RefSeq NZ_CP006019.1
DoriC accession number aORI10010369
OriC length 1018 nt
OriC AT content 0.3448
The location of oriC region 1858353..0 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
AACATTAGTATCTCCCCGAGTTAACTTAAAAATCATTTCCCAGCAAACATTTCCACAGGAAATATAACTCCTCAGAAGTGTCCAATGCGTTAAGACAAACTCCAATACGTTGGCAATAGACAAACTATTCAGTATATATGTAAACCCCCCAGAGTTTCATTTCCACTGGAACTGGGTTTTACAGCCCCCTACATGTTTTCCATCAGATGTATGTAAACGCAGATTTATAAATTAAATTGATAATTGACTATGTGATTTTGTTCAAATAATTTAAATTTTCTTCCAGCAGTTTAATAAAAATTATTATTTTTTCCATTAATTTTTTGAACATTGTTCATAGAAAAGTATAAATACCATGACGAGAAGAGAAAATGGGAGTGTTTAAACCAAAATAGAGAGTATAAACCGGTGTTTTCGCCCACTTCCACTGGAAACAAAACACTGGGGGGGTTATGTTCTGTTTAATTTTTCTAAAATTGTTAAATTGTTTTGTTAATCCTAATGCATTCTTATAGTCACTGATGTTCGTGTTTGACTGCCCATATATGTTCATTTTGTTTTCATAGGAAATGTTCTTTTGTATTCATAAGGTCATTTAATATTGTAAATGTTGGATGTACTCATATGTCCATTCAGCTGCGTTGTTTCCACTGCAAAACTAACGGGAAATCATTTAAGGAACTAGAAGATAACTATGTATTGGTGATGCTGTTGGAAGAAAATGTGCTCGAATGGTTGGTGCAGGGAACGGATGATGCTAAGGATATCGTGGACTTGCCTTGGAACCTTAAAAGGGTAAAAGAAAATTATTATGTTGCAGAGCACCCCAAAATGCCCTTCTTGTTAAACATCGTCTTTTCGGACACTTTTGTTCACCTAATTGTTTCCACTGGAATTGAAACTGCATCTTTAGATTCTAAAGAGCGCCTAAAGATGTATAGGGTGTTGCTGCTCCTCAATGAAAAAATAAATCTCATGAAGTTTACATTAAGCGGCATAAATGAGGAGATCATCATAA
AACATTAGTATCTCCCCGAGTTAACTTAAAAATCATTTCCCAGCAAACATTTCCACAGGAAATATAACTCCTCAGAAGTGTCCAATGCGTTAAGACAAACTCCAATACGTTGGCAATAGACAAACTATTCAGTATATATGTAAACCCCCCAGAGTTTCATTTCCACTGGAACTGGGTTTTACAGCCCCCTACATGTTTTCCATCAGATGTATGTAAACGCAGATTTATAAATTAAATTGATAATTGACTATGTGATTTTGTTCAAATAATTTAAATTTTCTTCCAGCAGTTTAATAAAAATTATTATTTTTTCCATTAATTTTTTGAACATTGTTCATAGAAAAGTATAAATACCATGACGAGAAGAGAAAATGGGAGTGTTTAAACCAAAATAGAGAGTATAAACCGGTGTTTTCGCCCACTTCCACTGGAAACAAAACACTGGGGGGGTTATGTTCTGTTTAATTTTTCTAAAATTGTTAAATTGTTTTGTTAATCCTAATGCATTCTTATAGTCACTGATGTTCGTGTTTGACTGCCCATATATGTTCATTTTGTTTTCATAGGAAATGTTCTTTTGTATTCATAAGGTCATTTAATATTGTAAATGTTGGATGTACTCATATGTCCATTCAGCTGCGTTGTTTCCACTGCAAAACTAACGGGAAATCATTTAAGGAACTAGAAGATAACTATGTATTGGTGATGCTGTTGGAAGAAAATGTGCTCGAATGGTTGGTGCAGGGAACGGATGATGCTAAGGATATCGTGGACTTGCCTTGGAACCTTAAAAGGGTAAAAGAAAATTATTATGTTGCAGAGCACCCCAAAATGCCCTTCTTGTTAAACATCGTCTTTTCGGACACTTTTGTTCACCTAATTGTTTCCACTGGAATTGAAACTGCATCTTTAGATTCTAAAGAGCGCCTAAAGATGTATAGGGTGTTGCTGCTCCTCAATGAAAAAATAAATCTCATGAAGTTTACATTAAGCGGCATAAATGAGGAGATCATCATAA
AACATTAGTATCTCCCCGAGTTAACTTAAAAATCATTTCCCAGCAAACATTTCCACAGGAAATATAACTCCTCAGAAGTGTCCAATGCGTTAAGACAAACTCCAATACGTTGGCAATAGACAAACTATTCAGTATATATGTAAACCCCCCAGAGTTTCATTTCCACTGGAACTGGGTTTTACAGCCCCCTACATGTTTTCCATCAGATGTATGTAAACGCAGATTTATAAATTAAATTGATAATTGACTATGTGATTTTGTTCAAATAATTTAAATTTTCTTCCAGCAGTTTAATAAAAATTATTATTTTTTCCATTAATTTTTTGAACATTGTTCATAGAAAAGTATAAATACCATGACGAGAAGAGAAAATGGGAGTGTTTAAACCAAAATAGAGAGTATAAACCGGTGTTTTCGCCCACTTCCACTGGAAACAAAACACTGGGGGGGTTATGTTCTGTTTAATTTTTCTAAAATTGTTAAATTGTTTTGTTAATCCTAATGCATTCTTATAGTCACTGATGTTCGTGTTTGACTGCCCATATATGTTCATTTTGTTTTCATAGGAAATGTTCTTTTGTATTCATAAGGTCATTTAATATTGTAAATGTTGGATGTACTCATATGTCCATTCAGCTGCGTTGTTTCCACTGCAAAACTAACGGGAAATCATTTAAGGAACTAGAAGATAACTATGTATTGGTGATGCTGTTGGAAGAAAATGTGCTCGAATGGTTGGTGCAGGGAACGGATGATGCTAAGGATATCGTGGACTTGCCTTGGAACCTTAAAAGGGTAAAAGAAAATTATTATGTTGCAGAGCACCCCAAAATGCCCTTCTTGTTAAACATCGTCTTTTCGGACACTTTTGTTCACCTAATTGTTTCCACTGGAATTGAAACTGCATCTTTAGATTCTAAAGAGCGCCTAAAGATGTATAGGGTGTTGCTGCTCCTCAATGAAAAAATAAATCTCATGAAGTTTACATTAAGCGGCATAAATGAGGAGATCATCATAA
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif YRTTTCCACTGGAA

StartP-valueSite
1585.06e-09CCCAGAGTTTCATTTCCACTGGAACTGGGTTTTA
4207.59e-09TGTTTTCGCCCACTTCCACTGGAAACAAAACACT
8821.12e-08TTCACCTAATTGTTTCCACTGGAATTGAAACTGC
482.73e-08TCCCAGCAAACATTTCCACAGGAAATATAACTCC
6434.06e-08TCAGCTGCGTTGTTTCCACTGCAAAACTAACGGG

Motif ARCHCCCCANA

StartP-valueSite
1436.37e-08TATATATGTAAACCCCCCAGAGTTTCATTTC
8212.35e-06TATGTTGCAGAGCACCCCAAAATGCCCTTCT
1832.56e-06TGGGTTTTACAGCCCCCTACATGTTTTCCAT
664.31e-06CAGGAAATATAACTCCTCAGAAGTGTCCAAT
5341.37e-05GTTCGTGTTTGACTGCCCATATATGTTCATT

Motif CCAGCA

StartP-valueSite
2838.54e-05AAATTTTCTTCCAGCAGTTTAATAAA
408.54e-05AAATCATTTCCCAGCAAACATTTCCA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010369 100.0 1018 0 0 1 1018 1 1018 0.0 1881
aORI10010186 94.872 39 2 0 142 180 780 742 6.18e-11 62
aORI10010016 94.872 39 2 0 142 180 102 140 6.18e-11 62
aORI10010295 100.0 32 0 0 142 173 350 319 2.22e-10 60
aORI10010295 96.97 33 1 0 141 173 19 51 2.87e-09 57
aORI10010121 97.143 35 1 0 142 176 401 367 2.22e-10 60
aORI10010121 96.875 32 1 0 142 173 78 109 1.03e-08 55
aORI10010326 96.97 33 1 0 141 173 19 51 2.87e-09 57
aORI10010307 96.97 33 1 0 141 173 19 51 2.87e-09 57
aORI10010108 96.97 33 1 0 144 176 800 768 2.87e-09 57
aORI10010105 96.97 33 1 0 143 175 345 313 2.87e-09 57
aORI10010105 94.286 35 2 0 142 176 34 68 1.03e-08 55
aORI10010079 100.0 30 0 0 143 172 490 461 2.87e-09 57
aORI10010078 96.97 33 1 0 144 176 737 705 2.87e-09 57
aORI10010395 100.0 29 0 0 144 172 571 543 1.03e-08 55
aORI10010394 100.0 29 0 0 144 172 571 543 1.03e-08 55
aORI10010389 92.308 39 2 1 135 172 105 143 1.03e-08 55
aORI10010388 100.0 29 0 0 144 172 571 543 1.03e-08 55
aORI10010386 100.0 29 0 0 144 172 572 544 1.03e-08 55
aORI10010374 100.0 29 0 0 144 172 131 159 1.03e-08 55
aORI10010304 100.0 29 0 0 144 172 791 763 1.03e-08 55
aORI10010303 100.0 29 0 0 144 172 121 149 1.03e-08 55
aORI10010101 90.476 42 3 1 133 173 766 725 1.03e-08 55
aORI10010057 92.308 39 2 1 135 172 573 535 1.03e-08 55
aORI10010377 100.0 28 0 0 145 172 260 287 3.72e-08 53