RefSeq NZ_CP009528.1
DoriC accession number aORI10010290
OriC length 2226 nt
OriC AT content 0.2543
The location of oriC region 4532199..1215 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATATACCTGCCAAATTACCAAGTAATTTTCATAACAACAGGGAGAGTAAGTATCCAAGATCTAAAAAAGGAATGTATGTTAAAATCTCATAATCATATTAATGTCTGTAATATCTGCTTTAGAGGGAGACACCTATATTTCGAGTGGAGACGTTTTCATAGATCTAGAAGACGCAAATTTCTCAGAACATATAGCTTAGATTTAGTTTAGATTTATAAATTTTTTGAAAATGAATACTTTTTCTGATAGATTGGTTATCAATAAAAAGAATATATTTAATGAATATATAAAATTAAATTTTTTTATATTAAGAAGAACTGTTCTAAAAACAAACTAACCTTTTTAATAATAAAATATATATAGTATTAATTCTATAACAAAACAACATTATTTTACTGATAAACAAAATAAAACTCTATTTTATTTTGCTGCCTAGAATCTCTAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGTGTTATATAAATGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCTCTCTGTTTTTACTTTTCTCTCTCTGTTTTTTTCTTCCCTAACTTTCTTTAATTTCCTTTCTTTATTTTTCACCTTCTCACTTTTTTCCTTTCCTTGATTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATATACCTGCCAAATTACCAAGTAATTTTCATAACAACAGGGAGAGTAAGTATCCAAGATCTAAAAAAGGAATGTATGTTAAAATCTCATAATCATATTAATGTCTGTAATATCTGCTTTAGAGGGAGACACCTATATTTCGAGTGGAGACGTTTTCATAGATCTAGAAGACGCAAATTTCTCAGAACATATAGCTTAGATTTAGTTTAGATTTATAAATTTTTTGAAAATGAATACTTTTTCTGATAGATTGGTTATCAATAAAAAGAATATATTTAATGAATATATAAAATTAAATTTTTTTATATTAAGAAGAACTGTTCTAAAAACAAACTAACCTTTTTAATAATAAAATATATATAGTATTAATTCTATAACAAAACAACATTATTTTACTGATAAACAAAATAAAACTCTATTTTATTTTGCTGCCTAGAATCTCTAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGTGTTATATAAATGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCTCTCTGTTTTTACTTTTCTCTCTCTGTTTTTTTCTTCCCTAACTTTCTTTAATTTCCTTTCTTTATTTTTCACCTTCTCACTTTTTTCCTTTCCTTGATTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATATACCTGCCAAATTACCAAGTAATTTTCATAACAACAGGGAGAGTAAGTATCCAAGATCTAAAAAAGGAATGTATGTTAAAATCTCATAATCATATTAATGTCTGTAATATCTGCTTTAGAGGGAGACACCTATATTTCGAGTGGAGACGTTTTCATAGATCTAGAAGACGCAAATTTCTCAGAACATATAGCTTAGATTTAGTTTAGATTTATAAATTTTTTGAAAATGAATACTTTTTCTGATAGATTGGTTATCAATAAAAAGAATATATTTAATGAATATATAAAATTAAATTTTTTTATATTAAGAAGAACTGTTCTAAAAACAAACTAACCTTTTTAATAATAAAATATATATAGTATTAATTCTATAACAAAACAACATTATTTTACTGATAAACAAAATAAAACTCTATTTTATTTTGCTGCCTAGAATCTCTAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGTGTTATATAAATGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCTCTCTGTTTTTACTTTTCTCTCTCTGTTTTTTTCTTCCCTAACTTTCTTTAATTTCCTTTCTTTATTTTTCACCTTCTCACTTTTTTCCTTTCCTTGATTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC

ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif AAAACRCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAA

StartP-valueSite
19318.01e-21GTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACAC
18878.01e-21GTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACAC
18438.01e-21GTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACAC
17831.77e-20TTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACG
17381.77e-20AGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACG

Motif TTYYAGTGGAAATWWAGGGKTY

StartP-valueSite
5299.15e-16TATATAAATGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCTCTCTGT
10313.77e-14TCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAA
4902.84e-10TCTCTAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGTGTTAT
9083.74e-10TCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACC
10028.82e-10AATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTC

Motif YYTTWMYTTYTTTAMTTTCCTWKCTTTTT

StartP-valueSite
6641.12e-14TTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTT
7192.37e-12CCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTT
5914.61e-12TTTTTTCTTCCCTAACTTTCTTTAATTTCCTTTCTTTATTTTTCACCTT
5522.89e-11GCAGGGGTCTTCTCTCTGTTTTTACTTTTCTCTCTCTGTTTTTTTCTTC
6285.23e-11ATTTTTCACCTTCTCACTTTTTTCCTTTCCTTGATTTTTATAACTTCCT

The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010290 100.0 2226 0 0 1 2226 1 2226 0.0 4111
aORI10010291 99.85 2000 2 1 1 2000 1 1999 0.0 3675
aORI10010291 98.171 492 2 4 1738 2226 1782 2269 0.0 852
aORI10010376 99.926 1348 1 0 653 2000 2 1349 0.0 2484
aORI10010376 98.163 490 6 3 1738 2226 1132 1619 0.0 852
aORI10010289 86.618 822 87 19 830 1630 863 1682 0.0 887
aORI10010025 86.618 822 87 19 830 1630 1303 484 0.0 887
aORI10010382 89.352 432 45 1 831 1261 1013 1444 0.0 542
aORI10010382 84.588 279 34 9 315 589 580 853 0.0 268
aORI10010382 88.991 109 12 0 1 109 1 109 7.91e-33 135
aORI10010380 84.258 559 74 13 830 1381 147 698 0.0 532
aORI10010381 88.194 432 50 1 831 1261 990 1421 0.0 514
aORI10010381 85.305 279 31 10 315 589 558 830 0.0 279
aORI10010381 88.991 109 12 0 1 109 1 109 7.91e-33 135
aORI10010277 76.654 514 106 14 846 1351 1635 1128 0.0 272
aORI10010379 75.182 274 61 7 893 1162 816 1086 6.16e-29 122
aORI10010378 75.182 274 61 7 893 1162 784 1054 6.16e-29 122