RefSeq | NC_011529.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010057 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 677 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.6425 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 1510250..1510926 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TGAAATCACCAAGGGAACTTTCGATTCGAAACTTAATAACGGTATCGTTCCAGCGGAAACTGAAGGGGTCAAAGAACATAATAGTGCATCAAACATTTACATTCGAAAATGAACAATAGCATCCAGATGGGCATTTCCACTGAAAGAAGAATGAACATTTTTGGACAGAAAATCATGTACACTAATGCTCCAAATCGTACTATTTTGGTAAACATATGTACTAAACACAAGACAGAACATTAAACGGTTTCGTAGTCCCCCAGAGTTCTGTTTCCGGTGGAGGCGGGCTTTGGCTACTCCCATATTGTCCTTTGGTTTTTGGTGAAACTCTCCCGCTTTCTTTACAATTCCCAATATTTATATTTTTTCATGAACAATGTTCATAAAAAATCTCAAACTCATAAAGATCATGAAAATTAGTCTAAATATTCAAAGAGTAGATTTAAAATCTGTTGATTTTATGTTTGTAATGTCCTTTATAAATGGAGCTTTCTGTTTTTTCTGGCATGTAATCCATCCATTCTCCGAAATTGGGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGGTCTTTCAAATAATCATCGAAAAAGACCTTTGTTTCCAGTGGAAATCTAACTCCATTACTGGACACCACAAAGCATTAATGATACTTTTTTAAACCTGCTAACGATAGTGTACAAC
TGAAATCACCAAGGGAACTTTCGATTCGAAACTTAATAACGGTATCGTTCCAGCGGAAACTGAAGGGGTCAAAGAACATAATAGTGCATCAAACATTTACATTCGAAAATGAACAATAGCATCCAGATGGGCATTTCCACTGAAAGAAGAATGAACATTTTTGGACAGAAAATCATGTACACTAATGCTCCAAATCGTACTATTTTGGTAAACATATGTACTAAACACAAGACAGAACATTAAACGGTTTCGTAGTCCCCCAGAGTTCTGTTTCCGGTGGAGGCGGGCTTTGGCTACTCCCATATTGTCCTTTGGTTTTTGGTGAAACTCTCCCGCTTTCTTTACAATTCCCAATATTTATATTTTTTCATGAACAATGTTCATAAAAAATCTCAAACTCATAAAGATCATGAAAATTAGTCTAAATATTCAAAGAGTAGATTTAAAATCTGTTGATTTTATGTTTGTAATGTCCTTTATAAATGGAGCTTTCTGTTTTTTCTGGCATGTAATCCATCCATTCTCCGAAATTGGGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGGTCTTTCAAATAATCATCGAAAAAGACCTTTGTTTCCAGTGGAAATCTAACTCCATTACTGGACACCACAAAGCATTAATGATACTTTTTTAAACCTGCTAACGATAGTGTACAAC
TGAAATCACCAAGGGAACTTTCGATTCGAAACTTAATAACGGTATCGTTCCAGCGGAAACTGAAGGGGTCAAAGAACATAATAGTGCATCAAACATTTACATTCGAAAATGAACAATAGCATCCAGATGGGCATTTCCACTGAAAGAAGAATGAACATTTTTGGACAGAAAATCATGTACACTAATGCTCCAAATCGTACTATTTTGGTAAACATATGTACTAAACACAAGACAGAACATTAAACGGTTTCGTAGTCCCCCAGAGTTCTGTTTCCGGTGGAGGCGGGCTTTGGCTACTCCCATATTGTCCTTTGGTTTTTGGTGAAACTCTCCCGCTTTCTTTACAATTCCCAATATTTATATTTTTTCATGAACAATGTTCATAAAAAATCTCAAACTCATAAAGATCATGAAAATTAGTCTAAATATTCAAAGAGTAGATTTAAAATCTGTTGATTTTATGTTTGTAATGTCCTTTATAAATGGAGCTTTCTGTTTTTTCTGGCATGTAATCCATCCATTCTCCGAAATTGGGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGGTCTTTCAAATAATCATCGAAAAAGACCTTTGTTTCCAGTGGAAATCTAACTCCATTACTGGACACCACAAAGCATTAATGATACTTTTTTAAACCTGCTAACGATAGTGTACAAC
ORB
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif SKTTCCAGTGGAAAY
Motif GGGGTC
Motif YTTTGG
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|