RefSeq | NZ_CP009511.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010282 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1628 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.2703 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 4065543..619 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
GATTTAACTCCATTTTTTAGCAAAAGCCTATTTTTTAATCAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTATGAATTGCGTTTCATAAATTGCGTTTTATGAGTCACATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTTTCATGTATTGCATCTTCATGCACATTTATACTAAAGCTGTAGATCAGTATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAATTTATTTTAAGATTATTATTCAATTCATTCTTTTGAATAATTTCTCTGATGAAATATAACATTAAAGACTACAGTAAAAATTACTGAATTATTAACTTCAAATAACTGAGTTAATAACTTCAAAAATCTATTTTTAGAATAAATATTTGGAAAATAAATACTTGAAAATAGAGTGTCTTAAATAAAAATTAATAAGTTAATACGTATACATATAAATTTTTTTGATTATTTATACTTTTTATATATGTTTAGTTTCAGGTTATATTGCTTTTTTCTTCCTAACTGTTTTTTATTTATTATTAATTTTTTTCTTTTCTTAATTGTTATTCGTATCAAGACTGTTTTCATTTTTAATACAACCACTTTCGTTTCGATTCAGGAACCTGTTTACTTCAATTATTATTTATTTATAAATATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACCCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTGACTTCAAAAATTACAAAATTTTTGATTTTTTATTTTATTTTCACATGCTCTATTGATATTGATTTTTTTGTATAATATTTAAGGCAAATAACGGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTGAACTGAAATTGGATGCTTATATACAAATTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAGAATGTTCCGAATACACATTCAATCAGGGATTAAGAGATACTTTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTTATTAGTATCCCTTGAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTGTCTATCCATTCTTCCCCTGTGAATCTATTATTATTTATGTTCACTTATTAAGGTTATACAAAAATAATATTTTGGGATTTCAGAATTTCCAGGAACTGAGAATAAAAAACACTTTAAAAAATAGCAGTTAAACCTTCCCAAATATCTTTGCTATGTAGAGTTTAACTATGCAGTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAAACATTCTTTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCTGCATATTATGTCAGCTATATGTTAGGCTATCCTAACCCGTTAAATCCAGATATTATAACAAATCCATGATATTATAACTTTTATTAAGAGGGTCATT
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ORB
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif CATTTATCGCTTCTCATKTATCGCTTCTCGTGTATCGCTT
Motif SHTYCAVTSGAAAHAAAGGRK
Motif AAYCAAWYWYRTTTTTAATTAAACTCGT
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The result of BLAST |
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