RefSeq NZ_CP009516.1
DoriC accession number aORI10010287
OriC length 1838 nt
OriC AT content 0.2791
The location of oriC region 5017738..968 nt
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OriC map
OriC sequences
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TCAAAAAAGAAGAGGAAAAAGGTATAGAGAATTTTACAGAAATTCAGGCACACTGCCGCAAATTTCCTAGAAGTTTTACTTTTAACAAAAGTCTATATTTTTACAAATTCTCGCATCTTACGAATCTTTTATTCATAGATGTAGATTAGCAATCTATGTAGATCGGTAATTTCTACAGTTCTATTAATACTGTCTTGTTATCAGACATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAATTATTGAGGGATTACCGTTAAATTCCTTTCTTTAACTTTCAATTAGTTTATTAAAAAATTCTTCAGATCTAAATTAATACTTAAAATTGTTTGAGAAATGACTGCTAGTGACCTAACTGAACTATGACTTCGAAATCTATTATTTAGGACAAATATTTGAAAGGATAATAACTTAAAAAAATTTGAAATACAAATACTTAATAAATATATATTCTGAACAAAAATAACTAAGTTAATACAGAAACATAAACAATTTTTTGATTATTAATACTTCTTATATATGTTTAGTTTTAGGTTTAATGTGTATTTTCCGTCAAACTATCTTTATTTTTTCAGTAATTTCTTGCTTTCAGTATTTTGATTTACAACAAAATTGTTTTTATTTTTAACACAACCACTTTCGTTTGAATATAAGCATTTATCTTCTTGACATTATTATTTCATAATAACTATATTTAATTATTCAATGAAAATAAAAGGGTTAAAAAACTTTCTATTTTCTTCCATGCGAAAAAGGGGATTTAAATCTGACCTTCAGGAGCTATGGAATATTTTATTTTTTATTTTATTCCAACTGAGCTTATTGGTGTTGATTTATTCGAGTCATATTTAAGTTAAATCTCGGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCACCATAACTATTAATACCCTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTACCCTAAAATCAGATGTTTATATACAAATTTAATCTAAATTTTTAGCTAAAGAATATTCCGAACATAGATTTACCCAAGGCTTAAGAGATGCCCTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTCTCCTGTCCGCCGGAAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAATAAACATGCATTTATCTATCCATCTCCCTTTGTGAATCTGTCACCTTTAACATTTAACTTATCGAGATTATAGAAAAATAATAACCCGGGTCTCTGGAATTACTGAGAACCAAAAACGAAAGACAATCTGAAAATTGACAGTTAAAGCTTTCAAAATATCTTTGTCACGTTTGGGTGTCGTTTTAAGTTTCAGGTATCCAGAACTCAGAATGAGAAGAACTTAAAAATGAGAATAACTGCTCGAAGAACTTCAAAAAAGTGACTTAAACATTAAGAATTTAAGTAAAATTAATTATCTGATTAAGCTCTGCAGTTTTCTCCCTCATCTGGATGTATGGAATTAATTAGCTCCCTGAGCAGAAATTTCAACGTTTAAGTTCACTTCAACAAATGGGACCGAATTAAAACCCAAAAATAAGAATTAACATTGAGAAGATGTAACTGAAGAAATAAACTGAAAATAAGCTAAAAATTTAAAATAAACTAAAAACTAGAACTGAAAAACGAAACTAAATGATTAAATTAGAAAGCAAGCTAAGAGACTAAACTGAAAATTAAAACATCAAATTTGAAATTAAGGAAAGGAAAAAGACGTTCTACAACTCGTTAATCTTCTTAAATAGCTTATTAACTTTGTATATCAAATATGTATATTAATTGTTAGTTGTTCGTATAAATTACCTTAATTTGTTACATCTGTAATATTATAACTTTTATGAAGAGGGTCATTC

ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif TCNGGWYCTMTGGAA

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Motif RAGAAGAWCTDAAAAAHGAAANTAAMTG

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Motif GVGTGTC

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10601.65e-05TGACTTTTCAGCGTGTCTCCTGTCCGC
18282.26e-05CTTTTATGAAGAGGGTCATTC

The result of BLAST Download

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aORI10010281 77.792 779 155 18 421 1190 538 1307 0.0 464
aORI10010281 90.323 93 7 2 157 249 313 403 1.83e-28 121
aORI10010283 77.792 779 154 19 421 1190 538 1306 0.0 462
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