| RefSeq | NC_007191 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | pORI00000397 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1535 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.6671 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 3626..5160 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
AGTAATTGCTCCTTTGTGAGTAATTTTGGTTAAGCATGAAGAAATGCTCTGCAAAAGGTTTTTTCTTCATGCTTTTATTATATCAAAACAAGTATAGTATTCCGAATATTTTCTACACCTATACACAGTTTTTTCTACACCTATACACAGTTTTTTCTACACCTATACACAGTTTTTTCTACACCTATAAACTCGAATTACATTGAAAACACTGACTTTTTCCCCACGCAAAAGAACAAAAGATTAAAATATATATGATAAATTAATATAGGCTTCGCCTTTTTTCACTACGTTTAAAAAATCTAAAAATCAAGGTCAAAAGAAAAGGTCAAAATCAAAACCGCTCCGCAAGGACGGATTGGGGTTGGCTAATCAATTTCATTAGCAGTCAGTCCCTTTGTTAGTGGATACAGTCTGTCTTGTTTTTAAGGCGAACAGTCGATACTGTTCGGTCAGGGTTACACCCTAACAACCTAAAGGCGGGTTGGAATAGCCCTAGAAGCTCATATTTATGCTTCTAAGCGATTTTACAATGGATTTGGTAGAAATATTCGGACACAAAAGAAAAAGCCCTCACAAGGGCTTTAAATGAGCATATTTAATCAATTATTTATTTGATGCTATTTTTCACGCTTCTTTTTTCTTCTTGCCATATGAATAAATCCTATACTTAACCAACCAAAGCATAGCACTAACCAAATCGTACTATGTCTAACCCAAAATGCAATTAGACTTAAAATAGCTACAACAAAATACAAAAAACAATCATGTTTTGAAAGGAACTTTTTCATAATGACCCACCTTAAAATTATCTTTATTTTAGTATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTATCAGCCTTTAGTCTTAAAATTATTTCATTCTTTTGAAAGCTCGTTGCTGGGTACTAATGCTTATCCCTGTTTTTCGTTCAATCATCTTGTAAGTTAAGCCTTGCTGTTTTAACTGTTTGACTAGCTAAATACTCATATCATGCAATCAAGCGTCTTACAGACGGTCAGGGCAAGCCCTAACAACCCTTAAATGGAAAACCGATACTTTGTTTAACTTGTTTTTTTACAAATTACAACAAGCTATTCAATTCAAAATCAATTTAAACCCACTTAAAAGCTCGTTTAAGCATTCTTAATGTTCCCTTTGAACAAATAGACAGTTTCGAATTAAAGTCGCTTAAATCGAGTTTTAGAGCGTTTTAAAATAGAATGATGAAAAACTAAAAAGTTTCAAACGCTGGTCGGCTTGTTTCGTTAAAAAAGAGTGCAATGCGCACTTACACATCACTCGTTTTTAGAGTGATGTAATGGCTAAAAATCGTGTATCAGAAGTTGCTTAGCGCAACAACAAAATTTCATGATAGTAGCGTCTCTTAAATGAGTGAGTCTTTGTTTAAATTTGTGATACATTTTTCTGATCCATCAAGAACTTCCTCAAAGATAAAATGCCTCAGCGCTCATTCCTCAATCGCCCTTTGTCATTGATTTTGTAATAAGCATTGCGCCCTATTCGGTTACAATCC
AGTAATTGCTCCTTTGTGAGTAATTTTGGTTAAGCATGAAGAAATGCTCTGCAAAAGGTTTTTTCTTCATGCTTTTATTATATCAAAACAAGTATAGTATTCCGAATATTTTCTACACCTATACACAGTTTTTTCTACACCTATACACAGTTTTTTCTACACCTATACACAGTTTTTTCTACACCTATAAACTCGAATTACATTGAAAACACTGACTTTTTCCCCACGCAAAAGAACAAAAGATTAAAATATATATGATAAATTAATATAGGCTTCGCCTTTTTTCACTACGTTTAAAAAATCTAAAAATCAAGGTCAAAAGAAAAGGTCAAAATCAAAACCGCTCCGCAAGGACGGATTGGGGTTGGCTAATCAATTTCATTAGCAGTCAGTCCCTTTGTTAGTGGATACAGTCTGTCTTGTTTTTAAGGCGAACAGTCGATACTGTTCGGTCAGGGTTACACCCTAACAACCTAAAGGCGGGTTGGAATAGCCCTAGAAGCTCATATTTATGCTTCTAAGCGATTTTACAATGGATTTGGTAGAAATATTCGGACACAAAAGAAAAAGCCCTCACAAGGGCTTTAAATGAGCATATTTAATCAATTATTTATTTGATGCTATTTTTCACGCTTCTTTTTTCTTCTTGCCATATGAATAAATCCTATACTTAACCAACCAAAGCATAGCACTAACCAAATCGTACTATGTCTAACCCAAAATGCAATTAGACTTAAAATAGCTACAACAAAATACAAAAAACAATCATGTTTTGAAAGGAACTTTTTCATAATGACCCACCTTAAAATTATCTTTATTTTAGTATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTATCAGCCTTTAGTCTTAAAATTATTTCATTCTTTTGAAAGCTCGTTGCTGGGTACTAATGCTTATCCCTGTTTTTCGTTCAATCATCTTGTAAGTTAAGCCTTGCTGTTTTAACTGTTTGACTAGCTAAATACTCATATCATGCAATCAAGCGTCTTACAGACGGTCAGGGCAAGCCCTAACAACCCTTAAATGGAAAACCGATACTTTGTTTAACTTGTTTTTTTACAAATTACAACAAGCTATTCAATTCAAAATCAATTTAAACCCACTTAAAAGCTCGTTTAAGCATTCTTAATGTTCCCTTTGAACAAATAGACAGTTTCGAATTAAAGTCGCTTAAATCGAGTTTTAGAGCGTTTTAAAATAGAATGATGAAAAACTAAAAAGTTTCAAACGCTGGTCGGCTTGTTTCGTTAAAAAAGAGTGCAATGCGCACTTACACATCACTCGTTTTTAGAGTGATGTAATGGCTAAAAATCGTGTATCAGAAGTTGCTTAGCGCAACAACAAAATTTCATGATAGTAGCGTCTCTTAAATGAGTGAGTCTTTGTTTAAATTTGTGATACATTTTTCTGATCCATCAAGAACTTCCTCAAAGATAAAATGCCTCAGCGCTCATTCCTCAATCGCCCTTTGTCATTGATTTTGTAATAAGCATTGCGCCCTATTCGGTTACAATCC
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif TTTTCTACACCTATACACAGT
Motif RGWCGGWYWGGGNTAGVCC
Motif GCWTWGCGC
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|