RefSeq NC_017494
DoriC accession number pORI00000113
OriC length 893 nt
OriC AT content 0.6988
The location of oriC region 6888..658 nt
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OriC map
OriC sequences
ATTTTTCTCCTTTTTTTTGCAAATAATGGTTCTATTGCAATGTTTTTCGATAAATCTATTTTATTGTAAATTTGAATAAAAAGATAGTGAGAGTATGTGGATGAATCATTTTAAATACAAAGAATAAAAAAAATGTGATTATTACCTCTGCTGGTTACTATTTCGCTATAATCTCTGTTATCAAGAAGTGTAAGAAATTTTATATGATTGTGGCATCAAATTTTCTCATATTTTAGCATGCAGATGAATAGTGAGGTTAGAGCAGGTCATAAATAACGGTCATATTTAAAAGCTAAAATTGTACGTTTTAGTCAATTACATACAAGCCTATTTAAGGGCTTTTTCTTTTATCCATGATAATTATTACTAACTCACGTTTAAAATCGCTTAAAAGGCAAAATATGAGCTTGTAGGACTATTCAAAGTGTTTAGACTAAACAAAGTAGCCACGACCGTTAGGGAGTTCTTTTTAGTGGCAGAATGTATCTAATATAAAATCAGAGTGTACAAGCGGAGGGACAAGAGCAACGCAGGGATTTTAAATTTAGAACCTCAATTCAATGGTTTTGACTTTTTCTTTTGACCTTGATTTTAAGTTTTTAGAACGAAGTGAAAAAAGCGAAGCCTATATTAATTTATCATATATATTTTGTCTTTTACTCTTTTGCGTGGTTTTGTAATCGGGTTTTCATTGCGTTTACAGATTTTAATTCCCAGAAAAAACTATGTATTATCCCAGAAAAAACTATGTATTATCCCAGAAAAAACTATGTATTATCCCAGAAAAAACTTGTTTTACTGGGAATAAAGTAGTATAATAAAAGCATAGAGAAATTCCCTACTAAAAGTTTTTCTCTATGCTTAACCAAACCACCCACAAAGGAGTATCCCTC
ATTTTTCTCCTTTTTTTTGCAAATAATGGTTCTATTGCAATGTTTTTCGATAAATCTATTTTATTGTAAATTTGAATAAAAAGATAGTGAGAGTATGTGGATGAATCATTTTAAATACAAAGAATAAAAAAAATGTGATTATTACCTCTGCTGGTTACTATTTCGCTATAATCTCTGTTATCAAGAAGTGTAAGAAATTTTATATGATTGTGGCATCAAATTTTCTCATATTTTAGCATGCAGATGAATAGTGAGGTTAGAGCAGGTCATAAATAACGGTCATATTTAAAAGCTAAAATTGTACGTTTTAGTCAATTACATACAAGCCTATTTAAGGGCTTTTTCTTTTATCCATGATAATTATTACTAACTCACGTTTAAAATCGCTTAAAAGGCAAAATATGAGCTTGTAGGACTATTCAAAGTGTTTAGACTAAACAAAGTAGCCACGACCGTTAGGGAGTTCTTTTTAGTGGCAGAATGTATCTAATATAAAATCAGAGTGTACAAGCGGAGGGACAAGAGCAACGCAGGGATTTTAAATTTAGAACCTCAATTCAATGGTTTTGACTTTTTCTTTTGACCTTGATTTTAAGTTTTTAGAACGAAGTGAAAAAAGCGAAGCCTATATTAATTTATCATATATATTTTGTCTTTTACTCTTTTGCGTGGTTTTGTAATCGGGTTTTCATTGCGTTTACAGATTTTAATTCCCAGAAAAAACTATGTATTATCCCAGAAAAAACTATGTATTATCCCAGAAAAAACTATGTATTATCCCAGAAAAAACTTGTTTTACTGGGAATAAAGTAGTATAATAAAAGCATAGAGAAATTCCCTACTAAAAGTTTTTCTCTATGCTTAACCAAACCACCCACAAAGGAGTATCCCTC
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CCCAGAAAAAACTATGTAT

StartP-valueSite
7571.10e-11TATGTATTATCCCAGAAAAAACTATGTATTATCCCAGAA
7351.10e-11TATGTATTATCCCAGAAAAAACTATGTATTATCCCAGAA
7131.10e-11GATTTTAATTCCCAGAAAAAACTATGTATTATCCCAGAA
7792.43e-09TATGTATTATCCCAGAAAAAACTTGTTTTACTGGGAATA
8742.96e-09AACCAAACCACCCACAAAGGAGTATCCCTC

Motif GDCTTTTWCTTTTDWSCDTG

StartP-valueSite
3377.36e-11CCTATTTAAGGGCTTTTTCTTTTATCCATGATAATTATTA
5692.00e-10CAATGGTTTTGACTTTTTCTTTTGACCTTGATTTTAAGTT
6523.56e-10TATATATTTTGTCTTTTACTCTTTTGCGTGGTTTTGTAAT

Motif GKAGSSACRASMGYWASGSAG

StartP-valueSite
4431.64e-12ACTAAACAAAGTAGCCACGACCGTTAGGGAGTTCTTTTTAG
5132.30e-12GTGTACAAGCGGAGGGACAAGAGCAACGCAGGGATTTTAAA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000113 100.0 893 0 0 1 893 1 893 0.0 1650
pORI00000849 94.82 444 19 4 231 672 74 515 0.0 689
pORI00000532 94.82 444 19 4 231 672 276 717 0.0 689
pORI00000408 94.82 444 19 4 231 672 74 515 0.0 689
pORI00000349 93.258 445 23 7 231 671 791 1232 0.0 649
pORI00000847 90.323 341 25 8 334 671 22 357 0.0 440
pORI00000397 90.179 112 6 5 565 672 334 224 2.32e-34 141