| RefSeq | NZ_CP009512.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | aORI10010283 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1585 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.265 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 4141851..619 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
GATTTAACTCCATTTTTTAGCAAAAGCCTATTTTTTAATCAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTATGAATTGCGTTTCATAAATTGCGTTTTATGAGTCACATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTTTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATGTATTGCATCTTCATGCACATTTATACTATAGCTGTAGATCAGTATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAGTTATTTTAAGATTATTATTCAATTCATTCTTTTGAATAATTTCTCTGATGAAATATAACATTAAAGACTACAGTAAAAATTACTGAATTATTAACTTCAAATTACTGAGTTAATAACTTCAAAAATCTATTTTTAGAATAAATATTTGGAAAATAAATACTTGAAAATAGAGTGTCTTAAATAAAAATTAATAAGTTAATACGTATACATATAAATTTTTTTGATTATTTATACTTTTTATATATGTTTAGTTTCAGGTTATATTGCTTTTTTCTTCCTAACTGTTTTTTATTTATTATTAATTTTTTTCTTTTCTTAATTGTTATTCGTATCAAGACTGTTTTCATTTTTAATACAACCACTTTCGTTTCGATTCAGGAACCTGTTTACTTCAATTATTATTTATTTATAAATATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACCCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTGACTTCAAAAATTACAAAATTTTTGATTTTTTATTTTATTTTCACATGCTCTATTGATATTGATTTTTTGTATAATATTTAAGGCAAATAACTGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTGAACTGAAATTGGATGCTTATATACAAATTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAGAATGTTCCGAATACACATTCAATCAGGGATTAAGAGATACTTTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTTATTAGTATCCCTTGAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTGTCTATCCATTCTTCCCCTGTGAATCTATTATTATTTATGTTCACTTATTAAGGTTATACAAAAATAATATTTTGGGATTTCAGAATTTCCAGAAACTGAGAATAAAAAACACTTTAAAAAATAGCAGTTAAACCTTCCCAAATATCTTTGCTATGTAGAGTTTAACTATGCAGTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAAACATTCTTTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCTGCATATTATGTCAGCTATATGTTAGGCTATCCTAACCCGTTAAATCCAGATATTATAACAAATCCATGATATTATAACTTTTATTAAGAGGGTCATT
GATTTAACTCCATTTTTTAGCAAAAGCCTATTTTTTAATCAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTATGAATTGCGTTTCATAAATTGCGTTTTATGAGTCACATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTTTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATGTATTGCATCTTCATGCACATTTATACTATAGCTGTAGATCAGTATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAGTTATTTTAAGATTATTATTCAATTCATTCTTTTGAATAATTTCTCTGATGAAATATAACATTAAAGACTACAGTAAAAATTACTGAATTATTAACTTCAAATTACTGAGTTAATAACTTCAAAAATCTATTTTTAGAATAAATATTTGGAAAATAAATACTTGAAAATAGAGTGTCTTAAATAAAAATTAATAAGTTAATACGTATACATATAAATTTTTTTGATTATTTATACTTTTTATATATGTTTAGTTTCAGGTTATATTGCTTTTTTCTTCCTAACTGTTTTTTATTTATTATTAATTTTTTTCTTTTCTTAATTGTTATTCGTATCAAGACTGTTTTCATTTTTAATACAACCACTTTCGTTTCGATTCAGGAACCTGTTTACTTCAATTATTATTTATTTATAAATATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACCCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTGACTTCAAAAATTACAAAATTTTTGATTTTTTATTTTATTTTCACATGCTCTATTGATATTGATTTTTTGTATAATATTTAAGGCAAATAACTGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTGAACTGAAATTGGATGCTTATATACAAATTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAGAATGTTCCGAATACACATTCAATCAGGGATTAAGAGATACTTTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTTATTAGTATCCCTTGAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTGTCTATCCATTCTTCCCCTGTGAATCTATTATTATTTATGTTCACTTATTAAGGTTATACAAAAATAATATTTTGGGATTTCAGAATTTCCAGAAACTGAGAATAAAAAACACTTTAAAAAATAGCAGTTAAACCTTCCCAAATATCTTTGCTATGTAGAGTTTAACTATGCAGTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAAACATTCTTTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCTGCATATTATGTCAGCTATATGTTAGGCTATCCTAACCCGTTAAATCCAGATATTATAACAAATCCATGATATTATAACTTTTATTAAGAGGGTCATT
GATTTAACTCCATTTTTTAGCAAAAGCCTATTTTTTAATCAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTATGAATTGCGTTTCATAAATTGCGTTTTATGAGTCACATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTTTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATGTATTGCATCTTCATGCACATTTATACTATAGCTGTAGATCAGTATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAGTTATTTTAAGATTATTATTCAATTCATTCTTTTGAATAATTTCTCTGATGAAATATAACATTAAAGACTACAGTAAAAATTACTGAATTATTAACTTCAAATTACTGAGTTAATAACTTCAAAAATCTATTTTTAGAATAAATATTTGGAAAATAAATACTTGAAAATAGAGTGTCTTAAATAAAAATTAATAAGTTAATACGTATACATATAAATTTTTTTGATTATTTATACTTTTTATATATGTTTAGTTTCAGGTTATATTGCTTTTTTCTTCCTAACTGTTTTTTATTTATTATTAATTTTTTTCTTTTCTTAATTGTTATTCGTATCAAGACTGTTTTCATTTTTAATACAACCACTTTCGTTTCGATTCAGGAACCTGTTTACTTCAATTATTATTTATTTATAAATATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACCCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTGACTTCAAAAATTACAAAATTTTTGATTTTTTATTTTATTTTCACATGCTCTATTGATATTGATTTTTTGTATAATATTTAAGGCAAATAACTGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTGAACTGAAATTGGATGCTTATATACAAATTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAGAATGTTCCGAATACACATTCAATCAGGGATTAAGAGATACTTTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTTATTAGTATCCCTTGAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTGTCTATCCATTCTTCCCCTGTGAATCTATTATTATTTATGTTCACTTATTAAGGTTATACAAAAATAATATTTTGGGATTTCAGAATTTCCAGAAACTGAGAATAAAAAACACTTTAAAAAATAGCAGTTAAACCTTCCCAAATATCTTTGCTATGTAGAGTTTAACTATGCAGTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAAACATTCTTTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCTGCATATTATGTCAGCTATATGTTAGGCTATCCTAACCCGTTAAATCCAGATATTATAACAAATCCATGATATTATAACTTTTATTAAGAGGGTCATT
ORB
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif TATCGCTTCTC
Motif TTTWATTAAACTSGTTTTYAAYCAARCAT
Motif TSHTYCAVTSGAAAHAAAGGRKT
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|