RefSeq NC_007355.1
DoriC accession number aORI10010025
OriC length 2165 nt
OriC AT content 0.7376
The location of oriC region 1189197..1191361 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
GAAAATCCTCTATAAAAATTATGATATTAGGCATTTAAGGAATTAAGGAATTAAGATACTTCTAACGTAGATAATTAATATAATGTGAACCATTGCACGTCAAACTAATTGATAGTAATATTACTATGCAAATTATATATAATAAATTAATACAGTTGATAAACTCTGTTTTTTAAATGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTACTACTACCTGAAATCAGGAGGAATTTTAATAGTCTGCAACCAATTTAATCCTCCGAATCTACATCTATTAAATATTACGTATTTAGAGCTACGTTTTTAGAGTTATGTTTTAGATTTTCCTTTTCAAATGGTTGCACAATTATAACCACAACTGCTTGATAAATTTTAGACTGAATACATAATAACCTTTTAGCGGGTTTCAATAATTATTGTAATGGTCATTATTGTAATAGTCATCAAAGGATTTTAGAGGGTTATAAATGGGGGTTAATGTAAGGGTATTTGGAAAGAGAGAAAGAGGGGAAAAGGTTAAACTCTTAATTCCGAAGTCTTAACTCTCAATATCTGGAACTAAAGTTTATTTTAGGATTTCTAAAATTTTACTTCATTATTGTTTGTACCTTTATGAAAAACCCTATAAATTCCGCTAATAAGGAGAAAGGGGTAGAAGATACATCTTTCTTATAGTTAATGCCTGAAACTCTCATTTTCTACTAATTGCTGATAAAATTGCGGGCGAGTCTTAAGTATTAAGATACCTCGCAAGCCAGATAAAATCTATATTCCCGATCTTCTTTTGTTAAAATTTTAGGTAAAATTGGTTTATAAGCAAGTAATTTTAAGTCATATTTGCAGTAGATCCAATGGAAGTACACCGTATTAATTGTTATGGTAAAGACCCCTGTATTTCCACTGGAAAAGATTTATACCTTAAATACCTGCCATAAAAACCAATGTTCTCTAGCTTATTATAGCTGAAACAAAAAATTATGAGTTCCAGAACCAATGTAGGTTAAATTTAAACCCTTTCTTTCGAATGGAATAAGTTATGAAAATTATAATATTTTTACATAAAATTAAAAAATAAAAATTTTAAGATAAAATTAGAATTATGTGAATAAAATCCCTGTGAACAAATAAGTTTACAAAGTTGAGACAACTTTAGAGCAATCTTTAGAGTGATTTTTAAATTTGAGATTGTTTGCATTGAGTAAGTGAGAAAAGATAAAGAAAACAGAAAAAGCTAGGAAATTTAAGAAAGTTTGGAATAATGGAGAAGTTTGGAATAATGGAGAAGTTAGGGAAAAAAACACAAAGAGAAAAGTAAAAACAAAAAGTAGACCCCTGTATTTCCACTGGAAAGTTTATATAACCCCCAGACCCCATGATTTCCATTAAAGAGATTCAAGATCCAAGGCAGTAAAATAAAATAAAATTTTATTTTGTTTATTGGTAAAATAATGTTGTTTGGTTATAGAATTAATACTATATATATGTTATTATTAAAAAAGTTAGTTTGTTTTTAGAGAAGCTTTTCTTAATAGTAAAAAATTTGATTTAATATTTTCATTGAATATTTTTATTTTGAGTTTTTATTGATACTCAATCTATCAGAAAAAGTATGATTTTCAAAAAATTGAGAAATCTAAATTACATGTTCTGAGAAATTTACATTTTCTGAACCTATAAAAATCTCTCCAGTCGAAATATAGGGGTCTCCCTCTAAAGCAGACATTAATGCAATTATGATACCTTAACATACAGTCCTTTTTTTAGATCTTGTATACTTCCTCACCCTATTACTGCTCACATAACTTTTTTGTGGAACTTTTTTAACTTTCTAATACTTTTAATCACTTGCCGAAAGTTAGTCTCTTCTGATGTGCATTAGGAGATTCTGATGCATCGTTAGGAGAGTTACTTGCTAATTTAGAGTTATATTCCATAAGTATTTTAAATAAAATTGGTTTTACTTTATCCAC
GAAAATCCTCTATAAAAATTATGATATTAGGCATTTAAGGAATTAAGGAATTAAGATACTTCTAACGTAGATAATTAATATAATGTGAACCATTGCACGTCAAACTAATTGATAGTAATATTACTATGCAAATTATATATAATAAATTAATACAGTTGATAAACTCTGTTTTTTAAATGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTACTACTACCTGAAATCAGGAGGAATTTTAATAGTCTGCAACCAATTTAATCCTCCGAATCTACATCTATTAAATATTACGTATTTAGAGCTACGTTTTTAGAGTTATGTTTTAGATTTTCCTTTTCAAATGGTTGCACAATTATAACCACAACTGCTTGATAAATTTTAGACTGAATACATAATAACCTTTTAGCGGGTTTCAATAATTATTGTAATGGTCATTATTGTAATAGTCATCAAAGGATTTTAGAGGGTTATAAATGGGGGTTAATGTAAGGGTATTTGGAAAGAGAGAAAGAGGGGAAAAGGTTAAACTCTTAATTCCGAAGTCTTAACTCTCAATATCTGGAACTAAAGTTTATTTTAGGATTTCTAAAATTTTACTTCATTATTGTTTGTACCTTTATGAAAAACCCTATAAATTCCGCTAATAAGGAGAAAGGGGTAGAAGATACATCTTTCTTATAGTTAATGCCTGAAACTCTCATTTTCTACTAATTGCTGATAAAATTGCGGGCGAGTCTTAAGTATTAAGATACCTCGCAAGCCAGATAAAATCTATATTCCCGATCTTCTTTTGTTAAAATTTTAGGTAAAATTGGTTTATAAGCAAGTAATTTTAAGTCATATTTGCAGTAGATCCAATGGAAGTACACCGTATTAATTGTTATGGTAAAGACCCCTGTATTTCCACTGGAAAAGATTTATACCTTAAATACCTGCCATAAAAACCAATGTTCTCTAGCTTATTATAGCTGAAACAAAAAATTATGAGTTCCAGAACCAATGTAGGTTAAATTTAAACCCTTTCTTTCGAATGGAATAAGTTATGAAAATTATAATATTTTTACATAAAATTAAAAAATAAAAATTTTAAGATAAAATTAGAATTATGTGAATAAAATCCCTGTGAACAAATAAGTTTACAAAGTTGAGACAACTTTAGAGCAATCTTTAGAGTGATTTTTAAATTTGAGATTGTTTGCATTGAGTAAGTGAGAAAAGATAAAGAAAACAGAAAAAGCTAGGAAATTTAAGAAAGTTTGGAATAATGGAGAAGTTTGGAATAATGGAGAAGTTAGGGAAAAAAACACAAAGAGAAAAGTAAAAACAAAAAGTAGACCCCTGTATTTCCACTGGAAAGTTTATATAACCCCCAGACCCCATGATTTCCATTAAAGAGATTCAAGATCCAAGGCAGTAAAATAAAATAAAATTTTATTTTGTTTATTGGTAAAATAATGTTGTTTGGTTATAGAATTAATACTATATATATGTTATTATTAAAAAAGTTAGTTTGTTTTTAGAGAAGCTTTTCTTAATAGTAAAAAATTTGATTTAATATTTTCATTGAATATTTTTATTTTGAGTTTTTATTGATACTCAATCTATCAGAAAAAGTATGATTTTCAAAAAATTGAGAAATCTAAATTACATGTTCTGAGAAATTTACATTTTCTGAACCTATAAAAATCTCTCCAGTCGAAATATAGGGGTCTCCCTCTAAAGCAGACATTAATGCAATTATGATACCTTAACATACAGTCCTTTTTTTAGATCTTGTATACTTCCTCACCCTATTACTGCTCACATAACTTTTTTGTGGAACTTTTTTAACTTTCTAATACTTTTAATCACTTGCCGAAAGTTAGTCTCTTCTGATGTGCATTAGGAGATTCTGATGCATCGTTAGGAGAGTTACTTGCTAATTTAGAGTTATATTCCATAAGTATTTTAAATAAAATTGGTTTTACTTTATCCAC
GAAAATCCTCTATAAAAATTATGATATTAGGCATTTAAGGAATTAAGGAATTAAGATACTTCTAACGTAGATAATTAATATAATGTGAACCATTGCACGTCAAACTAATTGATAGTAATATTACTATGCAAATTATATATAATAAATTAATACAGTTGATAAACTCTGTTTTTTAAATGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTACTACTACCTGAAATCAGGAGGAATTTTAATAGTCTGCAACCAATTTAATCCTCCGAATCTACATCTATTAAATATTACGTATTTAGAGCTACGTTTTTAGAGTTATGTTTTAGATTTTCCTTTTCAAATGGTTGCACAATTATAACCACAACTGCTTGATAAATTTTAGACTGAATACATAATAACCTTTTAGCGGGTTTCAATAATTATTGTAATGGTCATTATTGTAATAGTCATCAAAGGATTTTAGAGGGTTATAAATGGGGGTTAATGTAAGGGTATTTGGAAAGAGAGAAAGAGGGGAAAAGGTTAAACTCTTAATTCCGAAGTCTTAACTCTCAATATCTGGAACTAAAGTTTATTTTAGGATTTCTAAAATTTTACTTCATTATTGTTTGTACCTTTATGAAAAACCCTATAAATTCCGCTAATAAGGAGAAAGGGGTAGAAGATACATCTTTCTTATAGTTAATGCCTGAAACTCTCATTTTCTACTAATTGCTGATAAAATTGCGGGCGAGTCTTAAGTATTAAGATACCTCGCAAGCCAGATAAAATCTATATTCCCGATCTTCTTTTGTTAAAATTTTAGGTAAAATTGGTTTATAAGCAAGTAATTTTAAGTCATATTTGCAGTAGATCCAATGGAAGTACACCGTATTAATTGTTATGGTAAAGACCCCTGTATTTCCACTGGAAAAGATTTATACCTTAAATACCTGCCATAAAAACCAATGTTCTCTAGCTTATTATAGCTGAAACAAAAAATTATGAGTTCCAGAACCAATGTAGGTTAAATTTAAACCCTTTCTTTCGAATGGAATAAGTTATGAAAATTATAATATTTTTACATAAAATTAAAAAATAAAAATTTTAAGATAAAATTAGAATTATGTGAATAAAATCCCTGTGAACAAATAAGTTTACAAAGTTGAGACAACTTTAGAGCAATCTTTAGAGTGATTTTTAAATTTGAGATTGTTTGCATTGAGTAAGTGAGAAAAGATAAAGAAAACAGAAAAAGCTAGGAAATTTAAGAAAGTTTGGAATAATGGAGAAGTTTGGAATAATGGAGAAGTTAGGGAAAAAAACACAAAGAGAAAAGTAAAAACAAAAAGTAGACCCCTGTATTTCCACTGGAAAGTTTATATAACCCCCAGACCCCATGATTTCCATTAAAGAGATTCAAGATCCAAGGCAGTAAAATAAAATAAAATTTTATTTTGTTTATTGGTAAAATAATGTTGTTTGGTTATAGAATTAATACTATATATATGTTATTATTAAAAAAGTTAGTTTGTTTTTAGAGAAGCTTTTCTTAATAGTAAAAAATTTGATTTAATATTTTCATTGAATATTTTTATTTTGAGTTTTTATTGATACTCAATCTATCAGAAAAAGTATGATTTTCAAAAAATTGAGAAATCTAAATTACATGTTCTGAGAAATTTACATTTTCTGAACCTATAAAAATCTCTCCAGTCGAAATATAGGGGTCTCCCTCTAAAGCAGACATTAATGCAATTATGATACCTTAACATACAGTCCTTTTTTTAGATCTTGTATACTTCCTCACCCTATTACTGCTCACATAACTTTTTTGTGGAACTTTTTTAACTTTCTAATACTTTTAATCACTTGCCGAAAGTTAGTCTCTTCTGATGTGCATTAGGAGATTCTGATGCATCGTTAGGAGAGTTACTTGCTAATTTAGAGTTATATTCCATAAGTATTTTAAATAAAATTGGTTTTACTTTATCCAC
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif TTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTG

StartP-valueSite
3699.30e-15TTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTACTACT
3389.30e-15TTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTT
2759.30e-15TTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTT
2439.30e-15TTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTT
1671.88e-13TGATAAACTCTGTTTTTTAAATGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTT

Motif RACCCCWKTATTTCCACTRRAAAR

StartP-valueSite
15231.18e-16ACAAAAAGTAGACCCCTGTATTTCCACTGGAAAGTTTATATAAC
10803.55e-15TTATGGTAAAGACCCCTGTATTTCCACTGGAAAAGATTTATACC
15626.77e-12ATAACCCCCAGACCCCATGATTTCCATTAAAGAGATTCAAGATC
12042.82e-10GGTTAAATTTAAACCCTTTCTTTCGAATGGAATAAGTTATGAAA
8143.53e-10CTTTATGAAAAACCCTATAAATTCCGCTAATAAGGAGAAAGGGG

Motif TTTTAATTTTAAGTG

StartP-valueSite
3215.95e-08TTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTT
3055.95e-08TTTTAAGTGTTTTTAATTTTAAGTGTTTTTAATTT
2265.95e-08ATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTT
2115.95e-08ATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTT
1965.95e-08ATTTTAAGTGTTTTAATTTTAAGTGTTTTAATTTT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010289 100.0 2165 0 0 1 2165 2165 1 0.0 3999
aORI10010025 100.0 2165 0 0 1 2165 1 2165 0.0 3999
aORI10010291 84.075 1168 117 50 170 1303 1962 830 0.0 1062
aORI10010376 86.618 822 87 19 484 1303 979 179 0.0 887
aORI10010290 86.618 822 87 19 484 1303 1630 830 0.0 887
aORI10010382 84.403 904 100 30 871 1766 1444 574 0.0 850
aORI10010381 84.181 904 101 31 871 1766 1421 552 0.0 839
aORI10010380 84.288 611 81 14 751 1354 698 96 0.0 582
aORI10010379 79.213 178 33 4 947 1122 1110 935 2.15e-28 121
aORI10010378 79.213 178 33 4 947 1122 1078 903 2.15e-28 121
aORI10010277 78.571 182 34 4 1509 1688 1987 2165 1e-26 115