| RefSeq | NC_003901.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | aORI10010018 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1585 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.735 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 1564657..1566241 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
AATGACCCTCTTAATAAAAGTTATAATATCATGGATTTGTTATAATATCTGGATTTAACGGGTTAGGATAGCCTAACATATAGCTGACATAATATGCAGAGTTATTAATGCAAAGTAAATAAGCCGTTTAAGAAAATACGGTCTAAAGAATGTTTTTCTCTTCTCACTTCAAATACTGCATAGTTAAACTCTACATAGCAAAGATATTTGGGAAGGTTTAACTGCTATTTTTTAAAGTGTTTTTTATTCTCAGTTTCTGGAAATTCTGAAATCCCAAAATATTATTTTTGTATAACCTTAATAAGTGAACATAAATAATAATAGATTCACAGGGGAAGAATGGATAGACAAATGCATGTTTCTTAAAGTTAATGCCTGAAATTTTTATTCAAGGGATACTAATAACACGCTGAAAAGTCAGTTGCGCACTTTAAAGTATCTCTTAATCCCTGATTGAATGTGTATTCGGAACATTCTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAATTTGTATATAAGCATCCAATTTCAGTTCACATTTGCAGTAGATGCAATGGAAGTACACGGTATTAATAGTTATGGTAAAGACCCCTTTGTTTCCACTGGAACAGTTATTTGCCTTAAATATTATACAAAAAATCAATATCAATAGAGCATGTGAAAATAAAATAAAAAATCAAAAATTTTGTAATTTTTGAAGTCAAGATTTAAATCCTCTTTTTCGCGTGGAGGAAGATAAAGGGTTTTCAAACCCCTTTATTTCCATTGAATGATAAAAAATATTTATAAATAAATAATAATTGAAGTAAACAGGTTCCTGAATCGAAACGAAAGTGGTTGTATTAAAAATGAAAACAGTCTTGATACGAATAACAATTAAGAAAAGAAAAAAATTAATAATAAATAAAAAACAGTTAGGAAGAAAAAAGCAATATAACCTGAAACTAAACATATATAAAAAGTATAAATAATCAAAAAAATTTATATGTATACGTATTAACTTATTAATTTTTATTTAAGACACTCTATTTTCAAGTATTTATTTTCCAAATATTTATTCTAAAAATAGATTTTTGAAGTTATTAACTCAGTAATTTGAAGTTAATAATTCAGTAATTTTTACTGTAGTCTTTAATGTTATATTTCATCAGAGAAATTATTCAAAAGAATGAATTGAATAATAATCTTAAAATAACTTATTTAATTTCCGAAGTAAAACGAACTGCTTTTAATCCCTGATGACAAGACAGTATTATAAAACTGTAGAGATACTGATCTACAGCTATAGTATAAATGTGCATGAAGATGCAATACATGAGAAGCGATACACGAGAAGCGATAAATGAAAAGCGATAAATGAGAAGCGATACACGAGAAGCGATAAATGAGAAGCGATAAATGAGAATGTGACTCATAAAACGCAATTTATGAAACGCAATTCATAAGACATAATGTTTGATTGAAAACGAGTTTAATTAAAAATATGTTTGATTGAAAACGAGTTTAATTAAAAATATGTTTGGTTAAGAACGAGTTTAATTAAAAACGAAATTGATTAAAAAATAGGCTTTTGCTAAAAAATGGAGTTAAATC
AATGACCCTCTTAATAAAAGTTATAATATCATGGATTTGTTATAATATCTGGATTTAACGGGTTAGGATAGCCTAACATATAGCTGACATAATATGCAGAGTTATTAATGCAAAGTAAATAAGCCGTTTAAGAAAATACGGTCTAAAGAATGTTTTTCTCTTCTCACTTCAAATACTGCATAGTTAAACTCTACATAGCAAAGATATTTGGGAAGGTTTAACTGCTATTTTTTAAAGTGTTTTTTATTCTCAGTTTCTGGAAATTCTGAAATCCCAAAATATTATTTTTGTATAACCTTAATAAGTGAACATAAATAATAATAGATTCACAGGGGAAGAATGGATAGACAAATGCATGTTTCTTAAAGTTAATGCCTGAAATTTTTATTCAAGGGATACTAATAACACGCTGAAAAGTCAGTTGCGCACTTTAAAGTATCTCTTAATCCCTGATTGAATGTGTATTCGGAACATTCTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAATTTGTATATAAGCATCCAATTTCAGTTCACATTTGCAGTAGATGCAATGGAAGTACACGGTATTAATAGTTATGGTAAAGACCCCTTTGTTTCCACTGGAACAGTTATTTGCCTTAAATATTATACAAAAAATCAATATCAATAGAGCATGTGAAAATAAAATAAAAAATCAAAAATTTTGTAATTTTTGAAGTCAAGATTTAAATCCTCTTTTTCGCGTGGAGGAAGATAAAGGGTTTTCAAACCCCTTTATTTCCATTGAATGATAAAAAATATTTATAAATAAATAATAATTGAAGTAAACAGGTTCCTGAATCGAAACGAAAGTGGTTGTATTAAAAATGAAAACAGTCTTGATACGAATAACAATTAAGAAAAGAAAAAAATTAATAATAAATAAAAAACAGTTAGGAAGAAAAAAGCAATATAACCTGAAACTAAACATATATAAAAAGTATAAATAATCAAAAAAATTTATATGTATACGTATTAACTTATTAATTTTTATTTAAGACACTCTATTTTCAAGTATTTATTTTCCAAATATTTATTCTAAAAATAGATTTTTGAAGTTATTAACTCAGTAATTTGAAGTTAATAATTCAGTAATTTTTACTGTAGTCTTTAATGTTATATTTCATCAGAGAAATTATTCAAAAGAATGAATTGAATAATAATCTTAAAATAACTTATTTAATTTCCGAAGTAAAACGAACTGCTTTTAATCCCTGATGACAAGACAGTATTATAAAACTGTAGAGATACTGATCTACAGCTATAGTATAAATGTGCATGAAGATGCAATACATGAGAAGCGATACACGAGAAGCGATAAATGAAAAGCGATAAATGAGAAGCGATACACGAGAAGCGATAAATGAGAAGCGATAAATGAGAATGTGACTCATAAAACGCAATTTATGAAACGCAATTCATAAGACATAATGTTTGATTGAAAACGAGTTTAATTAAAAATATGTTTGATTGAAAACGAGTTTAATTAAAAATATGTTTGGTTAAGAACGAGTTTAATTAAAAACGAAATTGATTAAAAAATAGGCTTTTGCTAAAAAATGGAGTTAAATC
AATGACCCTCTTAATAAAAGTTATAATATCATGGATTTGTTATAATATCTGGATTTAACGGGTTAGGATAGCCTAACATATAGCTGACATAATATGCAGAGTTATTAATGCAAAGTAAATAAGCCGTTTAAGAAAATACGGTCTAAAGAATGTTTTTCTCTTCTCACTTCAAATACTGCATAGTTAAACTCTACATAGCAAAGATATTTGGGAAGGTTTAACTGCTATTTTTTAAAGTGTTTTTTATTCTCAGTTTCTGGAAATTCTGAAATCCCAAAATATTATTTTTGTATAACCTTAATAAGTGAACATAAATAATAATAGATTCACAGGGGAAGAATGGATAGACAAATGCATGTTTCTTAAAGTTAATGCCTGAAATTTTTATTCAAGGGATACTAATAACACGCTGAAAAGTCAGTTGCGCACTTTAAAGTATCTCTTAATCCCTGATTGAATGTGTATTCGGAACATTCTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAATTTGTATATAAGCATCCAATTTCAGTTCACATTTGCAGTAGATGCAATGGAAGTACACGGTATTAATAGTTATGGTAAAGACCCCTTTGTTTCCACTGGAACAGTTATTTGCCTTAAATATTATACAAAAAATCAATATCAATAGAGCATGTGAAAATAAAATAAAAAATCAAAAATTTTGTAATTTTTGAAGTCAAGATTTAAATCCTCTTTTTCGCGTGGAGGAAGATAAAGGGTTTTCAAACCCCTTTATTTCCATTGAATGATAAAAAATATTTATAAATAAATAATAATTGAAGTAAACAGGTTCCTGAATCGAAACGAAAGTGGTTGTATTAAAAATGAAAACAGTCTTGATACGAATAACAATTAAGAAAAGAAAAAAATTAATAATAAATAAAAAACAGTTAGGAAGAAAAAAGCAATATAACCTGAAACTAAACATATATAAAAAGTATAAATAATCAAAAAAATTTATATGTATACGTATTAACTTATTAATTTTTATTTAAGACACTCTATTTTCAAGTATTTATTTTCCAAATATTTATTCTAAAAATAGATTTTTGAAGTTATTAACTCAGTAATTTGAAGTTAATAATTCAGTAATTTTTACTGTAGTCTTTAATGTTATATTTCATCAGAGAAATTATTCAAAAGAATGAATTGAATAATAATCTTAAAATAACTTATTTAATTTCCGAAGTAAAACGAACTGCTTTTAATCCCTGATGACAAGACAGTATTATAAAACTGTAGAGATACTGATCTACAGCTATAGTATAAATGTGCATGAAGATGCAATACATGAGAAGCGATACACGAGAAGCGATAAATGAAAAGCGATAAATGAGAAGCGATACACGAGAAGCGATAAATGAGAAGCGATAAATGAGAATGTGACTCATAAAACGCAATTTATGAAACGCAATTCATAAGACATAATGTTTGATTGAAAACGAGTTTAATTAAAAATATGTTTGATTGAAAACGAGTTTAATTAAAAATATGTTTGGTTAAGAACGAGTTTAATTAAAAACGAAATTGATTAAAAAATAGGCTTTTGCTAAAAAATGGAGTTAAATC
ORB
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif GAGAAGCGATA
Motif AMYCCTTTDTTTCSABTGRADSA
Motif ATKTYTGAWTNAAAACGARTTTAATT
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|