RefSeq NZ_CP012452
DoriC accession number pORI00000739
OriC length 1100 nt
OriC AT content 0.61
The location of oriC region 3367..4466 nt
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OriC map
OriC sequences
AAAATCCTCCTTCAAGATTAACTACTTAACAAAATTATAAAGAGCTTTCTAATAGGGGTCAAGCCCCTAATTAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAACAGACAAAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAGATTCTGCACACCTTGGGAGAGTAAGCATACAGCCGACGGTAAAGAGGTTTAAAAAGAGGTTTAAAAAGAGATTATAAAAGAGGAGAGGGGCAAAATTTCCCGCCTAAAAATTTTCTGCTTTTTTAGCCAAACAGGTTCGCGAATTTACTAAACTGGGAAACTTGCTCCCTCTGGTCGCTAAAAAGGTGTGAGGGAAAAACACCCTCACATTGTACCTGCGCAGTCGCCTAAAGGCTCCTTTGCTAAAAACGTTGTTTAAAGAGATTTTTTAGAGGCTCTGCGCGCTCGTTTAAGCCGTTTTAAGACAGTTTAGTATGGATAACCCTTATCTTGTTCTTAAAGCACCTTACAGGCGGTCAGGGCAAGCCCTAACAACCCTTAAAGAGCATAAAACCATCCTAAAATTCGATTTAATCTGTCTTATCTATGTTCTTGTATATTTTATATACCTTGGGTAGTAAAACGTCTGAAAACGCAAATAAGAGCGTATGAAACAAAACAATAAGCAACCGATTCAGCAGAATTCCGGAGGAGCCATTTTCGTACGTTAGCAAAAAAGTGCTGTTGCTAAAAGCTGCTTGCGGTGCGGAGCGAACAAGGTCTCCTAGAGCGAGACGTGTACAAACAAGCTTACAAATTCGTGAAAGGCACCGGTTTTGCGCCATTTCCAAGCAAAAAAAGGTCTATCGAGCTTGCTCGATAGACCGATCGCATTTAGCCCCCCGCATTCTAACAGGGGGGAATAATGTGAAAAATTATGGTAGTAATGCTTGATATATAGGCATTTCTTTTGGTTGCACACTTAAAAAAAATCACGATTTTGACAACTAAATTTTTAAATAAAAAAGCTTTACAGTTTAATTCAAATGTGTTTTAATATATCTATCAGTACTTGCCACGCCTCTGATTTAATATCATGCGCATT
AAAATCCTCCTTCAAGATTAACTACTTAACAAAATTATAAAGAGCTTTCTAATAGGGGTCAAGCCCCTAATTAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAACAGACAAAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAGATTCTGCACACCTTGGGAGAGTAAGCATACAGCCGACGGTAAAGAGGTTTAAAAAGAGGTTTAAAAAGAGATTATAAAAGAGGAGAGGGGCAAAATTTCCCGCCTAAAAATTTTCTGCTTTTTTAGCCAAACAGGTTCGCGAATTTACTAAACTGGGAAACTTGCTCCCTCTGGTCGCTAAAAAGGTGTGAGGGAAAAACACCCTCACATTGTACCTGCGCAGTCGCCTAAAGGCTCCTTTGCTAAAAACGTTGTTTAAAGAGATTTTTTAGAGGCTCTGCGCGCTCGTTTAAGCCGTTTTAAGACAGTTTAGTATGGATAACCCTTATCTTGTTCTTAAAGCACCTTACAGGCGGTCAGGGCAAGCCCTAACAACCCTTAAAGAGCATAAAACCATCCTAAAATTCGATTTAATCTGTCTTATCTATGTTCTTGTATATTTTATATACCTTGGGTAGTAAAACGTCTGAAAACGCAAATAAGAGCGTATGAAACAAAACAATAAGCAACCGATTCAGCAGAATTCCGGAGGAGCCATTTTCGTACGTTAGCAAAAAAGTGCTGTTGCTAAAAGCTGCTTGCGGTGCGGAGCGAACAAGGTCTCCTAGAGCGAGACGTGTACAAACAAGCTTACAAATTCGTGAAAGGCACCGGTTTTGCGCCATTTCCAAGCAAAAAAAGGTCTATCGAGCTTGCTCGATAGACCGATCGCATTTAGCCCCCCGCATTCTAACAGGGGGGAATAATGTGAAAAATTATGGTAGTAATGCTTGATATATAGGCATTTCTTTTGGTTGCACACTTAAAAAAAATCACGATTTTGACAACTAAATTTTTAAATAAAAAAGCTTTACAGTTTAATTCAAATGTGTTTTAATATATCTATCAGTACTTGCCACGCCTCTGATTTAATATCATGCGCATT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CAGACAAAAAGACCCCYAAAA

StartP-valueSite
1322.32e-12CCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAA
1102.32e-12CCCCCAAAAACAGACAAAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAA
1544.16e-12CCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAGATTCTGCAC
884.16e-12CCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAACAGACAAAA
661.27e-10GGGTCAAGCCCCTAATTAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAA

Motif AAAGAGVTTT

StartP-valueSite
2281.68e-06AGAGGTTTAAAAAGAGGTTTAAAAAGAGAT
2161.68e-06AGCCGACGGTAAAGAGGTTTAAAAAGAGGT
393.53e-06ACAAAATTATAAAGAGCTTTCTAATAGGGG
4336.69e-06AACGTTGTTTAAAGAGATTTTTTAGAGGCT
10181.33e-05TTTTTAAATAAAAAAGCTTTACAGTTTAAT

Motif GCKGTGMGGG

StartP-valueSite
5281.75e-06CACCTTACAGGCGGTCAGGGCAAGCCCTAA
3602.48e-06TCGCTAAAAAGGTGTGAGGGAAAAACACCC
7562.63e-06AAAGCTGCTTGCGGTGCGGAGCGAACAAGG
2551.16e-05GATTATAAAAGAGGAGAGGGGCAAAATTTC
4501.52e-05TTTTTTAGAGGCTCTGCGCGCTCGTTTAAG
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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pORI00000922 87.593 669 62 17 1 661 665 10 0.0 756
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pORI00000597 79.863 293 49 9 269 558 590 305 0.0 206
pORI00001003 75.92 299 54 14 265 553 275 565 3.71e-33 137
pORI00000887 75.92 299 54 14 265 553 896 606 3.71e-33 137
pORI00000738 75.92 299 54 14 265 553 1173 883 3.71e-33 137
pORI00000376 100.0 39 0 0 520 558 539 501 1.06e-13 73
pORI00000507 97.368 38 1 0 521 558 982 945 1.77e-11 66
pORI00000397 93.182 44 3 0 515 558 1000 1043 1.77e-11 66
pORI00000378 97.368 38 1 0 521 558 981 944 1.77e-11 66
pORI00000208 97.368 38 1 0 521 558 981 944 1.77e-11 66
pORI00000078 97.368 38 1 0 521 558 987 950 1.77e-11 66
pORI00000007 97.368 38 1 0 521 558 983 946 1.77e-11 66