RefSeq NC_012883.1
DoriC accession number aORI10010079
OriC length 727 nt
OriC AT content 0.6864
The location of oriC region 1783451..1784177 nt
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OriC map
OriC sequences
TGCAATTGGAAATATCTAGTGCAAAGTTAAAAAGATTAACTTTTCCACAGGAAATACTGCCCCAAATTGTTGAACTAAAAGTGCCACCATATACCATAATAATACAGTGATGTCCATATGTTCCAGTGGAAATAAAGGTCTTTTTCGATACCTATATTAACGTTAAATTTTGATCTTATAACCCCCTCAGAGTTGTATTTCCACTGGAAGCTAGTTAGTGAAATGGACGGGATTTGGGAATAATTTAAAAGTAAAAAAGGACTTAGAAGGCTTCTTTTCATTTGTCAATGGAGAATTGTTCAGTTATTTTCACCATTACTTTTAATTTGATATCTAAATTTTACGTTAATTTATCATATAATTTGAACAATGTTCATAGATAAATATATATACCCTAACGACAAAAAATATTGGGAGTGTTTATACCCGTTTTAATCATACATACGGGTGTTCCGCAGAGGTTCCAGTGGAAATGAAACTCTGGGGGGTTATAGTTCTGTTTACCAATCATCCAAAAATTAAATATTTTTAGTTAACAACATGAACAAAAATGTACTTAAATGATCGCTTTTTAATGAACATTTTTATACATTTTTCTTCCAAACGAAATCCTCAAGTGAGCTCATATTAATCTCCATATGTCAAAACTTTGAGAGTTTCTCGAAGTGTTCATCAACAAGTTTCCATTGGAACCATGGTTTTAAATACTTTCAGTGCCTAGTTTCAT
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ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif KTTCCABTGGAA

StartP-valueSite
4612.38e-08TTCCGCAGAGGTTCCAGTGGAAATGAAACTCT
1202.38e-08ATGTCCATATGTTCCAGTGGAAATAAAGGTCT
1981.57e-07CAGAGTTGTATTTCCACTGGAAGCTAGTTAGT
423.63e-07AAGATTAACTTTTCCACAGGAAATACTGCCCC
6814.83e-07CATCAACAAGTTTCCATTGGAACCATGGTTTT

Motif AYTBTGAGDGTTTATASHHSTKTTHATCA

StartP-valueSite
4783.82e-14TGGAAATGAAACTCTGGGGGGTTATAGTTCTGTTTACCAATCATCCAAA
6478.26e-14ATATGTCAAAACTTTGAGAGTTTCTCGAAGTGTTCATCAACAAGTTTCC
4107.04e-13GACAAAAAATATTGGGAGTGTTTATACCCGTTTTAATCATACATACGGG

Motif CGGGWKTTSSG

StartP-valueSite
4451.17e-07ATCATACATACGGGTGTTCCGCAGAGGTTCC
2283.79e-07GTGAAATGGACGGGATTTGGGAATAATTTAA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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aORI10010057 100.0 30 0 0 460 489 534 563 2.04e-09 57
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aORI10010301 100.0 28 0 0 460 487 765 792 2.63e-08 53