RefSeq NZ_CP008746.1
DoriC accession number aORI10010376
OriC length 1619 nt
OriC AT content 0.2471
The location of oriC region 4499553..0 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
CTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
CTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
CTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATCTATTTCTCACTTTTATAATTCAAAAAATTTTAAATTTACTATTTTTTTAAAGGTTTCTTAACTCTGTATATTTACATAATTTTAATTTTATCTTAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATGTAAAAATATTATAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCAACCTTCATTGGTTCTGGAATTCATAACTTTTTATCTCAGTTATACTAAGCTAGATAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTCATCCAAAATTTTGATAAAAGAAGATCCGGAATATATATTTTATCTGGCTTGCGAGGTATCTTAACACTTAAGATTCGCCCGCCATTTTATCAGTAATTAGTAGAAAATGAGAGCTTCATGTATTAACTATAAGAAAGATATATCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAAACAATAATGAAGTAAAATCTCAGAAATCCTAAAATAAATTTTAATTCCAGACATCGAGAGTTAAGACTTCGGAATTAAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATTTACAACTCCCCTAATCCCTTGATGATTATTACAATAATTATTTAAACTTGCTAAACGGCTATTGTAAGATCAATCTAAAGCTTGTCAAGTAGTTGTGGTTATAGTTGTCTAAGCATTTGAAGAGGAAACTCAAAAAAGAAACTCTAAAAAAGACAGCTCTAAAAAACATAACTCGAAAAATGTAGCCAAAAACACAATATTCAATAGATGTGGATTCGAGGATTAAGTTGGCTGCAGACTATGAAATTTTTCATGATATCAGGCAGTAGTAAAATGCTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCAATATTAGTATTACAAAAATAAAAATTAAAGTAATTCAAAGAAAAGGTAGACAGAGTTTACCAACCATGTCAATTTATTACATAATTTATTTAGTAAAATTACTGTATCAATTAGTATCAATTAGTTTGACATGAAATGATTTGCATTGTATTAATCATCTGCGTTAGAATTATCTTAATTCCTTAAATGCTTAACATTATAATTTTTATAGAGGATCTTC
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif ATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACAC

StartP-valueSite
13491.34e-20AAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACGAAAAAATCA
13051.34e-20AAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAA
12611.34e-20AAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAA
12171.34e-20AAAACACTAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAA
11731.34e-20AACGTTTAAAATTAAAAACGTTTAAAATTAAAACACTTAAAATTAAAACACTAAATTAAAA

Motif YTTCCAKTGGAWATAWWGGG

StartP-valueSite
3791.31e-12GTCTAAATCTTTTCCAGTGGAAATATGGGGGTCTTTACCA
2561.41e-10TTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGAAAGGGTTTAAATTCA
4281.45e-09ATACGGTGTACTTCCATTGGATCTACTGCAAATATAGCTT
3501.63e-09TAATGTTGGTTTTTTGGTGGATATTTAGGGTCTAAATCTT

Motif CYTTCYTYTCWTTHTCTAWTTTCMTAGBTTTTTHYAT

StartP-valueSite
643.15e-15ATTTCCTTAACTTTCTTTAATTTCTCTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTCTTTTATC
94.57e-15CTTTTATAACTTCCTTTCCTTTTTTAATTTCCTAGCTTTTTCTATTTTTTTTAAT
6379.28e-15TCTTCTATCCCTTTCTCCTCATTATCAGGATTCATAGGGTTTTTCATAAAGGTACAA
7702.86e-14AAGAGTTTAACCTTTCTCTCTTTCCCTCTTTCCAAAGTCCATTACATGAATCCCATT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010376 100.0 1619 0 0 1 1619 1 1619 0.0 2990
aORI10010291 99.876 1618 1 1 2 1619 653 2269 0.0 2976
aORI10010290 99.926 1348 1 0 2 1349 653 2000 0.0 2484
aORI10010290 98.163 490 6 3 1132 1619 1738 2226 0.0 852
aORI10010289 86.618 822 87 19 179 979 863 1682 0.0 887
aORI10010025 86.618 822 87 19 179 979 1303 484 0.0 887
aORI10010382 89.352 432 45 1 180 610 1013 1444 0.0 542
aORI10010380 84.258 559 74 13 179 730 147 698 0.0 532
aORI10010381 88.194 432 50 1 180 610 990 1421 0.0 514
aORI10010277 76.654 514 106 14 195 700 1635 1128 0.0 272
aORI10010379 75.182 274 61 7 242 511 816 1086 4.46e-29 122
aORI10010378 75.182 274 61 7 242 511 784 1054 4.46e-29 122