RefSeq | NC_018092.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010186 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 881 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.6822 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 1479769..1480649 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TGATGACCCTCCATTGGAAATTGTGCTCCTAGATTATTATAGATCAATTTTCCAGAGGAAACATAACACATGTTGTTAATTTTTCCCCCATCCATATAACTAAATGTAATAATTTAGTTATGATAAATGCCATAGATATATAGTATCTCCATTGGAAATAGAGGAAACATTGGAAAGGCAACTATTCCTTTAACTGTTGAGTTTTTATCCTTTGCTTGACAAAAACATGTCAATATTTTCCAGTGGAAGTTCCACACCCAGCCCAAAACTTCCACAGGAAATGAGATAAGCGAATGAACATCTTTGGACATTTGATGTTTACATATTTCTACAGGAACTTCAGATTTCCTGTGGAGACAAAATGAACATTTATGGTCATTAAAATTTGTTCATTATTGCACCTTTTAGTTCATTAGATTAATCTAATTTGTTTAACATTTTCCAATTATTAAACAGAAGTGAAGTCCCCCAGAGTTTCATTTCCACTGGAGCCGGGCGGCAAACACCAGAAAAAATAAATTTTTTCTGGTGACAAACACTCTCCCATATTAAGTAGACTGCATATTTAAATATTTTTCTTTGAACGTATTTATAACAGAAAGCAGAAAATAATGAAAGTTTTTTCATTTTTTTACAAGTTATTATGGCTAATTACTGAATAAATGTTCATTAGATAAATGTAAAATTCTTTATAAGTTTTGCGTTGGCTTATGTAATACTCGTGAAAATTGCTTACCTTTCAAAACCTGGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGGTTTTTAAGATCAACATAGAAACGTTTCTATATTTTGCTGAAAAATTTAGCATCCCAGGTGGTTTGCAGCTACAAAGTTACAAAGTAAATAGGAGATAAAAAAGT
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ORB
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif YTCCAKTGGAAATWNARCWCHYRK
Motif ATTTCYWCWGGARMY
Motif AWTGAACATYTWWGGTCATTWG
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The result of BLAST |
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