| RefSeq | NZ_CP009516.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | aORI10010287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1838 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.2791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 5017738..968 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
TCAAAAAAGAAGAGGAAAAAGGTATAGAGAATTTTACAGAAATTCAGGCACACTGCCGCAAATTTCCTAGAAGTTTTACTTTTAACAAAAGTCTATATTTTTACAAATTCTCGCATCTTACGAATCTTTTATTCATAGATGTAGATTAGCAATCTATGTAGATCGGTAATTTCTACAGTTCTATTAATACTGTCTTGTTATCAGACATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAATTATTGAGGGATTACCGTTAAATTCCTTTCTTTAACTTTCAATTAGTTTATTAAAAAATTCTTCAGATCTAAATTAATACTTAAAATTGTTTGAGAAATGACTGCTAGTGACCTAACTGAACTATGACTTCGAAATCTATTATTTAGGACAAATATTTGAAAGGATAATAACTTAAAAAAATTTGAAATACAAATACTTAATAAATATATATTCTGAACAAAAATAACTAAGTTAATACAGAAACATAAACAATTTTTTGATTATTAATACTTCTTATATATGTTTAGTTTTAGGTTTAATGTGTATTTTCCGTCAAACTATCTTTATTTTTTCAGTAATTTCTTGCTTTCAGTATTTTGATTTACAACAAAATTGTTTTTATTTTTAACACAACCACTTTCGTTTGAATATAAGCATTTATCTTCTTGACATTATTATTTCATAATAACTATATTTAATTATTCAATGAAAATAAAAGGGTTAAAAAACTTTCTATTTTCTTCCATGCGAAAAAGGGGATTTAAATCTGACCTTCAGGAGCTATGGAATATTTTATTTTTTATTTTATTCCAACTGAGCTTATTGGTGTTGATTTATTCGAGTCATATTTAAGTTAAATCTCGGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCACCATAACTATTAATACCCTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTACCCTAAAATCAGATGTTTATATACAAATTTAATCTAAATTTTTAGCTAAAGAATATTCCGAACATAGATTTACCCAAGGCTTAAGAGATGCCCTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTCTCCTGTCCGCCGGAAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAATAAACATGCATTTATCTATCCATCTCCCTTTGTGAATCTGTCACCTTTAACATTTAACTTATCGAGATTATAGAAAAATAATAACCCGGGTCTCTGGAATTACTGAGAACCAAAAACGAAAGACAATCTGAAAATTGACAGTTAAAGCTTTCAAAATATCTTTGTCACGTTTGGGTGTCGTTTTAAGTTTCAGGTATCCAGAACTCAGAATGAGAAGAACTTAAAAATGAGAATAACTGCTCGAAGAACTTCAAAAAAGTGACTTAAACATTAAGAATTTAAGTAAAATTAATTATCTGATTAAGCTCTGCAGTTTTCTCCCTCATCTGGATGTATGGAATTAATTAGCTCCCTGAGCAGAAATTTCAACGTTTAAGTTCACTTCAACAAATGGGACCGAATTAAAACCCAAAAATAAGAATTAACATTGAGAAGATGTAACTGAAGAAATAAACTGAAAATAAGCTAAAAATTTAAAATAAACTAAAAACTAGAACTGAAAAACGAAACTAAATGATTAAATTAGAAAGCAAGCTAAGAGACTAAACTGAAAATTAAAACATCAAATTTGAAATTAAGGAAAGGAAAAAGACGTTCTACAACTCGTTAATCTTCTTAAATAGCTTATTAACTTTGTATATCAAATATGTATATTAATTGTTAGTTGTTCGTATAAATTACCTTAATTTGTTACATCTGTAATATTATAACTTTTATGAAGAGGGTCATTC
TCAAAAAAGAAGAGGAAAAAGGTATAGAGAATTTTACAGAAATTCAGGCACACTGCCGCAAATTTCCTAGAAGTTTTACTTTTAACAAAAGTCTATATTTTTACAAATTCTCGCATCTTACGAATCTTTTATTCATAGATGTAGATTAGCAATCTATGTAGATCGGTAATTTCTACAGTTCTATTAATACTGTCTTGTTATCAGACATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAATTATTGAGGGATTACCGTTAAATTCCTTTCTTTAACTTTCAATTAGTTTATTAAAAAATTCTTCAGATCTAAATTAATACTTAAAATTGTTTGAGAAATGACTGCTAGTGACCTAACTGAACTATGACTTCGAAATCTATTATTTAGGACAAATATTTGAAAGGATAATAACTTAAAAAAATTTGAAATACAAATACTTAATAAATATATATTCTGAACAAAAATAACTAAGTTAATACAGAAACATAAACAATTTTTTGATTATTAATACTTCTTATATATGTTTAGTTTTAGGTTTAATGTGTATTTTCCGTCAAACTATCTTTATTTTTTCAGTAATTTCTTGCTTTCAGTATTTTGATTTACAACAAAATTGTTTTTATTTTTAACACAACCACTTTCGTTTGAATATAAGCATTTATCTTCTTGACATTATTATTTCATAATAACTATATTTAATTATTCAATGAAAATAAAAGGGTTAAAAAACTTTCTATTTTCTTCCATGCGAAAAAGGGGATTTAAATCTGACCTTCAGGAGCTATGGAATATTTTATTTTTTATTTTATTCCAACTGAGCTTATTGGTGTTGATTTATTCGAGTCATATTTAAGTTAAATCTCGGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCACCATAACTATTAATACCCTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTACCCTAAAATCAGATGTTTATATACAAATTTAATCTAAATTTTTAGCTAAAGAATATTCCGAACATAGATTTACCCAAGGCTTAAGAGATGCCCTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTCTCCTGTCCGCCGGAAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAATAAACATGCATTTATCTATCCATCTCCCTTTGTGAATCTGTCACCTTTAACATTTAACTTATCGAGATTATAGAAAAATAATAACCCGGGTCTCTGGAATTACTGAGAACCAAAAACGAAAGACAATCTGAAAATTGACAGTTAAAGCTTTCAAAATATCTTTGTCACGTTTGGGTGTCGTTTTAAGTTTCAGGTATCCAGAACTCAGAATGAGAAGAACTTAAAAATGAGAATAACTGCTCGAAGAACTTCAAAAAAGTGACTTAAACATTAAGAATTTAAGTAAAATTAATTATCTGATTAAGCTCTGCAGTTTTCTCCCTCATCTGGATGTATGGAATTAATTAGCTCCCTGAGCAGAAATTTCAACGTTTAAGTTCACTTCAACAAATGGGACCGAATTAAAACCCAAAAATAAGAATTAACATTGAGAAGATGTAACTGAAGAAATAAACTGAAAATAAGCTAAAAATTTAAAATAAACTAAAAACTAGAACTGAAAAACGAAACTAAATGATTAAATTAGAAAGCAAGCTAAGAGACTAAACTGAAAATTAAAACATCAAATTTGAAATTAAGGAAAGGAAAAAGACGTTCTACAACTCGTTAATCTTCTTAAATAGCTTATTAACTTTGTATATCAAATATGTATATTAATTGTTAGTTGTTCGTATAAATTACCTTAATTTGTTACATCTGTAATATTATAACTTTTATGAAGAGGGTCATTC
TCAAAAAAGAAGAGGAAAAAGGTATAGAGAATTTTACAGAAATTCAGGCACACTGCCGCAAATTTCCTAGAAGTTTTACTTTTAACAAAAGTCTATATTTTTACAAATTCTCGCATCTTACGAATCTTTTATTCATAGATGTAGATTAGCAATCTATGTAGATCGGTAATTTCTACAGTTCTATTAATACTGTCTTGTTATCAGACATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAATTATTGAGGGATTACCGTTAAATTCCTTTCTTTAACTTTCAATTAGTTTATTAAAAAATTCTTCAGATCTAAATTAATACTTAAAATTGTTTGAGAAATGACTGCTAGTGACCTAACTGAACTATGACTTCGAAATCTATTATTTAGGACAAATATTTGAAAGGATAATAACTTAAAAAAATTTGAAATACAAATACTTAATAAATATATATTCTGAACAAAAATAACTAAGTTAATACAGAAACATAAACAATTTTTTGATTATTAATACTTCTTATATATGTTTAGTTTTAGGTTTAATGTGTATTTTCCGTCAAACTATCTTTATTTTTTCAGTAATTTCTTGCTTTCAGTATTTTGATTTACAACAAAATTGTTTTTATTTTTAACACAACCACTTTCGTTTGAATATAAGCATTTATCTTCTTGACATTATTATTTCATAATAACTATATTTAATTATTCAATGAAAATAAAAGGGTTAAAAAACTTTCTATTTTCTTCCATGCGAAAAAGGGGATTTAAATCTGACCTTCAGGAGCTATGGAATATTTTATTTTTTATTTTATTCCAACTGAGCTTATTGGTGTTGATTTATTCGAGTCATATTTAAGTTAAATCTCGGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCACCATAACTATTAATACCCTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTACCCTAAAATCAGATGTTTATATACAAATTTAATCTAAATTTTTAGCTAAAGAATATTCCGAACATAGATTTACCCAAGGCTTAAGAGATGCCCTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTCTCCTGTCCGCCGGAAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAATAAACATGCATTTATCTATCCATCTCCCTTTGTGAATCTGTCACCTTTAACATTTAACTTATCGAGATTATAGAAAAATAATAACCCGGGTCTCTGGAATTACTGAGAACCAAAAACGAAAGACAATCTGAAAATTGACAGTTAAAGCTTTCAAAATATCTTTGTCACGTTTGGGTGTCGTTTTAAGTTTCAGGTATCCAGAACTCAGAATGAGAAGAACTTAAAAATGAGAATAACTGCTCGAAGAACTTCAAAAAAGTGACTTAAACATTAAGAATTTAAGTAAAATTAATTATCTGATTAAGCTCTGCAGTTTTCTCCCTCATCTGGATGTATGGAATTAATTAGCTCCCTGAGCAGAAATTTCAACGTTTAAGTTCACTTCAACAAATGGGACCGAATTAAAACCCAAAAATAAGAATTAACATTGAGAAGATGTAACTGAAGAAATAAACTGAAAATAAGCTAAAAATTTAAAATAAACTAAAAACTAGAACTGAAAAACGAAACTAAATGATTAAATTAGAAAGCAAGCTAAGAGACTAAACTGAAAATTAAAACATCAAATTTGAAATTAAGGAAAGGAAAAAGACGTTCTACAACTCGTTAATCTTCTTAAATAGCTTATTAACTTTGTATATCAAATATGTATATTAATTGTTAGTTGTTCGTATAAATTACCTTAATTTGTTACATCTGTAATATTATAACTTTTATGAAGAGGGTCATTC
ORB
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif TCNGGWYCTMTGGAA
Motif RAGAAGAWCTDAAAAAHGAAANTAAMTG
Motif GVGTGTC
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|