RefSeq | NZ_CP009516.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1838 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.2791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 5017738..968 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TCAAAAAAGAAGAGGAAAAAGGTATAGAGAATTTTACAGAAATTCAGGCACACTGCCGCAAATTTCCTAGAAGTTTTACTTTTAACAAAAGTCTATATTTTTACAAATTCTCGCATCTTACGAATCTTTTATTCATAGATGTAGATTAGCAATCTATGTAGATCGGTAATTTCTACAGTTCTATTAATACTGTCTTGTTATCAGACATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAATTATTGAGGGATTACCGTTAAATTCCTTTCTTTAACTTTCAATTAGTTTATTAAAAAATTCTTCAGATCTAAATTAATACTTAAAATTGTTTGAGAAATGACTGCTAGTGACCTAACTGAACTATGACTTCGAAATCTATTATTTAGGACAAATATTTGAAAGGATAATAACTTAAAAAAATTTGAAATACAAATACTTAATAAATATATATTCTGAACAAAAATAACTAAGTTAATACAGAAACATAAACAATTTTTTGATTATTAATACTTCTTATATATGTTTAGTTTTAGGTTTAATGTGTATTTTCCGTCAAACTATCTTTATTTTTTCAGTAATTTCTTGCTTTCAGTATTTTGATTTACAACAAAATTGTTTTTATTTTTAACACAACCACTTTCGTTTGAATATAAGCATTTATCTTCTTGACATTATTATTTCATAATAACTATATTTAATTATTCAATGAAAATAAAAGGGTTAAAAAACTTTCTATTTTCTTCCATGCGAAAAAGGGGATTTAAATCTGACCTTCAGGAGCTATGGAATATTTTATTTTTTATTTTATTCCAACTGAGCTTATTGGTGTTGATTTATTCGAGTCATATTTAAGTTAAATCTCGGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCACCATAACTATTAATACCCTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTACCCTAAAATCAGATGTTTATATACAAATTTAATCTAAATTTTTAGCTAAAGAATATTCCGAACATAGATTTACCCAAGGCTTAAGAGATGCCCTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTCTCCTGTCCGCCGGAAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAATAAACATGCATTTATCTATCCATCTCCCTTTGTGAATCTGTCACCTTTAACATTTAACTTATCGAGATTATAGAAAAATAATAACCCGGGTCTCTGGAATTACTGAGAACCAAAAACGAAAGACAATCTGAAAATTGACAGTTAAAGCTTTCAAAATATCTTTGTCACGTTTGGGTGTCGTTTTAAGTTTCAGGTATCCAGAACTCAGAATGAGAAGAACTTAAAAATGAGAATAACTGCTCGAAGAACTTCAAAAAAGTGACTTAAACATTAAGAATTTAAGTAAAATTAATTATCTGATTAAGCTCTGCAGTTTTCTCCCTCATCTGGATGTATGGAATTAATTAGCTCCCTGAGCAGAAATTTCAACGTTTAAGTTCACTTCAACAAATGGGACCGAATTAAAACCCAAAAATAAGAATTAACATTGAGAAGATGTAACTGAAGAAATAAACTGAAAATAAGCTAAAAATTTAAAATAAACTAAAAACTAGAACTGAAAAACGAAACTAAATGATTAAATTAGAAAGCAAGCTAAGAGACTAAACTGAAAATTAAAACATCAAATTTGAAATTAAGGAAAGGAAAAAGACGTTCTACAACTCGTTAATCTTCTTAAATAGCTTATTAACTTTGTATATCAAATATGTATATTAATTGTTAGTTGTTCGTATAAATTACCTTAATTTGTTACATCTGTAATATTATAACTTTTATGAAGAGGGTCATTC
TCAAAAAAGAAGAGGAAAAAGGTATAGAGAATTTTACAGAAATTCAGGCACACTGCCGCAAATTTCCTAGAAGTTTTACTTTTAACAAAAGTCTATATTTTTACAAATTCTCGCATCTTACGAATCTTTTATTCATAGATGTAGATTAGCAATCTATGTAGATCGGTAATTTCTACAGTTCTATTAATACTGTCTTGTTATCAGACATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAATTATTGAGGGATTACCGTTAAATTCCTTTCTTTAACTTTCAATTAGTTTATTAAAAAATTCTTCAGATCTAAATTAATACTTAAAATTGTTTGAGAAATGACTGCTAGTGACCTAACTGAACTATGACTTCGAAATCTATTATTTAGGACAAATATTTGAAAGGATAATAACTTAAAAAAATTTGAAATACAAATACTTAATAAATATATATTCTGAACAAAAATAACTAAGTTAATACAGAAACATAAACAATTTTTTGATTATTAATACTTCTTATATATGTTTAGTTTTAGGTTTAATGTGTATTTTCCGTCAAACTATCTTTATTTTTTCAGTAATTTCTTGCTTTCAGTATTTTGATTTACAACAAAATTGTTTTTATTTTTAACACAACCACTTTCGTTTGAATATAAGCATTTATCTTCTTGACATTATTATTTCATAATAACTATATTTAATTATTCAATGAAAATAAAAGGGTTAAAAAACTTTCTATTTTCTTCCATGCGAAAAAGGGGATTTAAATCTGACCTTCAGGAGCTATGGAATATTTTATTTTTTATTTTATTCCAACTGAGCTTATTGGTGTTGATTTATTCGAGTCATATTTAAGTTAAATCTCGGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCACCATAACTATTAATACCCTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTACCCTAAAATCAGATGTTTATATACAAATTTAATCTAAATTTTTAGCTAAAGAATATTCCGAACATAGATTTACCCAAGGCTTAAGAGATGCCCTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTCTCCTGTCCGCCGGAAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAATAAACATGCATTTATCTATCCATCTCCCTTTGTGAATCTGTCACCTTTAACATTTAACTTATCGAGATTATAGAAAAATAATAACCCGGGTCTCTGGAATTACTGAGAACCAAAAACGAAAGACAATCTGAAAATTGACAGTTAAAGCTTTCAAAATATCTTTGTCACGTTTGGGTGTCGTTTTAAGTTTCAGGTATCCAGAACTCAGAATGAGAAGAACTTAAAAATGAGAATAACTGCTCGAAGAACTTCAAAAAAGTGACTTAAACATTAAGAATTTAAGTAAAATTAATTATCTGATTAAGCTCTGCAGTTTTCTCCCTCATCTGGATGTATGGAATTAATTAGCTCCCTGAGCAGAAATTTCAACGTTTAAGTTCACTTCAACAAATGGGACCGAATTAAAACCCAAAAATAAGAATTAACATTGAGAAGATGTAACTGAAGAAATAAACTGAAAATAAGCTAAAAATTTAAAATAAACTAAAAACTAGAACTGAAAAACGAAACTAAATGATTAAATTAGAAAGCAAGCTAAGAGACTAAACTGAAAATTAAAACATCAAATTTGAAATTAAGGAAAGGAAAAAGACGTTCTACAACTCGTTAATCTTCTTAAATAGCTTATTAACTTTGTATATCAAATATGTATATTAATTGTTAGTTGTTCGTATAAATTACCTTAATTTGTTACATCTGTAATATTATAACTTTTATGAAGAGGGTCATTC
TCAAAAAAGAAGAGGAAAAAGGTATAGAGAATTTTACAGAAATTCAGGCACACTGCCGCAAATTTCCTAGAAGTTTTACTTTTAACAAAAGTCTATATTTTTACAAATTCTCGCATCTTACGAATCTTTTATTCATAGATGTAGATTAGCAATCTATGTAGATCGGTAATTTCTACAGTTCTATTAATACTGTCTTGTTATCAGACATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAATTATTGAGGGATTACCGTTAAATTCCTTTCTTTAACTTTCAATTAGTTTATTAAAAAATTCTTCAGATCTAAATTAATACTTAAAATTGTTTGAGAAATGACTGCTAGTGACCTAACTGAACTATGACTTCGAAATCTATTATTTAGGACAAATATTTGAAAGGATAATAACTTAAAAAAATTTGAAATACAAATACTTAATAAATATATATTCTGAACAAAAATAACTAAGTTAATACAGAAACATAAACAATTTTTTGATTATTAATACTTCTTATATATGTTTAGTTTTAGGTTTAATGTGTATTTTCCGTCAAACTATCTTTATTTTTTCAGTAATTTCTTGCTTTCAGTATTTTGATTTACAACAAAATTGTTTTTATTTTTAACACAACCACTTTCGTTTGAATATAAGCATTTATCTTCTTGACATTATTATTTCATAATAACTATATTTAATTATTCAATGAAAATAAAAGGGTTAAAAAACTTTCTATTTTCTTCCATGCGAAAAAGGGGATTTAAATCTGACCTTCAGGAGCTATGGAATATTTTATTTTTTATTTTATTCCAACTGAGCTTATTGGTGTTGATTTATTCGAGTCATATTTAAGTTAAATCTCGGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCACCATAACTATTAATACCCTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTACCCTAAAATCAGATGTTTATATACAAATTTAATCTAAATTTTTAGCTAAAGAATATTCCGAACATAGATTTACCCAAGGCTTAAGAGATGCCCTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTCTCCTGTCCGCCGGAAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAATAAACATGCATTTATCTATCCATCTCCCTTTGTGAATCTGTCACCTTTAACATTTAACTTATCGAGATTATAGAAAAATAATAACCCGGGTCTCTGGAATTACTGAGAACCAAAAACGAAAGACAATCTGAAAATTGACAGTTAAAGCTTTCAAAATATCTTTGTCACGTTTGGGTGTCGTTTTAAGTTTCAGGTATCCAGAACTCAGAATGAGAAGAACTTAAAAATGAGAATAACTGCTCGAAGAACTTCAAAAAAGTGACTTAAACATTAAGAATTTAAGTAAAATTAATTATCTGATTAAGCTCTGCAGTTTTCTCCCTCATCTGGATGTATGGAATTAATTAGCTCCCTGAGCAGAAATTTCAACGTTTAAGTTCACTTCAACAAATGGGACCGAATTAAAACCCAAAAATAAGAATTAACATTGAGAAGATGTAACTGAAGAAATAAACTGAAAATAAGCTAAAAATTTAAAATAAACTAAAAACTAGAACTGAAAAACGAAACTAAATGATTAAATTAGAAAGCAAGCTAAGAGACTAAACTGAAAATTAAAACATCAAATTTGAAATTAAGGAAAGGAAAAAGACGTTCTACAACTCGTTAATCTTCTTAAATAGCTTATTAACTTTGTATATCAAATATGTATATTAATTGTTAGTTGTTCGTATAAATTACCTTAATTTGTTACATCTGTAATATTATAACTTTTATGAAGAGGGTCATTC
ORB
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif TCNGGWYCTMTGGAA
Motif RAGAAGAWCTDAAAAAHGAAANTAAMTG
Motif GVGTGTC
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|