RefSeq | NC_016051.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010108 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 952 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.5746 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 1530315..1531266 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
AGGCACCACCGATTTTACTTCCAGTGGAAACGAAACTCCCCGCATCACATCCGGGTTGATTAAATCTTGTGTTCCGCAATATGAGACGCAATTAGGCGAGAGATCATGACACTATGCTCATTAATTCCACGGATATTGAGCAGATGTTGCAGTACTTTCCACCCGAAGCACCGGACACAGTGGAAAGCTAACCAATCTACGATGAGGGGTTTATAGCCTTTGCTTGTCAGGAACCTGTTCAAAGGAGGAGAAAGTTTCCACTGGATAGGCAAGGTGTTCCAAAGGAAACGGGAACTTTTAATGATCAGAGATGAACATTGAATTGTACAAACGTAAAATGAACAAGGCAGCGCATTTCAAATTTCCACTGAAAGAAAAATGAACATAAATGGCTATCAACTTTAGTTCATTGACGCACTGCTTTGGGCAGACGGGGTAAGCAGAAATAGTTAAAATTTAAGTAAAGTTAAACGGATTTGTAGCCCCAGGGGGTTTTGTTTCCACTGGAACCGGGATAATGCTACACCCTTTCTATCCTCGTAGTTTTGGTGAAAACACTCCCACTTTCTCTACGTTTTTGGCTTTTAATCTTTTGCATGAACAATGTTCATATTATACTCGATGATTTAAATGAAAATAGGGAGCTCCTGAACACATTCAAATTAACTCCAAAAGTGTGATGAACAGCATACTATTTACGTACTAAAAATCCCAACCAAAACGACTTTTTCAAATGCAATGTCCCCCTAACCCGTCCATTTCCGTATCCCGGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGGTCTTTTCGATGACGATCGAAAAAGACCTTTGTTTCCACTGGAGCTAAATGTTCATCGGAGCTCATTCCCCGGGTCTGGTGTACCAATGTTTTTAAGCCCTCTTCTCGATTTCACTACATGCTGCCGGTTACCGTCGTGAGGCGACTGCTTCGA
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ORB
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif GTTTCCASTGGA
Motif ACTAYNCBCATTHTATCCDCGTWKWTT
Motif GGGGGT
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The result of BLAST |
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