RefSeq | NC_004652 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1480 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.6662 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 287..1766 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TGAATGTTTAGAACTTAGTAGTCGTCCAAAAACGACTACTTTTTTTGTTGAATCGTCCAAGGACGATTCGATGCTTTTGACTTGTAAGAACAGGATTGAATGAAGCCATACTGTTCGCATATTTAAGGGGATGATCAAACAAAATACGAGAGATTTTTTGTTCGTTCATCCATGGTTTTAGAAAAAAGAGGGACGATTTCGGAAGAAGAAAATCGTCTCTTTTTTTTCTTCTTTTTGTATGACAAAAAGAAAGATCTTTTGCCCATTTTTATTTTTTATAAAATGGGCAGGTGGCGTTTGCGTAAAGCAAATCGACACAATCCAAAGGGGATAAAAGGGGAAAGTGAAACTTCCCCCTTTTCAAGCCACATTGTAATACAAGAACGAAGTGCTTTGTATTACAATGTGATAGCTTGCAGTATTTATGGTTTTATATGGTCTATTTTGTTGTGAGGATTGTAACCGAATAGGGCGCAATACTTATTACAAAATCAATGACAAAGGGCGATTGAGAAATGAGCGCTGGGGCATTTTATCTTTGAGGAAGTTCTTGATGGATCAGAAAAATGTATCACAAATTTAAACAAAGACTCACTCATTTAAGAGACGCTACTAGCATGAAATTTTGTTGTTGCGATAAGCAACTTCTGATACAGGTTTTTAGGGGTTAGCACGACATCAATTTATTTGATGTGTAAGTGCGCATTGCACTCTTTTTTTACGAAACAAGCCGACCAGCGTTTGAAACTTTTTAGTTTTTCATCATTCTATTTTAAAACGTTCTAAAATTCGATTTAAGCGACTTTAATTCGAAACTGTCTATTTGTTCAAAGGGAGCATTAAAGTCGCTTAAACGAGCTTTTAAGTGGGTTTAAATTGATTTTGAATTGAATAGCTTGTTGTAAGTTGTAAAAAAAACAAGTTAAACAAAGTATCAGTTTTCCATTTAAGGGTTGTTAGGGCTTGCCCTGACCGTCTGTAAGACGCTTGATTGCATGATATGAGTATTTAGCTAGTCAAACAGTTAAAACAGCTTATATGAGCAATTAGAGGGAATCCAATAAATTCCTAAAAGCGGTTTTGATCTTTTAGCGAGTGAACGAAGTGAACGCTGCAAGTAAAATGTGAGCGTGGTTTTCGCTCACTCCTTTTTTTGATGACTTTGACCTTTGGTTTTAAATTTTTGAAAAAAATAAAAAATAGGCGAAGCCTATATTTATTTATCTTATATATTTTAATCTTTTCTTCTTTTGCGTGAAAAAAATGTCAGTGTTTATAGGCTTATCCAAATTTTTATAGCTACTAAAAACTGTGTATATAGCTACTAAAAACTGTGTATATAGCTACTAAAAACTGTGTATATAGCTACTAAAACATTGAGAAAGTAGCTATAAAATGATATAATAAAAGCATAGAGAAAATTCACGGCAAAATGACTTTCTCTATGCCTATTTCAAACACACAAAGGAGCGTATTTTAT
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AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif GTGTATATAGCTACTAAAAMM
Motif RTCCAARRRCGA
Motif ATGKGWARGTGGNNHTTGCNC
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The result of BLAST |
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