RefSeq NZ_CP009509.1
DoriC accession number aORI10010281
OriC length 1586 nt
OriC AT content 0.2648
The location of oriC region 4095516..619 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
GATTTAACTCCATTTTTTAGCAAAAGCCTATTTTTTAATCAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTATGAATTGCGTTTCATAAATTGCGTTTTATGAGTCACATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTTTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATGTATTGCATCTTCATGCACATTTATACTATAGCTGTAGATCAGTATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAGTTATTTTAAGATTATTATTCAATTCATTCTTTTGAATAATTTCTCTGATGAAATATAACATTAAAGACTACAGTAAAAATTACTGAATTATTAACTTCAAATTACTGAGTTAATAACTTCAAAAATCTATTTTTAGAATAAATATTTGGAAAATAAATACTTGAAAATAGAGTGTCTTAAATAAAAATTAATAAGTTAATACGTATACATATAAATTTTTTTGATTATTTATACTTTTTATATATGTTTAGTTTCAGGTTATATTGCTTTTTTCTTCCTAACTGTTTTTTATTTATTATTAATTTTTTTCTTTTCTTAATTGTTATTCGTATCAAGACTGTTTTCATTTTTAATACAACCACTTTCGTTTCGATTCAGGAACCTGTTTACTTCAATTATTATTTATTTATAAATATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACCCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTGACTTCAAAAATTACAAAATTTTTGATTTTTTATTTTATTTTCACATGCTCTATTGATATTGATTTTTTTGTATAATATTTAAGGCAAATAACTGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTGAACTGAAATTGGATGCTTATATACAAATTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAGAATGTTCCGAATACACATTCAATCAGGGATTAAGAGATACTTTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTTATTAGTATCCCTTGAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTGTCTATCCATTCTTCCCCTGTGAATCTATTATTATTTATGTTCACTTATTAAGGTTATACAAAAATAATATTTTGGGATTTCAGAATTTCCAGAAACTGAGAATAAAAAACACTTTAAAAAATAGCAGTTAAACCTTCCCAAATATCTTTGCTATGTAGAGTTTAACTATGCAGTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAAACATTCTTTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCTGCATATTATGTCAGCTATATGTTAGGCTATCCTAACCCGTTAAATCCAGATATTATAACAAATCCATGATATTATAACTTTTATTAAGAGGGTCATT
GATTTAACTCCATTTTTTAGCAAAAGCCTATTTTTTAATCAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTATGAATTGCGTTTCATAAATTGCGTTTTATGAGTCACATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTTTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATGTATTGCATCTTCATGCACATTTATACTATAGCTGTAGATCAGTATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAGTTATTTTAAGATTATTATTCAATTCATTCTTTTGAATAATTTCTCTGATGAAATATAACATTAAAGACTACAGTAAAAATTACTGAATTATTAACTTCAAATTACTGAGTTAATAACTTCAAAAATCTATTTTTAGAATAAATATTTGGAAAATAAATACTTGAAAATAGAGTGTCTTAAATAAAAATTAATAAGTTAATACGTATACATATAAATTTTTTTGATTATTTATACTTTTTATATATGTTTAGTTTCAGGTTATATTGCTTTTTTCTTCCTAACTGTTTTTTATTTATTATTAATTTTTTTCTTTTCTTAATTGTTATTCGTATCAAGACTGTTTTCATTTTTAATACAACCACTTTCGTTTCGATTCAGGAACCTGTTTACTTCAATTATTATTTATTTATAAATATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACCCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTGACTTCAAAAATTACAAAATTTTTGATTTTTTATTTTATTTTCACATGCTCTATTGATATTGATTTTTTTGTATAATATTTAAGGCAAATAACTGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTGAACTGAAATTGGATGCTTATATACAAATTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAGAATGTTCCGAATACACATTCAATCAGGGATTAAGAGATACTTTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTTATTAGTATCCCTTGAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTGTCTATCCATTCTTCCCCTGTGAATCTATTATTATTTATGTTCACTTATTAAGGTTATACAAAAATAATATTTTGGGATTTCAGAATTTCCAGAAACTGAGAATAAAAAACACTTTAAAAAATAGCAGTTAAACCTTCCCAAATATCTTTGCTATGTAGAGTTTAACTATGCAGTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAAACATTCTTTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCTGCATATTATGTCAGCTATATGTTAGGCTATCCTAACCCGTTAAATCCAGATATTATAACAAATCCATGATATTATAACTTTTATTAAGAGGGTCATT
GATTTAACTCCATTTTTTAGCAAAAGCCTATTTTTTAATCAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTATGAATTGCGTTTCATAAATTGCGTTTTATGAGTCACATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTTTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATGTATTGCATCTTCATGCACATTTATACTATAGCTGTAGATCAGTATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAGTTATTTTAAGATTATTATTCAATTCATTCTTTTGAATAATTTCTCTGATGAAATATAACATTAAAGACTACAGTAAAAATTACTGAATTATTAACTTCAAATTACTGAGTTAATAACTTCAAAAATCTATTTTTAGAATAAATATTTGGAAAATAAATACTTGAAAATAGAGTGTCTTAAATAAAAATTAATAAGTTAATACGTATACATATAAATTTTTTTGATTATTTATACTTTTTATATATGTTTAGTTTCAGGTTATATTGCTTTTTTCTTCCTAACTGTTTTTTATTTATTATTAATTTTTTTCTTTTCTTAATTGTTATTCGTATCAAGACTGTTTTCATTTTTAATACAACCACTTTCGTTTCGATTCAGGAACCTGTTTACTTCAATTATTATTTATTTATAAATATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACCCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTGACTTCAAAAATTACAAAATTTTTGATTTTTTATTTTATTTTCACATGCTCTATTGATATTGATTTTTTTGTATAATATTTAAGGCAAATAACTGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTGAACTGAAATTGGATGCTTATATACAAATTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAGAATGTTCCGAATACACATTCAATCAGGGATTAAGAGATACTTTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTTATTAGTATCCCTTGAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTGTCTATCCATTCTTCCCCTGTGAATCTATTATTATTTATGTTCACTTATTAAGGTTATACAAAAATAATATTTTGGGATTTCAGAATTTCCAGAAACTGAGAATAAAAAACACTTTAAAAAATAGCAGTTAAACCTTCCCAAATATCTTTGCTATGTAGAGTTTAACTATGCAGTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAAACATTCTTTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCTGCATATTATGTCAGCTATATGTTAGGCTATCCTAACCCGTTAAATCCAGATATTATAACAAATCCATGATATTATAACTTTTATTAAGAGGGTCATT
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif TATCGCTTCTC

StartP-valueSite
2672.13e-07GCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATGTATTGCA
2532.13e-07GCTTTTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCT
2252.13e-07GCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCT
2112.13e-07GCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCT
1972.13e-07CATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCT

Motif TTTWATTAAACTSGTTTTYAAYCAARCAT

StartP-valueSite
1141.58e-14CAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTAT
821.58e-14CAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATT
501.97e-14CAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATT
3341.48e-10ATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGT
14513.19e-10TTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCT

Motif SHTYCAVTSGAAAHAAAGGRK

StartP-valueSite
9862.06e-13GCAAATAACTGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCAT
8221.11e-11TATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACC
8621.39e-11CCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTG
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010285 100.0 1586 0 0 1 1586 1 1586 0.0 2929
aORI10010284 100.0 1586 0 0 1 1586 1 1586 0.0 2929
aORI10010281 100.0 1586 0 0 1 1586 1 1586 0.0 2929
aORI10010283 99.937 1586 0 1 1 1586 1 1585 0.0 2922
aORI10010018 99.937 1586 0 1 1 1586 1585 1 0.0 2922
aORI10010018 77.982 218 31 13 48 251 1506 1292 1.57e-28 121
aORI10010018 77.982 218 31 13 80 294 1538 1335 1.57e-28 121
aORI10010282 96.649 1552 36 12 48 1586 80 1628 0.0 2564
aORI10010282 98.621 290 4 0 1 290 1 290 0.0 514
aORI10010282 79.263 217 37 7 80 290 48 262 9.33e-36 145
aORI10010192 99.666 299 1 0 120 418 1283 985 0.0 547
aORI10010192 100.0 250 0 0 1337 1586 446 197 0.0 462
aORI10010192 100.0 189 0 0 615 803 984 796 0.0 350
aORI10010192 100.0 183 0 0 1108 1290 627 445 0.0 339
aORI10010192 100.0 169 0 0 907 1075 796 628 0.0 313
aORI10010192 92.188 64 4 1 189 251 1172 1109 4.43e-19 90
aORI10010192 92.188 64 4 1 231 294 1214 1152 4.43e-19 90
aORI10010287 77.792 779 155 18 538 1307 421 1190 0.0 464
aORI10010287 90.323 93 7 2 313 403 157 249 1.57e-28 121
aORI10010379 74.313 837 181 29 575 1394 542 1361 0.0 324
aORI10010378 74.313 837 181 29 575 1394 510 1329 0.0 324
aORI10010017 75.516 678 141 23 729 1394 1219 555 0.0 309
aORI10010280 73.745 697 140 25 729 1394 864 1548 0.0 233
aORI10010286 73.353 683 148 32 729 1394 727 1392 0.0 222
aORI10010279 73.496 698 140 26 729 1394 860 1544 0.0 222
aORI10010277 82.822 163 21 7 955 1113 1481 1322 4.34e-34 139
aORI10010380 84.397 141 18 4 986 1124 353 491 5.62e-33 135
aORI10010381 80.606 165 28 4 951 1113 1155 1317 1.22e-29 124
aORI10010382 81.757 148 25 2 967 1113 1194 1340 4.37e-29 122
aORI10010278 89.189 74 8 0 987 1060 512 585 3.43e-20 94