| RefSeq | NZ_CP009526.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | aORI10010289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 2165 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.2624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 4873771..1120 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
GTGGATAAAGTAAAACCAATTTTATTTAAAATACTTATGGAATATAACTCTAAATTAGCAAGTAACTCTCCTAACGATGCATCAGAATCTCCTAATGCACATCAGAAGAGACTAACTTTCGGCAAGTGATTAAAAGTATTAGAAAGTTAAAAAAGTTCCACAAAAAAGTTATGTGAGCAGTAATAGGGTGAGGAAGTATACAAGATCTAAAAAAAGGACTGTATGTTAAGGTATCATAATTGCATTAATGTCTGCTTTAGAGGGAGACCCCTATATTTCGACTGGAGAGATTTTTATAGGTTCAGAAAATGTAAATTTCTCAGAACATGTAATTTAGATTTCTCAATTTTTTGAAAATCATACTTTTTCTGATAGATTGAGTATCAATAAAAACTCAAAATAAAAATATTCAATGAAAATATTAAATCAAATTTTTTACTATTAAGAAAAGCTTCTCTAAAAACAAACTAACTTTTTTAATAATAACATATATATAGTATTAATTCTATAACCAAACAACATTATTTTACCAATAAACAAAATAAAATTTTATTTTATTTTACTGCCTTGGATCTTGAATCTCTTTAATGGAAATCATGGGGTCTGGGGGTTATATAAACTTTCCAGTGGAAATACAGGGGTCTACTTTTTGTTTTTACTTTTCTCTTTGTGTTTTTTTCCCTAACTTCTCCATTATTCCAAACTTCTCCATTATTCCAAACTTTCTTAAATTTCCTAGCTTTTTCTGTTTTCTTTATCTTTTCTCACTTACTCAATGCAAACAATCTCAAATTTAAAAATCACTCTAAAGATTGCTCTAAAGTTGTCTCAACTTTGTAAACTTATTTGTTCACAGGGATTTTATTCACATAATTCTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTTTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTATTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTTAACCTACATTGGTTCTGGAACTCATAATTTTTTGTTTCAGCTATAATAAGCTAGAGAACATTGGTTTTTATGGCAGGTATTTAAGGTATAAATCTTTTCCAGTGGAAATACAGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATGACTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTTACCTAAAATTTTAACAAAAGAAGATCGGGAATATAGATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAATACTTAAGACTCGCCCGCAATTTTATCAGCAATTAGTAGAAAATGAGAGTTTCAGGCATTAACTATAAGAAAGATGTATCTTCTACCCCTTTCTCCTTATTAGCGGAATTTATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATTTTAGAAATCCTAAAATAAACTTTAGTTCCAGATATTGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTTCCCCTCTTTCTCTCTTTCCAAATACCCTTACATTAACCCCCATTTATAACCCTCTAAAATCCTTTGATGACTATTACAATAATGACCATTACAATAATTATTGAAACCCGCTAAAAGGTTATTATGTATTCAGTCTAAAATTTATCAAGCAGTTGTGGTTATAATTGTGCAACCATTTGAAAAGGAAAATCTAAAACATAACTCTAAAAACGTAGCTCTAAATACGTAATATTTAATAGATGTAGATTCGGAGGATTAAATTGGTTGCAGACTATTAAAATTCCTCCTGATTTCAGGTAGTAGTAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAAACATTTAAAAAACAGAGTTTATCAACTGTATTAATTTATTATATATAATTTGCATAGTAATATTACTATCAATTAGTTTGACGTGCAATGGTTCACATTATATTAATTATCTACGTTAGAAGTATCTTAATTCCTTAATTCCTTAAATGCCTAATATCATAATTTTTATAGAGGATTTTC
GTGGATAAAGTAAAACCAATTTTATTTAAAATACTTATGGAATATAACTCTAAATTAGCAAGTAACTCTCCTAACGATGCATCAGAATCTCCTAATGCACATCAGAAGAGACTAACTTTCGGCAAGTGATTAAAAGTATTAGAAAGTTAAAAAAGTTCCACAAAAAAGTTATGTGAGCAGTAATAGGGTGAGGAAGTATACAAGATCTAAAAAAAGGACTGTATGTTAAGGTATCATAATTGCATTAATGTCTGCTTTAGAGGGAGACCCCTATATTTCGACTGGAGAGATTTTTATAGGTTCAGAAAATGTAAATTTCTCAGAACATGTAATTTAGATTTCTCAATTTTTTGAAAATCATACTTTTTCTGATAGATTGAGTATCAATAAAAACTCAAAATAAAAATATTCAATGAAAATATTAAATCAAATTTTTTACTATTAAGAAAAGCTTCTCTAAAAACAAACTAACTTTTTTAATAATAACATATATATAGTATTAATTCTATAACCAAACAACATTATTTTACCAATAAACAAAATAAAATTTTATTTTATTTTACTGCCTTGGATCTTGAATCTCTTTAATGGAAATCATGGGGTCTGGGGGTTATATAAACTTTCCAGTGGAAATACAGGGGTCTACTTTTTGTTTTTACTTTTCTCTTTGTGTTTTTTTCCCTAACTTCTCCATTATTCCAAACTTCTCCATTATTCCAAACTTTCTTAAATTTCCTAGCTTTTTCTGTTTTCTTTATCTTTTCTCACTTACTCAATGCAAACAATCTCAAATTTAAAAATCACTCTAAAGATTGCTCTAAAGTTGTCTCAACTTTGTAAACTTATTTGTTCACAGGGATTTTATTCACATAATTCTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTTTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTATTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTTAACCTACATTGGTTCTGGAACTCATAATTTTTTGTTTCAGCTATAATAAGCTAGAGAACATTGGTTTTTATGGCAGGTATTTAAGGTATAAATCTTTTCCAGTGGAAATACAGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATGACTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTTACCTAAAATTTTAACAAAAGAAGATCGGGAATATAGATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAATACTTAAGACTCGCCCGCAATTTTATCAGCAATTAGTAGAAAATGAGAGTTTCAGGCATTAACTATAAGAAAGATGTATCTTCTACCCCTTTCTCCTTATTAGCGGAATTTATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATTTTAGAAATCCTAAAATAAACTTTAGTTCCAGATATTGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTTCCCCTCTTTCTCTCTTTCCAAATACCCTTACATTAACCCCCATTTATAACCCTCTAAAATCCTTTGATGACTATTACAATAATGACCATTACAATAATTATTGAAACCCGCTAAAAGGTTATTATGTATTCAGTCTAAAATTTATCAAGCAGTTGTGGTTATAATTGTGCAACCATTTGAAAAGGAAAATCTAAAACATAACTCTAAAAACGTAGCTCTAAATACGTAATATTTAATAGATGTAGATTCGGAGGATTAAATTGGTTGCAGACTATTAAAATTCCTCCTGATTTCAGGTAGTAGTAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAAACATTTAAAAAACAGAGTTTATCAACTGTATTAATTTATTATATATAATTTGCATAGTAATATTACTATCAATTAGTTTGACGTGCAATGGTTCACATTATATTAATTATCTACGTTAGAAGTATCTTAATTCCTTAATTCCTTAAATGCCTAATATCATAATTTTTATAGAGGATTTTC
GTGGATAAAGTAAAACCAATTTTATTTAAAATACTTATGGAATATAACTCTAAATTAGCAAGTAACTCTCCTAACGATGCATCAGAATCTCCTAATGCACATCAGAAGAGACTAACTTTCGGCAAGTGATTAAAAGTATTAGAAAGTTAAAAAAGTTCCACAAAAAAGTTATGTGAGCAGTAATAGGGTGAGGAAGTATACAAGATCTAAAAAAAGGACTGTATGTTAAGGTATCATAATTGCATTAATGTCTGCTTTAGAGGGAGACCCCTATATTTCGACTGGAGAGATTTTTATAGGTTCAGAAAATGTAAATTTCTCAGAACATGTAATTTAGATTTCTCAATTTTTTGAAAATCATACTTTTTCTGATAGATTGAGTATCAATAAAAACTCAAAATAAAAATATTCAATGAAAATATTAAATCAAATTTTTTACTATTAAGAAAAGCTTCTCTAAAAACAAACTAACTTTTTTAATAATAACATATATATAGTATTAATTCTATAACCAAACAACATTATTTTACCAATAAACAAAATAAAATTTTATTTTATTTTACTGCCTTGGATCTTGAATCTCTTTAATGGAAATCATGGGGTCTGGGGGTTATATAAACTTTCCAGTGGAAATACAGGGGTCTACTTTTTGTTTTTACTTTTCTCTTTGTGTTTTTTTCCCTAACTTCTCCATTATTCCAAACTTCTCCATTATTCCAAACTTTCTTAAATTTCCTAGCTTTTTCTGTTTTCTTTATCTTTTCTCACTTACTCAATGCAAACAATCTCAAATTTAAAAATCACTCTAAAGATTGCTCTAAAGTTGTCTCAACTTTGTAAACTTATTTGTTCACAGGGATTTTATTCACATAATTCTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTTTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTATTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTTAACCTACATTGGTTCTGGAACTCATAATTTTTTGTTTCAGCTATAATAAGCTAGAGAACATTGGTTTTTATGGCAGGTATTTAAGGTATAAATCTTTTCCAGTGGAAATACAGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATGACTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTTACCTAAAATTTTAACAAAAGAAGATCGGGAATATAGATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAATACTTAAGACTCGCCCGCAATTTTATCAGCAATTAGTAGAAAATGAGAGTTTCAGGCATTAACTATAAGAAAGATGTATCTTCTACCCCTTTCTCCTTATTAGCGGAATTTATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATTTTAGAAATCCTAAAATAAACTTTAGTTCCAGATATTGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTTCCCCTCTTTCTCTCTTTCCAAATACCCTTACATTAACCCCCATTTATAACCCTCTAAAATCCTTTGATGACTATTACAATAATGACCATTACAATAATTATTGAAACCCGCTAAAAGGTTATTATGTATTCAGTCTAAAATTTATCAAGCAGTTGTGGTTATAATTGTGCAACCATTTGAAAAGGAAAATCTAAAACATAACTCTAAAAACGTAGCTCTAAATACGTAATATTTAATAGATGTAGATTCGGAGGATTAAATTGGTTGCAGACTATTAAAATTCCTCCTGATTTCAGGTAGTAGTAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAAACATTTAAAAAACAGAGTTTATCAACTGTATTAATTTATTATATATAATTTGCATAGTAATATTACTATCAATTAGTTTGACGTGCAATGGTTCACATTATATTAATTATCTACGTTAGAAGTATCTTAATTCCTTAATTCCTTAAATGCCTAATATCATAATTTTTATAGAGGATTTTC
ORB
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif AACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATT
Motif YTTTYYAGTGGAAATAMWGGGGTY
Motif CYTGCAWTGGWTC
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|