| RefSeq | NZ_CP009530.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | aORI10010291 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 2269 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.2512 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 4446970..1258 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATATACCTGCCAAATTACCAAGTAATTTTCATAACAACAGGGAGAGTAAGTATCCAAGATCTAAAAAAGGAATGTATGTTAAAATCTCATAATCATATTAATGTCTGTAATATCTGCTTTAGAGGGAGACACCTATATTTCGAGTGGAGACGTTTTCATAGATCTAGAAGACGCAAATTTCTCAGAACATATAGCTTAGATTTAGTTTAGATTTATAAATTTTTTGAAAATGAATACTTTTTCTGATAGATTGGTTATCAATAAAAAGAATATATTTAATGAATATATAAAATTAAATTTTTTTATATTAAGAAGAACTGTTCTAAAAACAAACTAACCTTTTTAATAATAAAATATATATAGTATTAATTCTATAACAAAACAACATTATTTTACTGATAAACAAAATAAAACTCTATTTTATTTTGCTGCCTAGAATCTCTAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGTGTTATATAAATGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCTCTCTGTTTTTACTTTTCTCTCTCTGTTTTTTTCTTCCCTAACTTTCTTTAATTTCCTTTCTTTATTTTTCACCTTCTCACTTTTTTCCTTTCCTTGATTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAATACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATATACCTGCCAAATTACCAAGTAATTTTCATAACAACAGGGAGAGTAAGTATCCAAGATCTAAAAAAGGAATGTATGTTAAAATCTCATAATCATATTAATGTCTGTAATATCTGCTTTAGAGGGAGACACCTATATTTCGAGTGGAGACGTTTTCATAGATCTAGAAGACGCAAATTTCTCAGAACATATAGCTTAGATTTAGTTTAGATTTATAAATTTTTTGAAAATGAATACTTTTTCTGATAGATTGGTTATCAATAAAAAGAATATATTTAATGAATATATAAAATTAAATTTTTTTATATTAAGAAGAACTGTTCTAAAAACAAACTAACCTTTTTAATAATAAAATATATATAGTATTAATTCTATAACAAAACAACATTATTTTACTGATAAACAAAATAAAACTCTATTTTATTTTGCTGCCTAGAATCTCTAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGTGTTATATAAATGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCTCTCTGTTTTTACTTTTCTCTCTCTGTTTTTTTCTTCCCTAACTTTCTTTAATTTCCTTTCTTTATTTTTCACCTTCTCACTTTTTTCCTTTCCTTGATTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAATACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATATACCTGCCAAATTACCAAGTAATTTTCATAACAACAGGGAGAGTAAGTATCCAAGATCTAAAAAAGGAATGTATGTTAAAATCTCATAATCATATTAATGTCTGTAATATCTGCTTTAGAGGGAGACACCTATATTTCGAGTGGAGACGTTTTCATAGATCTAGAAGACGCAAATTTCTCAGAACATATAGCTTAGATTTAGTTTAGATTTATAAATTTTTTGAAAATGAATACTTTTTCTGATAGATTGGTTATCAATAAAAAGAATATATTTAATGAATATATAAAATTAAATTTTTTTATATTAAGAAGAACTGTTCTAAAAACAAACTAACCTTTTTAATAATAAAATATATATAGTATTAATTCTATAACAAAACAACATTATTTTACTGATAAACAAAATAAAACTCTATTTTATTTTGCTGCCTAGAATCTCTAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGTGTTATATAAATGTTCCAGTGGAAATGCAGGGGTCTTCTCTCTGTTTTTACTTTTCTCTCTCTGTTTTTTTCTTCCCTAACTTTCTTTAATTTCCTTTCTTTATTTTTCACCTTCTCACTTTTTTCCTTTCCTTGATTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAATACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
ORB
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif ATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACAC
Motif TTYYAGTGGAAATWWAGGGKTY
Motif YYTTWMYTTYTTTAMTTTCCTWKCTTTTT
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|