAACCGTTGCTTTCCACTGGTTCGTGTGCTTCCTGTGGAAATAATACTCATGATGTGACAGTTTCACCTGAAAATCATGTCTTAATGTCACACTCATTTAAAGCTAATTAACAAAATGAGTTTCGTTTCCAGTGGAAATGAAGGTCATGTCATTAAAAAGCATGATTTCCAATGGAGGGACACCG
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ORB
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif TTCCASTGGAAAT
Motif AAACTCMSAS
Motif TCTGGG
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The result of BLAST |
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