| RefSeq | NZ_CP009503.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | aORI10010378 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1984 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.2878 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 4136435..1081 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
TATTTAACTCCAGTTTTTTAGTCAACTTCATTTTTAGTCAACTTCATTTTTAGTCAACTTCATTTTTGGTAAACTTAATTTTTTCAGTTCAAATGATAATTACTGTCACCATTGTAGAATTAAATTTAATTTTAAGACACGCTCTAAGATTACTTCCATCTGCAAATTTGCCAGTTACGGCGATTCTGTCAGCAGCTGTATTCAGAGACGTATATTGTTTATAATGTATTTTTATTATGTGGGATATATATTATTGTGTATAATTTATGACAATTCTATAATACTATTTTGTTATTCAGACATTAAAAACGGTTCGTTTTATTTCGGTACATTAAACTGATTATTAAGAGTATTACTATTTTCGATTTATTTCTTCAAAAATTCCTTTGTTATCTTAATTTGACGAGTGAAATTGCAGTAGAAAACATTGAATCAACAGTTCTAGAAACTAAATCAACAATTCTAAAACAAATCTTTAAAAAAACAATATGATTTGAAAAATATGCAATTTGAATAAAATTTATAAGTTAATATGTAAACATAGCCAATTTTTTATGTATTTACACTCCAGATATATAGTTACTTTTAATGTCTATTCCTTGTTTTCGGCCCAACTGTCTTTATTTATTAAGCAATCGTTTTGTTATCAATGATCTTATTTACATCAAAACGGTTTTCATTTTTAACATATCCTCTTTCGTTTCAGTATAGCCGTTTGTTTACCTCGTATTATTATTCTATACTAAATATTTTTAATCATTCAATGGAAGTGAAGGGGTCCACAATTTTCTGATATTTTTCCATGCGAAAAAGGGGATTTAAAACTGACCTTCAGGGGTGCTGGAATTGTAAATCTTTTATTTTATTGAAACTGAGCTTAATGGTATCGATTTCTTTAGAGGGGTTTTAAGGAACATATCTGTTCCAGTAGAAACAGAGGGGTCTTCACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATACTTTGAAATCAAAGGTTTATATATAACTTTCATCTAAAATTTTGGGTAAAGAAGATCCTGATTACAGGTTTCATCAGGGCTTAAGAGATGCTTTAAAATGCGCAACTCACTCTTCAGTTTATCCCCAGCCTTTTAGGAACAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTATCTATCCATCTCCCTTTGTAAATCTCTCATCCGTAAGGTTTGACTTATCAAAATTATACAAAAAAACAGGTCAGGTTTCCAGAATTACTGAGAATCAAGAGTGAAAGACATTTCGAAAATTAACAATTACGCCTTTCCATATATCTTTTCCATGTCCGGGTGATATTATGCCTAAACATATTCAGTCTGATGTATTCTGTCTGATATATTCTGTCTGGATAGTGTTCTGAGTCTCCAATATACTCACTTCGAAATAATGAAAATGGTTCAAAAAATCAAAAAATCTTTCAAAATCTGGGTTTAAATGTTTGCAAGTTTTTCCTTTATATGTATTTATGGAAAATTAGTGATATGATTCCTTAAGCAGGACTTTCACTCATTTAAACTGGATACAATAATCGAGACTGGAAAACGGAATTCAAAAATTAAGATTGAAAAACGGACCTGGAAAAACTGAGATTAAAATTTAAAATAAAAAAAAGAAAAAACACATAAATTCATAAGCGTGTGTACATTCATATAATTTCTTTAATTGGTTATTACCTTTGCAGATTTTATCTGTGTATTAACCGTACATATTAATTGTCCATATAAACCTAATTGTCCATATAAACCATCTTAAAATCGTACATATTAATTGTCCATATAAACCATCTTCATATAAACCATCTTAAAATTGTACATATTAATTGTCCATATAAACCATCTTCATATAAACCATCTTAAAACCGTACATATTAATTGTCCATATAAACCATTTTAACTCGTTACATCTGTAGTATTATAACTTTTATGCGAAGAGGATCATTC
TATTTAACTCCAGTTTTTTAGTCAACTTCATTTTTAGTCAACTTCATTTTTAGTCAACTTCATTTTTGGTAAACTTAATTTTTTCAGTTCAAATGATAATTACTGTCACCATTGTAGAATTAAATTTAATTTTAAGACACGCTCTAAGATTACTTCCATCTGCAAATTTGCCAGTTACGGCGATTCTGTCAGCAGCTGTATTCAGAGACGTATATTGTTTATAATGTATTTTTATTATGTGGGATATATATTATTGTGTATAATTTATGACAATTCTATAATACTATTTTGTTATTCAGACATTAAAAACGGTTCGTTTTATTTCGGTACATTAAACTGATTATTAAGAGTATTACTATTTTCGATTTATTTCTTCAAAAATTCCTTTGTTATCTTAATTTGACGAGTGAAATTGCAGTAGAAAACATTGAATCAACAGTTCTAGAAACTAAATCAACAATTCTAAAACAAATCTTTAAAAAAACAATATGATTTGAAAAATATGCAATTTGAATAAAATTTATAAGTTAATATGTAAACATAGCCAATTTTTTATGTATTTACACTCCAGATATATAGTTACTTTTAATGTCTATTCCTTGTTTTCGGCCCAACTGTCTTTATTTATTAAGCAATCGTTTTGTTATCAATGATCTTATTTACATCAAAACGGTTTTCATTTTTAACATATCCTCTTTCGTTTCAGTATAGCCGTTTGTTTACCTCGTATTATTATTCTATACTAAATATTTTTAATCATTCAATGGAAGTGAAGGGGTCCACAATTTTCTGATATTTTTCCATGCGAAAAAGGGGATTTAAAACTGACCTTCAGGGGTGCTGGAATTGTAAATCTTTTATTTTATTGAAACTGAGCTTAATGGTATCGATTTCTTTAGAGGGGTTTTAAGGAACATATCTGTTCCAGTAGAAACAGAGGGGTCTTCACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATACTTTGAAATCAAAGGTTTATATATAACTTTCATCTAAAATTTTGGGTAAAGAAGATCCTGATTACAGGTTTCATCAGGGCTTAAGAGATGCTTTAAAATGCGCAACTCACTCTTCAGTTTATCCCCAGCCTTTTAGGAACAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTATCTATCCATCTCCCTTTGTAAATCTCTCATCCGTAAGGTTTGACTTATCAAAATTATACAAAAAAACAGGTCAGGTTTCCAGAATTACTGAGAATCAAGAGTGAAAGACATTTCGAAAATTAACAATTACGCCTTTCCATATATCTTTTCCATGTCCGGGTGATATTATGCCTAAACATATTCAGTCTGATGTATTCTGTCTGATATATTCTGTCTGGATAGTGTTCTGAGTCTCCAATATACTCACTTCGAAATAATGAAAATGGTTCAAAAAATCAAAAAATCTTTCAAAATCTGGGTTTAAATGTTTGCAAGTTTTTCCTTTATATGTATTTATGGAAAATTAGTGATATGATTCCTTAAGCAGGACTTTCACTCATTTAAACTGGATACAATAATCGAGACTGGAAAACGGAATTCAAAAATTAAGATTGAAAAACGGACCTGGAAAAACTGAGATTAAAATTTAAAATAAAAAAAAGAAAAAACACATAAATTCATAAGCGTGTGTACATTCATATAATTTCTTTAATTGGTTATTACCTTTGCAGATTTTATCTGTGTATTAACCGTACATATTAATTGTCCATATAAACCTAATTGTCCATATAAACCATCTTAAAATCGTACATATTAATTGTCCATATAAACCATCTTCATATAAACCATCTTAAAATTGTACATATTAATTGTCCATATAAACCATCTTCATATAAACCATCTTAAAACCGTACATATTAATTGTCCATATAAACCATTTTAACTCGTTACATCTGTAGTATTATAACTTTTATGCGAAGAGGATCATTC
TATTTAACTCCAGTTTTTTAGTCAACTTCATTTTTAGTCAACTTCATTTTTAGTCAACTTCATTTTTGGTAAACTTAATTTTTTCAGTTCAAATGATAATTACTGTCACCATTGTAGAATTAAATTTAATTTTAAGACACGCTCTAAGATTACTTCCATCTGCAAATTTGCCAGTTACGGCGATTCTGTCAGCAGCTGTATTCAGAGACGTATATTGTTTATAATGTATTTTTATTATGTGGGATATATATTATTGTGTATAATTTATGACAATTCTATAATACTATTTTGTTATTCAGACATTAAAAACGGTTCGTTTTATTTCGGTACATTAAACTGATTATTAAGAGTATTACTATTTTCGATTTATTTCTTCAAAAATTCCTTTGTTATCTTAATTTGACGAGTGAAATTGCAGTAGAAAACATTGAATCAACAGTTCTAGAAACTAAATCAACAATTCTAAAACAAATCTTTAAAAAAACAATATGATTTGAAAAATATGCAATTTGAATAAAATTTATAAGTTAATATGTAAACATAGCCAATTTTTTATGTATTTACACTCCAGATATATAGTTACTTTTAATGTCTATTCCTTGTTTTCGGCCCAACTGTCTTTATTTATTAAGCAATCGTTTTGTTATCAATGATCTTATTTACATCAAAACGGTTTTCATTTTTAACATATCCTCTTTCGTTTCAGTATAGCCGTTTGTTTACCTCGTATTATTATTCTATACTAAATATTTTTAATCATTCAATGGAAGTGAAGGGGTCCACAATTTTCTGATATTTTTCCATGCGAAAAAGGGGATTTAAAACTGACCTTCAGGGGTGCTGGAATTGTAAATCTTTTATTTTATTGAAACTGAGCTTAATGGTATCGATTTCTTTAGAGGGGTTTTAAGGAACATATCTGTTCCAGTAGAAACAGAGGGGTCTTCACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATACTTTGAAATCAAAGGTTTATATATAACTTTCATCTAAAATTTTGGGTAAAGAAGATCCTGATTACAGGTTTCATCAGGGCTTAAGAGATGCTTTAAAATGCGCAACTCACTCTTCAGTTTATCCCCAGCCTTTTAGGAACAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTATCTATCCATCTCCCTTTGTAAATCTCTCATCCGTAAGGTTTGACTTATCAAAATTATACAAAAAAACAGGTCAGGTTTCCAGAATTACTGAGAATCAAGAGTGAAAGACATTTCGAAAATTAACAATTACGCCTTTCCATATATCTTTTCCATGTCCGGGTGATATTATGCCTAAACATATTCAGTCTGATGTATTCTGTCTGATATATTCTGTCTGGATAGTGTTCTGAGTCTCCAATATACTCACTTCGAAATAATGAAAATGGTTCAAAAAATCAAAAAATCTTTCAAAATCTGGGTTTAAATGTTTGCAAGTTTTTCCTTTATATGTATTTATGGAAAATTAGTGATATGATTCCTTAAGCAGGACTTTCACTCATTTAAACTGGATACAATAATCGAGACTGGAAAACGGAATTCAAAAATTAAGATTGAAAAACGGACCTGGAAAAACTGAGATTAAAATTTAAAATAAAAAAAAGAAAAAACACATAAATTCATAAGCGTGTGTACATTCATATAATTTCTTTAATTGGTTATTACCTTTGCAGATTTTATCTGTGTATTAACCGTACATATTAATTGTCCATATAAACCTAATTGTCCATATAAACCATCTTAAAATCGTACATATTAATTGTCCATATAAACCATCTTCATATAAACCATCTTAAAATTGTACATATTAATTGTCCATATAAACCATCTTCATATAAACCATCTTAAAACCGTACATATTAATTGTCCATATAAACCATTTTAACTCGTTACATCTGTAGTATTATAACTTTTATGCGAAGAGGATCATTC
ORB
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif SYWSATATWAACCATCTTWAAAYYGTACATATTAATTGTCCATATAAACC
Motif VAGGGGT
Motif GTCAACTTCATTTTT
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|