RefSeq | NZ_CP009528.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 2226 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.2543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 4532199..1215 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATATACCTGCCAAATTACCAAGTAATTTTCATAACAACAGGGAGAGTAAGTATCCAAGATCTAAAAAAGGAATGTATGTTAAAATCTCATAATCATATTAATGTCTGTAATATCTGCTTTAGAGGGAGACACCTATATTTCGAGTGGAGACGTTTTCATAGATCTAGAAGACGCAAATTTCTCAGAACATATAGCTTAGATTTAGTTTAGATTTATAAATTTTTTGAAAATGAATACTTTTTCTGATAGATTGGTTATCAATAAAAAGAATATATTTAATGAATATATAAAATTAAATTTTTTTATATTAAGAAGAACTGTTCTAAAAACAAACTAACCTTTTTAATAATAAAATATATATAGTATTAATTCTATAACAAAACAACATTATTTTACTGATAAACAAAATAAAACTCTATTTTATTTTGCTGCCTAGAATCTCTAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGTGTTATATAAATGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCTCTCTGTTTTTACTTTTCTCTCTCTGTTTTTTTCTTCCCTAACTTTCTTTAATTTCCTTTCTTTATTTTTCACCTTCTCACTTTTTTCCTTTCCTTGATTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATATACCTGCCAAATTACCAAGTAATTTTCATAACAACAGGGAGAGTAAGTATCCAAGATCTAAAAAAGGAATGTATGTTAAAATCTCATAATCATATTAATGTCTGTAATATCTGCTTTAGAGGGAGACACCTATATTTCGAGTGGAGACGTTTTCATAGATCTAGAAGACGCAAATTTCTCAGAACATATAGCTTAGATTTAGTTTAGATTTATAAATTTTTTGAAAATGAATACTTTTTCTGATAGATTGGTTATCAATAAAAAGAATATATTTAATGAATATATAAAATTAAATTTTTTTATATTAAGAAGAACTGTTCTAAAAACAAACTAACCTTTTTAATAATAAAATATATATAGTATTAATTCTATAACAAAACAACATTATTTTACTGATAAACAAAATAAAACTCTATTTTATTTTGCTGCCTAGAATCTCTAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGTGTTATATAAATGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCTCTCTGTTTTTACTTTTCTCTCTCTGTTTTTTTCTTCCCTAACTTTCTTTAATTTCCTTTCTTTATTTTTCACCTTCTCACTTTTTTCCTTTCCTTGATTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATATACCTGCCAAATTACCAAGTAATTTTCATAACAACAGGGAGAGTAAGTATCCAAGATCTAAAAAAGGAATGTATGTTAAAATCTCATAATCATATTAATGTCTGTAATATCTGCTTTAGAGGGAGACACCTATATTTCGAGTGGAGACGTTTTCATAGATCTAGAAGACGCAAATTTCTCAGAACATATAGCTTAGATTTAGTTTAGATTTATAAATTTTTTGAAAATGAATACTTTTTCTGATAGATTGGTTATCAATAAAAAGAATATATTTAATGAATATATAAAATTAAATTTTTTTATATTAAGAAGAACTGTTCTAAAAACAAACTAACCTTTTTAATAATAAAATATATATAGTATTAATTCTATAACAAAACAACATTATTTTACTGATAAACAAAATAAAACTCTATTTTATTTTGCTGCCTAGAATCTCTAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGTGTTATATAAATGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCTCTCTGTTTTTACTTTTCTCTCTCTGTTTTTTTCTTCCCTAACTTTCTTTAATTTCCTTTCTTTATTTTTCACCTTCTCACTTTTTTCCTTTCCTTGATTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
ORB
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif AAAACRCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAA
Motif TTYYAGTGGAAATWWAGGGKTY
Motif YYTTWMYTTYTTTAMTTTCCTWKCTTTTT
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|